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      sdpR_1 2216230 .. 2216246 + -10.9  -5.61596   AATGAATTATTCAAT              GAAGCTG AAC CAGCTTC              TTTTTTTATGAAAGT 100 194
BkAM31D_12105 2217431 .. 2217470 +  -9.3  -3.97674   GATGGTTATATTATC  GTGATAGCGCGTAAAGG GATTAA CCTTTACGCGCTTAAAC   TTATTTACCTGGTCG  83 193
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      swrC_2 2222346 .. 2222385 + -10.2  -5.10767   CAACTCATGAATAAC  AATCAAAAGAAGAGGAAC AAAT GTTCTTCTTCTTTTGCTA   TTTTTATATTCGGTC 100 27
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BkAM31D_12185 2232304 .. 2232323 +  -5.7  -5.28683   ATACCAAAAAGAAGA            GTCTGCA AATTAA TGCAGGC             TTTTTTCATATTGAT  86 13
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BkAM31D_12195 2233562 .. 2233582 +  -7.6  -5.39221   ATTTAATGGATGAAA            GCAAAGGT CTTGA GCCTTTGC            TTTTTTCATTGTTAT  95 35
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     cspLA_2 2237472 .. 2237507 + -17.2  -4.07568   CAAAAAGTATAAACG    TAACAAAAGCGAATCT GAAA AGATTCGCTTTTGTTG     TTTTCAAGGAAAGGC 100 29
BkAM31D_12225 2238114 .. 2238152 +    -9  -5.42259   ATTCTATTCAATAAT   AAAGGTATAGAATAGGTT AAA GACCTACTCTATGCCTTA   TTTTTTTAACAGTCC 100 27
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BkAM31D_12240 2239772 .. 2239808 +  -9.6  -3.68351   TGGTCGGAAACAGAA    CGGAATAAGCAACT TTATACTTT GGTTGCTTGTTCCG    TTTACGTGATAAAGG  81 18
BkAM31D_12245 2241801 .. 2241833 + -12.1  -3.04415   AATAATATTTAATAG      GAGGTTGTCTGCGAA TAC TTGGTGGACAACCTC      TATCATTTCCTCCTG  85 36
      gltC_1 2245476 .. 2245499 +  -7.4  -4.90477   TTAATTTAGATGGAG          CACGTCGGAT GAAG AATCGACGTG           TTTTCATTTTTTCTA  85 76
        cysJ 2247546 .. 2247561 +  -5.4  -3.18404   ATGCAACAAGAAAAA              CGTTAC CAAC GTGACG               TATATTGAGTTTTCA  55 2
        cysI 2249321 .. 2249339 +   -11  -5.55698   ATGCATAATAAAAAA             GGCGGGAA TTA TTCCTGCC             TTTTTTTGCGTTGTA 100 33
      yflN_2 2250433 .. 2250452 +  -4.4  -3.91858   TTTATTTTAAGGTCA            GTTTCATTG ATG CAA-GAAAC            TTTATCCGGTATCTC  59 152
      ytpB_1 2252159 .. 2252186 + -15.8  -3.23708   CGAAGAGCATAAAAA        TTAATCCGGAGT ATTT ACTCCGGATTAA         TCATTTTTAACAAGG 100 29
        xerS 2255090 .. 2255138 +    -4  -3.37634   TTAATAAACAAAGAG TTCTCTTGTCTCATATCCA-AAG TATA CTTATGTTTTTGAGACGGGAGAA ATTTTTGGGATGGTA  50 97
      yrbG_1 2256481 .. 2256510 +  -2.7  -4.86954   ATACATTTGGCAAGA       TCCACCCAGCTTC TCTA GAGTAAGGGTGGA        TTATTTTTTATTGTT  67 327
      sspH_1 2260104 .. 2260135 + -14.7  -3.45366   CTAACAAAAAGGAAA      TAAGACAGTCAAG AAAATC CTTGACTGTCTTA       TTCATTCATTCGAAC 100 383
BkAM31D_12370 2270392 .. 2270404 +  -2.7  -4.90918   CCTCACCTTTGGCAT                TTTCA CGC TGAGA                TTTTCTTCCTTTTAT  67 346
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BkAM31D_12475 2287973 .. 2287997 +  -7.9  -3.90738   CAAATAGATCAAAAA          GGAGATCCATT ATG GATGTATCTCC          TTTAGTCATTATTTG  74 353
BkAM31D_12520 2297763 .. 2297803 +    -7  -3.15581   TATAAATAATATAAA  TGGCTTCTAAGCAACC CTTCTTTTT GGTTGCTTAGAAGAAA  TATATCTTGCTATTT  63 45
     kstR2_4 2301778 .. 2301792 +  -5.7  -2.71139   ATTTTCTTACACATG               CTTGG AATAC CCAAG               TACATTCTATTTTGA  51 275
     cspLA_3 2302232 .. 2302251 + -12.2  -6.11392   AATGAACGTTATAAA            GGACTCTC AAAT GAGAGTCC             TTTTTTTATTTATTT 100 39
BkAM31D_12560 2303531 .. 2303574 + -14.2  -4.36595   CATATAATAAATAAT GAAAGGATGAC-TAGAAGGTT CAA GGCTTTCTATGTCATCCTTTC TTTTCACTTTACATA 100 27
      tlyC_1 2306377 .. 2306430 + -15.1  -3.93984   ATTCACTTTGTTTTT TTGCTAAGGAATGTATGAATAGT ACTCTAAA ACTATTCATACATTCCTTACTAA TTTATACATACCTTT 100 52
        nsrR 2307375 .. 2307386 +  -4.4  -2.79671   CTAATTCTTCATTCT                CGTA GATA TACG                 CTTTGCCATTAACAT  48 306
BkAM31D_12615 2312995 .. 2313019 +  -8.7  -5.07486   GAATGAACGTAAAAA          GGATTCTTC TTATTGT GAAGAATCC          TTTTTATTACCGGTA 100 92
BkAM31D_12625 2314273 .. 2314287 +  -2.8  -2.71731   ATTCACGAACGATCG               TCCTAC TAC GTATGA               TAATTCGAGAATGAA  41 136
BkAM31D_12630 2315486 .. 2315512 +  -9.5  -5.15969   TAAGCTATTCTTCGG         TGAAAGCGGGG ATCTC TCTCGCTTTCA         TTTTTTAAATTAAAA 100 38
     hemH1_2 2315985 .. 2315995 +    -4   -3.5394   CAAGAAGAGATTTAA                 CAAA AGA TTTG                 TTTAACAAAGGATTT  52 26
BkAM31D_12640 2316357 .. 2316389 + -12.2  -4.72729   AGCTGAAATTAACTA     GAGGATGTCCGCAAG TGGC TTTGC-GACATCCTC      TTTTGCTTTTGCTTA 100 35
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    sasP-C_2 2324851 .. 2324878 + -15.8  -3.93288   AATAGCTATGGAATA        GCAGTTTGAATC AATT GATTCAAACTGC         TTTACTTACATAAAG 100 75
BkAM31D_12695 2325787 .. 2325799 +  -2.7  -3.64682   CGACGGTCGCCTGAC                TAGTT CCT AACTG                TTTAGCGATTTGATA  49 194
BkAM31D_12710 2328974 .. 2328992 +  -2.4   -5.0916   AAGAATTCAACCTTA             AAGAAGAG TTT CTTTTCTC             TTTTTATATTAGACA  69 177
BkAM31D_12715 2329627 .. 2329669 +  -4.6  -4.35644   TCTATTATTTAAACA TTCTTCACCTTTAGCAT-AAT AGGC ATTCATGC-AA-GGTGAAGAA TTGTTTTGTGATCAT  63 61
        fas6 2331463 .. 2331493 + -11.2  -3.14602   GGAACAACAAAATAA       GAGCTAAGCCGA ATATCTC TCGGCTCAGCTC       TATTAATGCGCTGAA  80 19
BkAM31D_12765 2337406 .. 2337442 +    -6   -5.1925   ATAAATAATACTTGA   ATGATCGAGG-AGC-TCT TAC AGATGCTACCTCGGTCAG   TTTTTTACATTATAG  83 33
BkAM31D_12770 2338243 .. 2338262 +  -3.6  -3.46913   AACGCTCAAACGTTC            GTTCCA ATGCACTA TGGAAC             TTATCGATTATCTAT  52 76
BkAM31D_12775 2338867 .. 2338913 + -15.7  -2.63182   AACCAAAAAAAAGAG TAAATAAAGGCATTGAAAAAGG GAAT TCTTTTTCAATGCCTTT-TTTA ATGATTTTTTCAATC 100 23
        gabP 2341423 .. 2341433 +  -5.4  -2.52516   GATTTGTTAAGTACT                 TACG CAT CGTA                 CTTGCTAGTGCAGCC  50 119
        acoD 2348331 .. 2348361 +  -7.8  -3.87104   ATCTACTAGTGACAA      GTATGCTTGC-TA CTTCTT TATGCAAGCATAC       TTATTCTACTATGAG  74 50
BkAM31D_12830 2348734 .. 2348774 +   -10  -4.84359   GGAACGGGCCCAATT AG-AAATCCCACGAAAGTT ATAG AACTTTTGTGGGATTTACC  TTTTTATCACAGTCA 100 4
      ghrB_4 2352610 .. 2352646 +  -8.3  -5.55698   CCACTACATAAAAAA   GATGACTTAA--CCGGT CTGAC ACCGGAATTAAGTCATC   TTTTTTTCCCTTATC 100 55
BkAM31D_12860 2353645 .. 2353677 +  -8.5  -4.66814   AAGGATAAACAAAGT     TAAGGGGGCCTCTC GCTAAA GCGAG-CCCCCTTA      TTTATTATTTATCTT  88 23
      hrp1_1 2374012 .. 2374030 + -11.8  -3.02461   AAACAAATAAAAACA             GGTTGGAA ATG TTCCAACC             TGTTAAGCCAAATTA  83 115
         fsr 2375701 .. 2375740 + -22.5  -3.77196   ACAACCAAAAATAAA  GAGCTGATTCAAGAGGT AGTACA ACCTCTTGAATCAGCTC   TTTGATACATCGTAA 100 27
BkAM31D_13050 2380272 .. 2380284 +  -3.4  -3.88559   AATCGCATTGAATTC                TCGT CCAAT ACGA                TTTGTCAGAATGCTT  55 331
BkAM31D_13070 2384874 .. 2384910 + -13.9  -4.05788   AAACAGCTTAAAAAA    GCCGCTGAAAAAGAG AGATGAC CTCTTTTTCAGCGAC    TTTCCTTTCAGCCCG 100 39
      actIII 2394030 .. 2394056 + -12.4   -3.0568   CCGTAAATTGATTTA         GCACCTGCTA ATCCTTG TAGCAGGTGC         GTTTCCTTTCAATTC  85 35
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        mshB 2416493 .. 2416528 + -11.4  -5.54192   TTCACCTAATCAAAA    GCTTTCTCGAAAAGTTA AAT TGACTTTTCGAGAG-GC    TTTTTTTCAATTCCT 100 32
BkAM31D_13260 2417149 .. 2417162 +  -3.8  -3.10975   GAAATGATTTAAAAG               GGTC ATATTC GACC                TCTTGGGTCATACAT  47 42
BkAM31D_13265 2418273 .. 2418305 +   -10  -5.67967   TGAGATTATTTGGAA      TGATTCAAAAGGTC ATATC GACCTCTTGGATCA      TTTTTTTGTCATGCT 100 151
BkAM31D_13280 2421693 .. 2421703 +  -8.2  -3.82923   TACCTTCATGAATAA                 GGGC TTT GCCC                 TCTTTTAATTGAATT  75 265
BkAM31D_13290 2422098 .. 2422133 + -19.3  -4.63928   CCTTTCTAATAAAAA    GAGCTGAATTAGAGG TCCCTC CCTCTAATTCAGCTC     TTTTTCAACTGCTAT 100 46
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      yheS_2 NONE
BkAM31D_13315 2427788 .. 2427798 +  -5.4  -3.02461   TAAATAGTGAGGGTG                 GTCA ATA TGAC                 TGTTCGGACAGCTTA  53 89
      yicL_1 2428712 .. 2428722 +  -6.8  -4.59946   GCTTCTTAAAGCATT                 CGTC TCT GACG                 TTGTTTTCTTCTTTT  78 32
BkAM31D_13345 2434797 .. 2434829 +    -7  -4.76312   AAATGGGTAGCTATG      ACCTTGAGAGGAGT AAATC ACTCTACTCAAGGC      TTTTTAGCTATTCTC  83 82
BkAM31D_13355 2435557 .. 2435598 +  -4.5  -2.69489   GCATAGACAAGCAAA GCATATACTCTCAACA-CAA CAT TTGCTGAGGTGGGTATATGC TAGCTTTCATCCTTC  47 59
      mntP_1 2436253 .. 2436284 +  -8.8  -5.38958   GCTAATAAATAAAAA      CAGATCCACTTAAC AATC GTTAAATGGACCTG       TTTTTATTTATAACT 100 168
      cotI_1 NONE
       cotSA 2440591 .. 2440632 + -19.1  -3.14683   GAAGAAATAATTAAT AGGATAAAACCTTTCCTTA TCAC TAAGGAAAGGTTTTATCCA  TTCATGAAACAATCT 100 27
      gtaB_2 2443867 .. 2443893 +   -11  -3.86684   TAATCATTAAAAAAA         CAGGTTCAAC CACTTCC GTTGAACCTG         TTTGCTATAAATTCT  89 31
BkAM31D_13400 2444460 .. 2444497 + -14.3  -4.72127   ATACAGCTTAATAAC   AAAGAAAGGCAGGAATC ATTA GATTCCTGCCTTTCTAC    TTTTATCTATTATCT 100 30
BkAM31D_13420 2446570 .. 2446587 +  -8.5  -4.08216   AGAAAAAACAAAAAA             CGACTAA ATTA TTAGTCG              TTTTGAAAGCGATCA  79 19
BkAM31D_13460 2450832 .. 2450855 +  -3.9  -5.63517   TCTTTGATTTGTAGT          GCGTT-ACCT ATATA GGGTTAACGC          TTTTTTATTTGGAGA  85 27
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BkAM31D_13470 2451486 .. 2451530 + -14.7  -2.81178   GTTCAGTCTTAATTA GAAATTAAAAAGACCTCTA AAAGAGA TTGAGGTCTTTTTAATTTC ATTTCAAATTCATTA 100 49
BkAM31D_13575 2465559 .. 2465587 +  -5.5  -3.84901   CAATGCTACAGCACA       GAAAAGGAGTAA CCTCAA TTAC-CCTTTTC        TTCATTTTTCCTCAC  63 14
BkAM31D_13700 2481183 .. 2481218 + -23.6  -4.41087   GCACAACAACAATAA    GGATCCCTAAAAGGTC ATAT GACCTTTTAGGGATCC     TTTATATTTCGTTCT 100 400
BkAM31D_13715 2483810 .. 2483824 +    -5   -2.8194   CTTCCACGCCAATAT               CAGAAG GAA TTTCTG               TATCATGACTAATTC  50 258
BkAM31D_13725 2484694 .. 2484704 +    -4  -4.39386   TTATAGCCAGCTTCT                 GATA ATG TATC                 TTTTAGTAATTTACG  64 419
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BkAM31D_13755 2488984 .. 2489016 + -14.4  -4.01786   ACCCTACCTTTCTTT      CAATCTCTCGTATT CTAGT AATGCGAGAGATTG      TTTCATATTCTATTT 100 354
BkAM31D_13780 2492357 .. 2492388 +  -8.8   -3.2352   AATGCAAGTAGAAAA      CCCTGCTA-GAGATT AAT GAACTCATAGCAGGG      TTGGATTAGCTTTTC  71 55
BkAM31D_13840 2502891 .. 2502925 + -10.3  -4.93595   GATAACAATATGGAA    GGCAATGTTAAGGGATT TGA AATCCC--AACATTGCC    TTTTTACCTTTTTAT 100 36
BkAM31D_13875 2508201 .. 2508236 + -13.6  -2.57092   CCACTAATGAACAAA    GACTCAAAAGGTTA AATCCTAC TAACCTTTTGAGTC     TAGCTTACTCCCCTT  91 34
        sspP 2508693 .. 2508706 +  -2.3  -3.39154   ATTTCCCTTTCAGCA               CGCAG TTGC CTCCG                CTTTCTTCTTTGTTC  46 109
        selD 2512131 .. 2512162 + -13.8  -5.86332   TACGATAAAAAATGA      CACCCCGTTTGTTG ACTT TAACAATCGGGGTG       TTTTTTTTAGGTTAA 100 82
BkAM31D_13970 2524907 .. 2524939 + -10.8  -4.04326   ATTGTAAGTAACACA      TAATAAAACTCGTC AGTTA GACGAGCTTTATTA      TTTCCTCTTTCATTC  89 208
BkAM31D_14010 2534899 .. 2534928 +  -4.3  -5.49579   CTCTACTAAACCGAA       CACCTCTCCATTAT TGA AAATTGGAG-GGTG       TTTTCTTTTTTGTAG  84 32
      lytC_1 2535803 .. 2535820 +  -4.2  -4.42788   AATACACCTTCTACC             TGAGAA AACTAA TTCTCA              TTTTCTCAGGTTCAG  66 146
BkAM31D_14020 2536577 .. 2536612 +  -5.6  -4.79756   ATAACCACCACTCCT    TTCTAGTTTACATAAT AAAA ATAAAGTAAACTGGAA     TTTTTACCTTGTCTG  75 170
BkAM31D_14025 2537718 .. 2537752 +  -8.7   -4.5442   AAAAAAATGTAAAAA    CCCAACAAAGC-TGTC ATTT GATATGCTCTGTTGGG     TTTTATCATTCAAAG  90 42
      emrB_5 2550020 .. 2550031 +    -3  -2.96899   GTTGCATTTATTCCT                TTCA TATA TGAA                 TGTAATTCGTTAGAA  43 114
BkAM31D_14095 2550637 .. 2550653 +  -5.1  -2.71422   AGCTAACTTCTCAAA              CTCGC AAACAGC GCGAG              ATGTTTATGGACATG  49 48
BkAM31D_14100 2551410 .. 2551441 +  -9.6  -4.18018   ACAATCTTAAACAAT      TAGGAGATTTCCAT ATAA ATGGAAGTCTTCTG       TTTTAAATGGAACCA  85 45
BkAM31D_14120 2555551 .. 2555571 +  -2.5  -4.40963   GCATTTGGAACATAT            TGTACTTTC ACA GTAAGGACA            TTCTTTTTGAACACT  60 200
BkAM31D_14130 2556452 .. 2556464 +  -3.4  -3.04501   CTGCAAACGATTAAC                CACT TTTAC AGTG                TCTTCAAACGTTCCT  45 258
BkAM31D_14145 2558150 .. 2558169 +  -4.4  -4.19577   ATTCACTAGTGGAAG            CCGTTAATA TTA TA-TAACGG            TTCTTTTAAGAATTG  63 19
BkAM31D_14150 2558522 .. 2558546 + -15.8  -4.37554   ATAAGCTTCAACATA          CAGGCGTTGC ATACA GCAACGCCTG          TTTCTGTTTCAGTTT 100 37
BkAM31D_14170 2561034 .. 2561067 +  -9.6  -3.72051   CATAGAGGTTCAAAA     CGCCCACTCCTA AAAATCACAA TAGGAGCGGGCG      TTTCCCCTTATTACA  81 36
BkAM31D_14180 2562309 .. 2562319 +    -4  -3.88498   AGAACCTGGTTTCAT                 TGAT TGG ATCA                 TTTCCTCTGTAACAA  56 458
BkAM31D_14200 2564210 .. 2564251 + -12.5   -4.4767   GCAATACAAAGAAAA GAGGTTGTAAAAAAGGGTT AATA AGGCCTTTTCTACAACCTC  TTTTCTGCTAAATCC 100 41
        lexA 2574095 .. 2574130 + -10.7  -5.67967   AATGTAAAAACATGC    TAGTAGTACAAACAA AGATCA TGGTTTGTACTACTA     TTTTTTTATACTAGT 100 60
BkAM31D_14260 2575969 .. 2575998 +  -7.9  -4.70626   GAATAATTTTAAAAA       GAGTAAAGCCCTC AAAG GAGTCCTTTACTC        TTTTTAAAATTATTC  84 35
BkAM31D_14295 2583431 .. 2583447 + -12.3  -3.97444   TACAAAAAAGAAAAA              GCGCTCT AAT AGAGCGC              TTATCTTTATTCACT  93 17
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BkAM31D_14370 2600755 .. 2600796 +  -7.4  -3.97307   TTCTTATCTAACAAA CCGCTAAAAG-GAGGGATC ATATA GATCCCCCTCTTTTAATGG TTCTTGTTGCATGAA  71 30
BkAM31D_14925 2706495 .. 2706524 + -10.9  -5.56568   TCATTCAACACAAAA       GAAATGTCCTC AAAAAACG GAGGACATTTC        TTTTTTTACTCATAT 100 41
        rpmB 2718525 .. 2718541 + -12.3  -5.27477   TTAATTAACAAAAAA              GCACCGA TAA TCGGTGC              TTTTTTGCTTACCCT 100 86
BkAM31D_15070 2737537 .. 2737591 +    -8   -5.0925   AACTAAAATAAAAAG GCAGTCTGTCTCTTAAA-GTTCCCT ATCAAA AGGGATCCTTTAATTGACAGCCTGC TTTTTACTTTTCAGC  93 30
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BkAM31D_15345 2789604 .. 2789635 +  -8.2   -3.7511   CGTATACTCTAAAAA      CCCACAAAAA-ATCT ACG AGACATTTTTGTGGG      TTATATTATAAACAC  74 42
        ylbJ 2792856 .. 2792882 +    -3  -4.59773   GGCTTCTTAATGAAA         CTACAGTGCTTA TAT TAATTGCTGTGG         TTTTTACAGCTGCAA  62 31
BkAM31D_15390 2794909 .. 2794939 + -12.9  -4.68424   ATAATAGCTAAAAAA       GAAATTGTTTGAA CTCAC TTCAAACAATTTC       TTTTTCCCTCAATTA 100 37
BkAM31D_15405 2797146 .. 2797175 +  -9.5   -5.8187   AAAAACAATAAAAAA       CTGATCTAAAAAT AAAC ATTTCTAGATCAG        TTTTTTTATTAACTA 100 30
      rimK_2 2799950 .. 2799961 +    -3  -4.54821   CCTTATGCTCCAATT                TGAA AATG TTCA                 TTTTATCATTCCACT  62 467
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BkAM31D_15450 2803276 .. 2803314 + -23.6  -4.53349   GCATAACAATAAGAA   GAAAATAAGACAACAAGG ATG CCTTGTTGTCTTATTTTC   TTTCTTTAATCGTTA 100 35
BkAM31D_15460 2805001 .. 2805028 +  -9.9  -5.67967   ATAAAGAAAGAAAAA        CAGGGGAATCA TTCGAT TGAATCCCCTG         TTTTTTTCTAATGCT 100 43
        ctaA 2815964 .. 2816009 + -18.7  -2.97109   TTTATTATTTATACG TAGTAAAAGAAGGTTGAAGAG AATT CTCTTCAACCTTCTTTAATTA GTTTAATTCAATTAG 100 96
BkAM31D_15535 2821752 .. 2821787 +   -15  -4.54047   GATAAGTACAAAAAA    GGGTGACTTAAAGA GCACCACA TCTTTAAGTCACCC     TTTTATCTACAATAA 100 44
BkAM31D_15550 2824087 .. 2824122 + -10.6  -5.30616   GCCGTTGAAAAAAAA    GAGAGCGATTGG-AGTT AAT AACTACCGATCACTCTC    TTTTTATTTAGCTAC 100 8
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BkAM31D_15585 2829905 .. 2829943 + -14.8  -5.15117   CGCAGGCTTTTCAAA   CCCCAAAGAAGCCT AAACGCTGCGC AGGCTTCTTTGGGG   TTTTTTCACATTTTG 100 148
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        def2 2846843 .. 2846860 +  -4.1  -5.69262   CTAATTTGAAAGGAT             GACCC TGCTTTTT GGGTC              TTTTTCTTTTTATCC  85 24
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      rnjA_2 2849088 .. 2849104 +  -9.4  -5.40464   TGGAAGTTTAAAAAA              GGAGGC AGATA GCCTCC              TTTTTATTTATCATC 100 30
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        deoD 2871706 .. 2871723 +  -7.7    -4.431   GAAATAATTGAAAAA             GACACCG TAAT TGGTGTC              TTTTGTCACTAAATA  82 34
        aroK 2881249 .. 2881282 + -18.5  -2.86806   CATTGTTAATTAACA     CAAAGAGACTAATGA ATGT TCATTAGTCTCTTTG      TAATTCTAGCTTAGT 100 73
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        sugC 2888846 .. 2888876 + -18.5  -3.85698   TTCGTTAAAAATAAA       GCTGACACAGATC ACGTA GATCTGTGTCAGC       TTTGTGCAGAAAACG 100 33
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BkAM31D_16180 2952440 .. 2952473 + -16.3  -2.88945   GTAATGAAATGTTAA     GAGGATGAAAAAAGT AAAT GCTTTTTTCATCCTC      ATTCTTATCAATCAA 100 77
      yciC_4 2955375 .. 2955411 +   -14   -3.9392   AGGTAACTATAATTA    TTTAAGTCTGTGATCA AAATG TGATCACAGACTTAAC    TTCTTTAGAATAAAA 100 401
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BkAM31D_17275 3137495 .. 3137523 + -12.6  -3.87354   ACCGAGGAATAGAAA       TGAGGGTGAGTCA AATT TG-CTCACCCTCA        TTTCCTATACATTTC  95 29
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BkAM31D_17315 3143588 .. 3143615 +  -4.8  -4.86133   ATTGTAAAAGGAAGA        AGGTGAGCC-CAA ATA TAGAGGCTCACCC        TTTTTCATGTATCTA  74 299
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BkAM31D_17375 3155270 .. 3155319 + -18.3  -5.77632   ACTTAAAGTACGCAA GACCTTTTTATGAGAGTCTTT ATTTTGGG GAAGACTCTCATAAAAGGGTC TTTTTTTGTCATTTT 100 236
BkAM31D_17385 3156345 .. 3156376 + -17.5  -3.58343   TATCCAATAATAAAA      GAAACACCACCGA GGCTTA TCGGTGGTGTTTC       TTTAACGCTAATCGC 100 31
BkAM31D_17395 3157225 .. 3157253 +  -2.4  -2.69057   CATTTTTTATACAAC        GTACCGCATGAA AAGTC TTCGTACTGTAC        ATATTATCTTTACAA  40 52
BkAM31D_17400 3157450 .. 3157477 +  -5.6  -4.59212   CGTAAACATAAAAAA        TCTGACCCTCTA TTTA TAAATGGTCAGA         TTTCTTTCATTCATT  73 36
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BkAM31D_17415 3160863 .. 3160899 + -21.2  -3.40382   GTACCAATGTCTTAA    TAAATGAAGGGTGGCT CACTT AGCCACCCTTCATTTA    TTATAAAATTTGCTG 100 26
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BkAM31D_17465 3166273 .. 3166285 +  -4.8  -4.15565   GGGATCATCTCAAAT                GGTC TGTTT GACC                TTTTGAGATGATCCC  63 40
        coaA 3169652 .. 3169694 +   -21  -3.59979   AAAAAAAATGTAAAA GAACCAACAGAAAAAGAG TGCCTTT CTCTTTTTCTGTTGGTTC TTTGCAATGCGCGGA 100 28
      sleB_3 3170764 .. 3170786 + -12.1  -5.76633   TAAACAAAGGCAGAA           TCCGCTTAG ACATG CTAAGCGGA           TTTTTTTGTCTATGA 100 61
BkAM31D_17490 3172044 .. 3172064 +  -4.7  -4.26003   GGGTTATTATTTGAA            AAAGAAGGG TAA CCCTTTTTA            TTTATTAAATATTGT  65 14
       cca_2 3174659 .. 3174688 + -13.8  -5.60993   TTTACCTTGCACAAA       CAGAGTGAAAAC CTTTTT GTTTTCACTCTG        TTTTTTTATAACCCC 100 41
        msrR 3177167 .. 3177202 + -14.1  -3.76169   GAAGATAAATAAAAA    GACTGACCTTCGTCT CTGATC GGACGATGGTCAGTC     TTCTCTTAGTCTTGA 100 29
BkAM31D_17520 3179925 .. 3179962 + -17.4  -3.57387   AAACAACTTATCTAA   TAATAAGAACGCTAAC GATTAA GTTAGCGTTCTTATTA    TTTAAAAAATCTATT 100 4
        prfC 3183541 .. 3183582 + -21.8   -3.3506   TTAGACAAAATAGAA GGGGTGTCTCACAAAGTC TTCTTT GACCTTGTGAGACACCCC  TTCTACAGATTTACG 100 42
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BkAM31D_17630 3199441 .. 3199460 +  -3.6  -4.22041   ATTTCAGTAATAATT            TTGCTACT CACT AATAGCAA             TTTGTGTTACCCTTT  61 68
BkAM31D_17635 3199974 .. 3199992 +  -8.9  -6.08342   GGATTTCGTTATTAA             CTGCTGA TTCAT TCAGCAG             TTTTTTTATTTATTC 100 26
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BkAM31D_17655 3202145 .. 3202187 + -15.9  -5.11836   ATGGTAATAGCTTCG GAGG-CGTCTCAAAAGGT AAAATTAA ACCTTTTGAGACGTCCTC TTTTATTTTCACTAT 100 71
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BkAM31D_17695 3209641 .. 3209679 + -11.2  -5.43553   TTGTTTTTGTCTACA   AAAAAGATTCAAGAGGTT TTA AGCCCCTTGAATCTTTTA   TTTTATTTTTTGAGT 100 46
BkAM31D_17710 3212121 .. 3212152 +  -2.4   -5.7946   AATAACACATGGAAA      GTGTCTCAAAAGT CAAGAAA GCTTT-GGGACAC      TTTTTTTGTTAGGAA  83 36
BkAM31D_17715 3214040 .. 3214075 +  -9.9  -4.10552   AGTAACATTTTAAAA    GGTGAC-AGTAAGGAT TACAT ATCCTTTCTAGTCACC    TTTCATTTGCTAGAA  86 36
BkAM31D_17795 3237998 .. 3238023 + -10.5  -5.47399   ACAACGGCAAAAAAA         CTAGCTAGAGA GGAC TCACTAGCTAG          TTTTTTTAAAGTTAA 100 55
      ptsH_2 3239098 .. 3239141 + -13.3  -4.42062   TCCACATATTACTTC GAGGGCGTCTCCAAAGGT AAAAAGTAA ACCTT-GGAGACGCCCCC TTTATTTACGCAATA 100 156
BkAM31D_17830 3242672 .. 3242705 + -14.9  -4.95957   AACTAGTCAAAAAAA     CAGACCTTTGTT-CAT GAA ATGCAACAAAGGTCTG     TTTTTCGTTAATTTA 100 39
BkAM31D_17885 3252750 .. 3252762 +  -4.1   -2.9186   TGTATTCACTATTCG                GCTTT AAA AAGGC                TCTATGCAGTTCACT  47 368
BkAM31D_17895 3254447 .. 3254459 +  -4.9  -4.20883   CTCAAACTTATCACT                TACTT TAT AAGTA                TTTTGCAGCTTTTTA  65 280
BkAM31D_17900 3256065 .. 3256081 +  -2.3  -3.10464   CGATTGTAAGGAGGC              TTTGACA TGC TATCAAA              TATTGGCATTCCTGG  42 47
     tatAd_2 3256315 .. 3256346 +  -8.9  -4.16443   ATTAACGTAGTAAAA      GATGCAAGTAGAT CTTTTA ATGTACTTGCATC       TTTCTCATTTCATAT  81 36
BkAM31D_17910 3256927 .. 3256937 +    -4  -4.57304   ATCTGTTACTTTTAT                 CAAA ATG TTTG                 TTTCTTTCGTTGCAT  66 376
      yhdN_1 3273055 .. 3273098 + -18.6  -3.61988   GCTCCGCTTAAAGCT GAGCCTATTAAAAAAGGT AAAGGGCG ACCTTTTTTAATAGGCTC TTACTTTGTCCATCA 100 171
BkAM31D_18145 3296974 .. 3297003 + -11.7  -3.78934   ATAACCTTTTCCGGT       GCTTTTCGAATGAA GCC TTCATTCG-AAAGC       TTCTTGTCAACACGC  91 193
BkAM31D_18165 3300198 .. 3300222 +  -7.2  -4.39998   AATCAAAAATAAAAA          GCTCTCTTTC AAGTA GAAAGAGAAC          TTTATTCTGTCGGTG  79 49
BkAM31D_18215 3310880 .. 3310911 +   -19  -3.48395   GAAGAAATAATACAA      TTAGAAGGCTTCGT GCAC ACGAAGCCTTCTAA       TTGTATAAAAAAACT 100 31
BkAM31D_18310 3332474 .. 3332502 + -10.3  -4.01646   AGCACCAACAAAAAA        CGTCTCCACCTCA TCA TAAGGTGAAGACG        TTGCTTTTTTATGTA  89 7
      gerE_3 3340627 .. 3340659 + -11.4   -2.7186   TTTAGTCGTCTTTTA     GAGT-GGAGGGCTTA TATT TTAGCCCTCCTACTC      TCATTGCAGAAATTT  81 86
BkAM31D_18395 3346768 .. 3346821 + -21.6  -3.99678   AAAGACTCTCTAAAA TAAAACAAGACTTATCG-GCTACTT CAAGT AAGTAGCTCGATAAGTCTTGTTTTG TTTAATTATGAAAGT 100 23
BkAM31D_18445 3356778 .. 3356815 + -12.9  -3.39895   TTTTCAAGATGAAAA   GGTTGTCTG-AGAAGCCC TTT GGCCTTTTACAGACAACC   TTGCTTGCTACCACC  93 52
        sspI 3369622 .. 3369666 + -21.7  -5.63103   AAAGCTCAAAATTTC GGGGGCGTTTTAAAAGGTTAA AAC TAGACCTTTTGAAACGCCCCC TTTTTTTAGTTAAAA 100 103
        ysdB 3371966 .. 3372006 +  -9.1  -5.76237   ATGGCTAGCAAAAAA GGTGTGTACC-ACAGGTC TATTTT GACCCATTGGTACACACC  TTTTTTATTTATATC 100 97
        ytrH NONE
        ytrI NONE
BkAM31D_18725 3411437 .. 3411477 + -21.5  -4.63107   GGACTCTTCCTATTT  GAGGGAAAGAAGATTTCGT TAC ACAAAATCTTCTTTCCCTC  TTTTAGTTATTTACT 100 47
BkAM31D_18735 3412932 .. 3412975 + -15.6  -4.71222   GCTTCGCTCATTGCA GAGGCAATATCAAAAGGT ACACCTTA ACCTTTTGATATTGCCAC TTTTCATTTTACTCT 100 163
BkAM31D_18760 3416785 .. 3416810 +  -6.9  -3.67134   AGGGCGTCTCAAAAG         GAAGCAATGTGC TTA GC-CATTGCTAC         TTCTTAAAGTACTTT  69 55
BkAM31D_18790 3421747 .. 3421792 + -20.2  -3.73144   TCCGCTGATTGCTTC GAAGGCATCTAAAAAA-GGTG AAAAC CACCCTTTTTTAGATGCCTTC TTCTATTAATCGTCT 100 238
       ppnK1 3430659 .. 3430700 +  -3.1  -5.28683   TTATAACTACTTAAA GAAGAGATTGGACCT CTGTGTTGCTTC TTGTCCAATCTCTTC  TTTTTTCCTGTTAAT  76 35
      hisK_2 3438165 .. 3438175 +    -4  -3.11208   CAACCCAGCTTTCGA                 TATG CCT CATA                 TACTTTTCAATGAAA  48 97
        msrC 3439522 .. 3439534 +  -4.9  -4.05033   TTCCATTTAAAAAAT                GAATA TAA TATTC                TTTGTGTGAAATAAG  63 98
        rpsD 3440338 .. 3440370 + -15.1  -4.99947   CTCGTTAAGTTTAAG      GAATCTGCTATAGTC AAT GACTATAGCAGATTA      TTTTGTTTCATTACA 100 33
      ponA_2 3444891 .. 3444930 +  -8.1  -5.44119   TAGTGATGAGTAATA  C-GCGAAAAGAACTTGGA ATTAA TCCAAGTTCTTTTCTTTG  TTTTTTTAAGGTGAG 100 28
        acuA NONE
      hrp1_2 NONE
        acuC 3449489 .. 3449521 +  -9.2  -2.65491   TATCCGTACGGAACA      AAGACGATAACGTG TAGTT CACGTTATCGTCAG      ATTCTCATCAGCTTT  72 16
        pepS 3456776 .. 3456800 + -10.1  -5.54192   AAATAACAAACAAAA          GGATGACTC TCAAGTC GAGTCATCC          TTTTTTTACATTAAT 100 35
BkAM31D_19015 3466557 .. 3466587 + -19.8  -5.62288   AACAATCATAAAAAA       CGAGAAGGCCAAGG TAT CCTAGGCCTTCTCG       TTTTTATTTTCTTGA 100 43
BkAM31D_19035 3469024 .. 3469056 +  -8.6  -4.09864   TGACAGTTGGCAGTA     GGTCTGCT-TATCGA TAAA TCGATAGACCAGACC      TTTTACCAGCTAACT  81 52
BkAM31D_19050 3471126 .. 3471163 + -15.8  -4.11484   ACTCCCTCTCTTTTA   GCGGCTGATTTGAAGG TTATCT TCTTCAAATTAGCCGC    TTTTCCGAGATTAAA 100 98
        purU 3475317 .. 3475372 + -12.8    -4.431   ACCATCCCCAATCAT TGCTTAAGGG-GTGTTCAAAAGGTCTG ATT CAGACCTTCTGGACACCCCCTTACATA TTTTCTAGCTCACTA 100 90
      cysK_2 3479394 .. 3479436 +  -8.4  -4.36411   AAGCCCGAATTAAAA GGGGCGTCTTCAAAGGTTAG AAA CAAACCTATTGAGACGCTTC TTTTGCTAATTCATA  86 69
        ytzE 3481356 .. 3481405 + -24.1   -3.1582   TAACCGTCTTAATAT TGAAAGAACAGATGCCCAATAAA ACTG TTTATTGGGCATCTGTTCTTTTG GTTTTCATCCGGTCC 100 38
BkAM31D_19140 3489112 .. 3489124 +  -2.7  -3.53444   CAGGTACTCCTAATT                GATTT TTT AAGTC                TTTGCCAACAGCTAC  48 209
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       mtcA1 3497350 .. 3497380 +  -9.9  -5.69473   GCTACGCTAAAAAAA       GTACAACCTGA ACATAACAG TCAGGTTGTAC       TTTTTTTCTGATCTC 100 15
BkAM31D_19190 3500244 .. 3500261 + -11.3  -4.62203   TCGGAAAATAAACTG             CACCTCC AATT GGAGGTG              TTTTAATTGTTTAGC  95 325
        pckA 3504187 .. 3504223 + -21.9  -4.20136   TGGAACAATTTAAGA    GACCACTGAAAGGATGA TTT TCATCTTTTCAGTGGTC    TTTCATTTTAAAACT 100 45
        bcrC 3506129 .. 3506160 + -12.5  -3.99678   TTCCATACTAGGAGT      TACTTACCTGCAC CCTTGT GTGTAGGTAAGTA       TTTCATTATAAACAT  95 30
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      tauB_1 NONE
      ssuC_2 3510488 .. 3510523 + -11.4  -4.35885   TTGTTAAAACGTTTC    TAGCCAAGA-ACAACTA AAA TAGTTGCATCTTGGCTA    TTTGTTGTAATGAAT  91 23
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         dck 3518289 .. 3518333 + -12.4  -3.57144   GACCAGACAATCAAA GAAGCCCCTGAAAAAAGGT ACGGTCTC ACCTTTTC-CAGGGGCTTC TTTCAGGCTGCCCGG  90 96
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       pgl_3 3523020 .. 3523045 + -10.5  -4.43397   TGAACAATAGTTAAA         CCGCATGGA TACATACT TCCATGCGG          TTCTTTCTTTTCCCC  95 46
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BkAM31D_19515 3559417 .. 3559429 +  -3.3  -3.86524   CCACTCATATATGAC                GCCTG TCT CATGC                TTTGTCCCAGCATAT  53 171
BkAM31D_19595 3569643 .. 3569663 +  -3.2  -5.27335   GCATATACCTGACGA            GGACGCTG AGTAA TGGCGTTC            TTTTTATTTGCACAA  76 13
BkAM31D_19610 3571806 .. 3571826 +  -6.7   -5.7946   CGACGGTATTAAGTA            AGGCGCCCA TAG TGAGCGCCC            TTTTTTTATTCGACC  93 25
BkAM31D_19635 3573999 .. 3574021 +  -5.5  -4.26188   CGATGCATAAAAAAA           GACCTCCAG TAGTT TTGGCGGTC           TTTTGAATATCTAAA  67 31
BkAM31D_19645 NONE
BkAM31D_19650 3576489 .. 3576510 +  -6.5  -4.30885   TTGCCGAGTTTTGTA           GAGTTCGCT TAAG GGCGGGCTC            TTTTAAATATATTTT  73 465
       hin_5 3578377 .. 3578402 +  -3.2  -5.13473   AAGAGCGAAACGTAA         GGCGTCCTCA CAGTCA TAAGGGCGTC          TTTTTTGCGTGTACT  73 7
       kch_1 3582747 .. 3582783 +  -3.8  -4.64598   TACGAGCACAAAAAG   AGGAACCGAACGGCCT CTTAGCT AGGC-GT-CGGTTCCC   TTTTTCCAATGCTTA  66 512
BkAM31D_19700 3585944 .. 3585958 +   -10  -5.73672   ATGTAAAATAAAAAA               CACCCA AGG TGGGTG               TTTTTTTAATTATTT 100 89
        yecD 3591573 .. 3591584 +  -5.8  -3.58914   ATCCAGAGAAATTTC                GGCT CACT AGCC                 TTATAATTCATTTAG  62 401
BkAM31D_19740 3592628 .. 3592642 +  -7.2  -3.02166   GTAGCAGAATGTACG               GTTAAC ACT GTTAAC               TAATTTAATTGAGGA  62 64
       hup_2 3592954 .. 3592992 +  -6.9  -5.27923   AATCAATATAAAAAA  CCTGATTCCATCGTCA CTTCTTTC TGACTA-GGAATCAGG   TTTTTTCTACGCTTC  95 39
        bioY 3594191 .. 3594235 + -23.9  -4.56702   AATTGCTTAAAAGAT TAGGGCGTCCCAAAAGGTC AAAAGCA GATCTTTTGGGACGCCCTA TTTATTTCATTAAAG 100 31
BkAM31D_19800 NONE
      btuF_2 3604455 .. 3604487 + -17.9  -4.81685   GCAACCATAAAAAAA      GAAGAATGACGTGCA TCG TGCACGTCATTCCTC      TTTTTAATGGTTCAT 100 17
      yumC_2 3608904 .. 3608916 +  -6.3  -2.85351   GCCTGAATTTAAAAA                GGATT AGC AATCC                TCTGGTGTACCAGCA  55 183
      mqnE_2 3610978 .. 3611005 +  -7.1  -4.15114   TATTAATCACTCCGA        GATGGTTCTTT AGTCCC GAAGAGCCATC         TTCTTCTTTCCTCTT  73 35
        scpD 3612398 .. 3612427 +  -9.3   -5.5943   TTGCAAATTACAAGA       GGCCCTGAGTGTT TGAA AAAACTCAGAGCC        TTTTTTTAATCCTTT 100 82
         ndh 3615921 .. 3615961 + -16.3  -5.05505   AAAATGCAACGAGCA GGGGCGTCTCAAAAGGTC AAACTA GACCTTA-GAGACGCCCC  TTTTTCATTTATACT 100 124
BkAM31D_19880 3617177 .. 3617202 +  -4.7  -5.95539   GTCGAAAAGTAAAAA         GCTGCTGAC TACACCCC GTCAACAGC          TTTTTTTCTTTCCCC  91 42
        nfuA 3617983 .. 3618015 + -19.9  -4.69214   TTTTAATTAAAACTT      GGCCGCCTCTAGACT ATA GGTCCAGAGGCGGCC      TTTGTTTATTGCATC 100 35
BkAM31D_19920 3623770 .. 3623805 + -10.7  -5.14477   AATAGCACAAGGACC   GAGGC-ACTG-AGAGTA TTTG TACTCTTCAGTAGCCTC    TTTTTTGACTCTCTA 100 57
      kinE_7 3625568 .. 3625602 + -10.2  -4.10566   CGGTTACAAAAGAAA     GAGACTTTTCTATC TAATTCT GATTGAAAAGTCTC     TTCTTCTTATTCGCT  86 9
BkAM31D_19945 3628019 .. 3628033 +  -9.2  -5.63504   TAAGTGACATTAAAA               GGCCGC TTA GCGGTC               TTTTTTTATACCCTT 100 38
BkAM31D_19950 3628432 .. 3628466 + -17.4   -5.4593   ATGATTAACGCATAG     GAAAAGCTCCCTAGTT AAG AACTAGGAAGCTTTTC     TTTTTCTTCTTTTAC 100 33
BkAM31D_19960 3629767 .. 3629805 + -17.8  -4.45386   CGCTCGCTATTTCAA   CCAATAACCTCAAAAG AAAAGCA CTTTTGAGGTTATTGG   TTTGTTACTTTCTTC 100 278
        lytH 3632060 .. 3632077 + -12.7  -4.18711   TTATAAAAAGGAAAA             GCCCGTG ACAT CACGGGC              TTTGATTATTATTTT  95 84
BkAM31D_19990 3634564 .. 3634589 +  -4.7  -5.82036   AACAACAAAGAAAAA         CATGCCCAACTA ATA TGGA-GGGCATG         TTTTTTCTTTGTTAT  91 13
BkAM31D_20015 3637924 .. 3637941 + -11.3  -2.84619   CCATCCAAAAAAGGA             CGCTAGG TTTC CCTAGCG              TCTCCTACATTATTC  79 104
      ysnF_1 3642210 .. 3642240 + -12.7  -5.58074   AGACTAGCAGAAATT       GGCTGACAGAAGG ATAAC TCTTCTGTCAGTC       TTTTTTTCATACTTA 100 34
      ysnF_2 NONE
BkAM31D_20050 NONE
BkAM31D_20055 NONE
BkAM31D_20060 3644440 .. 3644480 +  -8.3  -6.17669   AAACGGTAGCGAAAG  GAGGATGTCCATAGGTTGA GCA TGAACCTTAAGACATCCTC  TTTTTTTGTTTTGTT 100 32
BkAM31D_20065 3644795 .. 3644828 +    -4  -4.20516   TGTAACGATGAAAAA     GGCGATAAC-ATAGA TCTCT TCTCTCGTTATCGTC     TTTCTTACATAGGCA  61 36
BkAM31D_20070 3645131 .. 3645157 + -15.3  -3.80651   CTAGTATATTCAAAC         GAGCCTGTGTA CCAAT TACACAGGCTC         TATATTTTTTTACTT 100 37
BkAM31D_20080 NONE
BkAM31D_20085 3647549 .. 3647572 +  -7.5  -2.77534   TACTAGATCATAAAA          TTGCATTGG CCATAA CCAATGCAG           CTGTTTCTATGAATT  64 267
BkAM31D_20245 NONE
BkAM31D_20250 3678060 .. 3678091 +  -8.8  -4.36914   GCAATAAACAAAAAA      GAAGTCTGATCCCTC ATA GAGGT-TCAGGCTTC      TTTTCTCAACCCGGC  90 34
BkAM31D_20375 3698489 .. 3698527 + -11.7  -3.12521   TCGATCACTTAATAA   CAAACAACCGCATGACC TATGC GGTCATGCGGTTGACGG   TATGGTTTTGGTGGA  84 29
BkAM31D_20410 3704745 .. 3704772 + -12.8  -5.01845   CACTTTAAACATCTA        GGGACGTTTCAA ATGT TTGAAACGCCCC         TTTTTCATTATTGTA 100 114
BkAM31D_20485 3718270 .. 3718292 +  -9.2  -4.68506   GAAAAGGCAAAAAAA           GACGTGTG TCCAACC CACACGTC           TTTTTCCAATTCATT  91 42
        clpP 3728432 .. 3728459 + -11.4  -6.01187   TAAGGTTTTGTGTAA        CAGGCTAGAACA GAAA TGTTGTAGCCTG         TTTTTTTATTTCATT 100 42
BkAM31D_20720 3766246 .. 3766284 + -15.7  -3.03124   TCGATTGTATAAAGA   GTTATTTTAAAAAGGCG CCCTT TGCCTTTTTAAAATAAC   TCTTAAGCAATGAGC 100 16
BkAM31D_20765 3773446 .. 3773479 + -20.5  -3.63744   CTTCCATATTACAGT     GAAAGCCGCATTGGT TATT GCCAATGCGGCTTTC      TATTTTAGAAACAGC 100 80
BkAM31D_20815 3782203 .. 3782227 +  -7.1  -5.77632   AAGTGCGTAACCACC          TACCTGCCTCT TAC ACAGGCGGGTG          TTTTTTTATCCTTTT 100 31
      nagC_2 NONE
      xynB_2 3788461 .. 3788496 + -14.2  -3.17194   AAGATAATAGGAATA    GAGGGCGTGTGAAA TGAGACTT TTTCATACGCCCTC     TTGCGTTCCGAAGCT 100 34
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BkAM31D_20950 3807894 .. 3807908 +  -2.8  -3.16982   CTACTTTATTCCCTT               TAAGTG ATG CTCTTA               CTTTGTTCATATCAA  45 440
BkAM31D_20990 3814949 .. 3814974 + -11.3  -3.84514   CTCAAACATGAAAAA         GAGCCTACAGAA TAA TTCTGT-GGCTC         TTTAGTCGTTAAACT  89 11
       xre_2 3850164 .. 3850188 +  -4.3  -4.58663   AATAAATGACAACAA          GACACGC AACCAATATAA GCGTGTC          TTTTTAGGAGGTAGT  68 32
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BkAM31D_21325 3851163 .. 3851177 +   -10  -5.74684   TTACGATTATTGTAA               GCCCAA ATT TTGGGC               TTTTTCTTTTTATTG 100 26
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       hin_6 3853065 .. 3853093 +  -4.7  -5.35222   TCATAGAAGGTGAAA        GCATCAGAA TTGATTGGGTC TTCTGATGC        TTTTTTCTCCGTTTT  84 0
        yigZ 3857405 .. 3857448 +  -9.6  -4.16301   AAGTAAGGCGGGGAG GCGGAGACTCGGCGAGAG TATTAGGT TTCTCGGCGGGTTTTCGC TTATTTCTGTGAGTT  85 35
BkAM31D_21365 3859419 .. 3859437 +    -6  -5.77632   AAAGTCATTCAGTAA             CTCCAC TGCTTTT GTGGAG             TTTTTTTCTGATTTT  91 26
        lytF 3862305 .. 3862327 + -12.7  -3.49086   CCCACCAAAAAAGAA           CAGCGGCTC AAAAC GGGCCGCTG           TTCTACTACTTCTCT  95 53
        ywtF 3868963 .. 3869002 + -14.6   -3.5861   ACTACCGATCTACAA  TAATAGAAAGGACGATCA TTAT TGGTCGTCCTTTTTGTTA   TTCCTTCTTATCGAT 100 23
      lytC_2 3880664 .. 3880690 + -16.8  -5.87996   GCGGTAATCGTAAAA         GCTACAAGCAAA CTT TTTGCTTGTAGC         TTTTTTTGTTCGTTC 100 34
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BkAM31D_21505 3903065 .. 3903091 +  -8.1  -5.60993   AGAATAGCAATGAGA         GATGGTTTCTG ATTAA CAGAGATCATC         TTTTTTTCTGCAAAA 100 34
      alsT_2 3905165 .. 3905198 + -11.2  -5.45652   ATAAGTAAAATGCAA     GAAGCTTCACAC TAGGAATGGC GTGTGAAGCTTC      TTTTTTATTACACCT 100 33
      cphA_3 3907049 .. 3907083 +  -7.9  -5.21709   TGAAGTGATAAAAAA    GGATGTCTC-TTAGGC TCTT GCCGATTGAGACATCC     TTTTTTGATATCCCA  93 42
BkAM31D_21520 3907665 .. 3907686 +  -8.7  -5.30448   GAAAAACAAACAAAA           GAGCTAGGG ATGT CCCTAACTC            TTTTTCTCTTTCTTT 100 40
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      sspH_2 3911165 .. 3911204 +  -7.2  -2.77013   GCTAAACTGTAAACA  GAGGC-TGCCCCCTATT CATTCCA AATTAGGGGCAAGCCTC  CTTCTTAGAAAACTC  61 36
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BkAM31D_21555 3912592 .. 3912624 +  -5.6  -5.30616   AATAATGTATTTTAG     GATGGCACAAG-GTC AACA GGCTCATGTGTCATC      TTTTTATTTGCATCC  86 36
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        vnfA 3941060 .. 3941083 +  -6.8   -2.8166   CGGTAACAAAAAGAA          GGAGTGAA ACCATTCA TTCACTCC           TAGCTTTGTTTCATC  58 35
        yhcR 3943329 .. 3943364 + -17.7  -4.89339   TATTAACGACAAGTT    GCCCCAATTTGGCCG TCAAGT CTGCCAAATTGGGGC     TTTTTATAAATCATT 100 35
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BkAM31D_22125 4026059 .. 4026076 +  -3.5  -4.02022   AAGATAGGAGGAGGT             TCGAA-CA TGT TGATTCGA             TTTCTCATGATTGGG  57 52
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      kipR_2 4035463 .. 4035504 + -13.9  -5.61881   AAAGGGTAAACAAAA GCCAGCTGTTTTAGTGT TTATGAGC GCACTGGAACAGCTGGC  TTTTTCTTTTTAGCC 100 32
        hutG 4038954 .. 4038966 +  -4.1  -3.19192   TACTAACAGGAGGTA                TGTTC CAT GAGCA                TTGAATTGAATCAGA  48 35
        gltS 4040181 .. 4040201 + -11.9  -4.40894   ACGAACATACAAAAA            GGAGCTTGG CTA TCAAGCTCC            TTTTGCTATGATTTG 100 41
      sigY_2 NONE
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BkAM31D_22250 4047834 .. 4047851 + -12.7   -5.1963   AAAAGCTCGATAAGA             CGGGGAG ATGA CTCCCCG              TTTTTGTTAGTTCAA 100 104
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        opcR 4080967 .. 4081012 + -18.7  -2.74886   AAGGAATAAAGGGAC CAAGAAAATCCTTACGACAGTG AAA CACGGTCGTAAGGATTTT-TTG TGCTGTGTGTGCTTT 100 32
BkAM31D_22575 4104926 .. 4104941 +  -2.6  -4.75063   TTTTCTTATAAACTT              TCAAAG ACGC TTTTGA               TTTTTGCCCTTTTAT  65 176
BkAM31D_22625 4117075 .. 4117095 + -15.5  -3.34468   TTACAAAAGAAGTAA            CCCCACTCT TTT AGAGTGGGG            TCTGTTTAGTTGGCA 100 72
      benM_2 4123833 .. 4123845 +  -6.3   -4.6759   AAAAACAACTTACGC                CTGAT TTA ATCAG                TTTTCTTAAAATGTT  76 198
BkAM31D_22665 4124989 .. 4124999 +    -4  -4.29176   CATTATTAGCCAAAT                 TTCT TCT AGAA                 TTTTCGATTGCATAT  61 180
BkAM31D_22715 4131609 .. 4131631 +  -4.8  -4.34402   AATCGCCATGCATCA           CGGCACATTG CCA CAATGTCACG           TTTTGCTGTCCAGCC  66 156
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      lytR_3 4151532 .. 4151563 +  -8.8  -5.71712   AATAAGTTTGAAATA      GAGATTCTTGGGGT ATGA ACCTTATGAATCTC       TTTTTTTGTGTAAAA 100 36
BkAM31D_22830 4151985 .. 4152026 +  -8.9  -5.53288   ATCTATCTGGGGCAT G-ATGTAAAAAGGCCTTCCA AGT TGGGAGGTCTTTTTTCGTAC TTTTTTTCGGTTCGA 100 116
BkAM31D_22835 4152344 .. 4152368 + -12.2  -5.67529   TATTATTTAGTAGGA          GCCAGTTCTC GAGGG GAGAGCTGGC          TTTTTGTTTTTAGTT 100 93
BkAM31D_22890 4159268 .. 4159313 + -20.7  -4.41047   GGTTGTGGAGTGATC GGTCATCTGAGTTCAGGCAGGT TGT GCTTGCC-GGACTCAGATGACC TTTTCATTAAAACAT 100 28
BkAM31D_22950 4171424 .. 4171453 + -10.1  -2.86553   CAACTTGAAAGCAAA       GAACACACTGG-CC TTC GGACCAATGTGTTC       CTTATTGATGGTTAT  75 33
BkAM31D_22960 4173482 .. 4173495 +  -2.4  -4.62475   GGCAACGATGATTTC               CATG AATAGG CATG                TTTTCATTTATGAAT  61 114
BkAM31D_22965 4174469 .. 4174491 + -14.2  -2.92135   TAAATAGACAGAGAA           CCCCTCGATT CGG AGTCGAGGGG           GTTCTTGGTTATATC 100 34
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BkAM31D_23085 4191282 .. 4191303 +  -7.3  -3.69364   ATAATCGTTAAATGG           CACCTCC CGTATATT GGAGGTG            TTATATGTATTAAAT  69 37
        betL 4193647 .. 4193665 +    -6  -3.02144   TCACCTCCCGCATTT             TGTCGATA GAA TTTCGACA             TATTCCGGGGAGTGA  56 58
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