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 DD548_08460 1593036 .. 1593047 +    -3  -3.66028   GATTTTTCTTTAATT                CTTT TAAT AAAG                 TTATTCCACGTTGTG  50 350
        plsY 1598061 .. 1598099 +  -5.5  -5.26119   ACAATTTTTTGACAT  TAGTCCATC-ATTGCATA TTTT TTTGCAGTTGATGGATTA   TTTTATTTTTGCAAA  80 40
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 DD548_08490 1599099 .. 1599112 +  -2.5  -2.99719   AGTTGCAAGTTCACC               TTTTT CATT AAAAA                TCTCATATTTATACA  43 194
        mscL 1605596 .. 1605609 +  -3.8  -4.30177   TAATAAAGTGTCTAA               CGCT GTTTCA AGCG                TTTCTTGATCTAATG  62 240
 DD548_08560 1614439 .. 1614467 + -13.3  -5.14682   TTTATAAATTTTGGA        CCTCTTGAAAAAG TTA CGTTTTCAAGAGG        TTTTATTTATTCTAA 100 85
 DD548_08570 1616053 .. 1616063 +  -5.4   -3.7732   TCAAGTTCTACAGTT                 TCAC CAG GTGA                 TTCTTCGTGTGCCGC  61 278
 DD548_08595 1621082 .. 1621118 + -13.1  -4.79223   TAAATAAATTCTCAT    ACGGCAGATGCTTTAGA TTA TCTATAGCATTTGCCGC    TTTTTAATGGTGTAA 100 38
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 DD548_08605 1621838 .. 1621881 +  -7.7   -4.2354   TCACAAAAATAAAAA GCCTTAACCACAAGATATCT TATTC AAATATCATGTG-TTAAGGC TTATTTTAAAATTTA  77 262
 DD548_08630 1627599 .. 1627638 +  -8.1  -5.23396   AAAACTAATATAAAA  GCAATTCGTAACACATGT ATTCA AC-TGCGTTATGAATTGC  TTTTTCTTAATTATT  93 33
 DD548_08640 1629830 .. 1629840 +  -6.8  -3.91144   TTGTACAGGCGTATT                 CGGT TTC ACCG                 TTTCTGGCGTATCAA  69 450
 DD548_08650 1630624 .. 1630642 +  -3.2  -4.35958   CTAACTGTTCCATCT             GTCAAAAA TAA TTTTTCAC             TTATTTCTTTACTAC  60 241
 DD548_08685 1637159 .. 1637187 +    -4  -5.24647   TACATTATTCCAAAA       CAAGGTACTACAG ATTA TTG-AGTATCTTG        TTTTATTTTATATAT  74 155
 DD548_08805 1650369 .. 1650418 + -13.2  -5.06414   TCATAGCAAATAAAA CGCTTCATATAAA-GTCGTATCA TATAT TGACTCGACCTTTATATGAAGCG TTTTTATTACAAACA 100 52
 DD548_08890 1669996 .. 1670024 + -17.7   -5.4833   CTAATTAATATTGCA        GAAGAGAAGATGT GTT ACATCTTCTCTTC        TTTTTTATTGGATAG 100 60
 DD548_08955 1685212 .. 1685240 +  -9.7  -2.88032   AGTGGCATAAAAAAA        TCACATGACGATA CAT TGTCGTCATATGA        CTTTAAATATTATTC  77 162
 DD548_09010 1695972 .. 1695984 +  -2.7  -4.49132   TACATGTCTTTTACA                GTATT TCG AATGC                TTGTTTTATCTTTAA  60 505
 DD548_09135 1727327 .. 1727359 +  -7.2  -5.42975   CATATATTTAATAAA     TCTACTAAGT-CCTT TTCA ATGGCACTTAGTAGA      TTTTTGTTTATATAA  95 51
 DD548_09190 1738032 .. 1738046 +    -5  -2.71712   AATTCTGGAACCTTA               TCTAGG TTG CTTAGA               ATTTCCCCCGCAAAG  50 46
 DD548_09230 1746517 .. 1746542 + -10.6   -5.7946   GACACATTTACTTAA         GAACTAAGAG CTCAAC CTCTTAGTTC          TTTTTTTGTTACCAA 100 80
 DD548_09280 1756386 .. 1756410 +  -2.2  -3.71353   CTATGTGATAAGCAG          TAATGCTGAT TGTTT ATCGGGATTA          TTATTGCGATTATTT  48 112
 DD548_09310 1764574 .. 1764621 + -15.3  -4.60258   CAAGTTGTCGACAAA TAAACACCTCA-CAAAAGAAAG TAGTC CTTTCTTATGGTGAGGTGTTTA TTTATTATTTAATGC 100 42
 DD548_09475 1799746 .. 1799783 +  -4.3  -5.10029   AAGATAATAATATTC   GACACTACGAGCATGA AAATGCA TCTT-TTCGTAGTGTC   TTTTTTACAATTACT  73 39
 DD548_09495 1801458 .. 1801479 +  -8.7  -5.49568   CATTACCAAACAAAA           GAGTTCCGT GATT ACGGGGCTC            TTTTTGTTTTGAATT 100 60
 DD548_09505 1803315 .. 1803352 + -15.1  -2.92091   ACACGTATATTTAAT   AACTAAAAAGAGGCAGG TAAT CTTGCCTCTTTTTAGTG    TATATCAATGCCTCT 100 59
 DD548_09530 1808991 .. 1809006 +  -4.8  -2.73123   CCTTTTGTAAATGCG              GATAAT TTCA ATTATC               TAATTAACCCCTTTT  50 48
 DD548_09535 1809876 .. 1809887 +  -2.2  -2.56747   CTCGTATCATGATTC                CTCT GAAA GGAG                 ATGTTCTAATGAGTA  39 113
 DD548_09540 1811079 .. 1811117 + -14.9  -3.51202   ACCAATATAATATTG   TAGAGCCTAAGACAT TGATTTATT ATGTCTTAGGCTCTA   TTCCTTCATTTAATG 100 492
 DD548_09555 1813372 .. 1813391 +    -8  -4.58283   ACCCTTTATATAAAA            GTTTTGAA ATTG TTCAAAAC             TTTTTGAACACATTA  82 269
 DD548_09560 1813909 .. 1813921 +  -4.9     -3.94   TAAAGCAAATGAAAA                TTAGA TAA TCTAA                TTATTTCAACATTAA  61 96
 DD548_09565 1814248 .. 1814260 +  -2.7  -2.84218   TTCATTTATGTATTC                TAGTG CTT CATTA                ATATTTTAATGCATC  41 23
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 DD548_09680 1834139 .. 1834186 + -10.2  -3.73386   AACCCAAAAATAAAA CCCCATGT-TAGGGATATC AATCTACTTCA GATATCCTTATACATGGGG TTTAAATCATTATCT  87 139
 DD548_09740 1845222 .. 1845263 + -11.3    -5.626   ATTTTAAATTTTATT TAACCTATGTCATAGAT-AT TTC ATAATCTATAACATAGGTTA TTTTTTTATAAAATA 100 75
 DD548_09745 1847352 .. 1847393 + -17.6  -4.61231   TAAATTAACAAATTT TAATTGGCGGATGAGGTA TCCAGT TACCTCGTTCGCCAATTA  TTTTTCGCAATATAA 100 65
 DD548_09755 1847795 .. 1847812 +  -4.1  -2.70936   TCTGAATCATCTTGT             TCTTGCT GTTT AGCAAGC              TCATCTAATTGATCC  47 13
 DD548_09765 1849553 .. 1849594 +  -9.7  -4.67357   GTTAACAAATGAAAA CAGTATTTTAGGATTGTAA ACCA TGATAAACCTAAAATACTG  TTATTTTTATTACTT 100 36
 DD548_09780 1851258 .. 1851293 +  -4.8  -3.57715   CGATCTCTATTTGAA    TGAACGATATGTCC ATATTTTC GGATTTGTCGTTCA     TGTTTCATATGTTTT  57 194
 DD548_09790 1852536 .. 1852552 +  -6.6  -3.52117   GTCAGATGCTAGTTA              GTGGTT TCAAT AACCAC              CTTTTTCTGACTCGA  66 50
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 DD548_09845 1863980 .. 1864013 +  -8.2  -4.90381   TATTATATGCCAAAA     GAGAAGCTAAGCAA CTTTCA TCGCTCAGCTTCTC      TTTTATTATGTTAAA  91 116
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        trpS 1984121 .. 1984146 +  -9.8  -5.00196   AAGAGATAAAATAAA         GAGGTACTAG AATTAA CTAGTGCCTC          TTTTATTATTTAACG 100 32
 DD548_10510 1996280 .. 1996310 +  -8.5  -5.01535   AAGAAACTGAAAAAA       TCTTCAGTAAC TAAAACAAC GTTACTGAAGA       TTTTTATAGTTATGC  95 40
 DD548_10525 1999039 .. 1999058 +  -4.2  -5.26119   TTTCTTATTATTGAA            GCTGCC CAGATAAA GGCGGC             TTTTATTTTTGGCCA  74 67
 DD548_10555 2004379 .. 2004409 + -11.3  -3.46236   TTCAAATCTAAAAAA       CCAAGAATGCGAT TAATC ATCACATTCTTGG       TTCAATTTTATTCAT  93 46
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        argH 2027743 .. 2027777 +  -8.8  -4.34947   ATACGTTAATCTACC     TACCCACAATGT CTATTAAAATT ACATTGTGGGTA     TTTTAATGCTCTCTT  83 41
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 DD548_10710 2042764 .. 2042808 +  -4.5   -4.6313   TAGCGCATAAAAAAA CTGCTAGCCG-TA-GTTATGA ATATC TCATAACATTTCAGCTAGCAG TTCTTTTATTTTAAA  68 31
 DD548_10745 2050201 .. 2050232 +  -8.9   -4.5464   GGTTAAAATTAAAAA      GCAATGTCAGT TCACACTATT ACTGACATTGC       TTTTAGTTATGTGTA  88 35
 DD548_10755 2051125 .. 2051176 +  -8.4  -4.78661   ATGAAATTTAAAATA TAAAAATAGCACATACGCTCAATCA AAA TCGTTGAGT-TATGTGCTATTTGTA TTTTAATTTTTAGGT  90 234
 DD548_10805 2058534 .. 2058548 +  -4.3  -4.36554   AATGGTTGGCTTAAT               CTTCA CATCT TGAAG               TTTATTGTCGTCATC  64 137
 DD548_10850 2066037 .. 2066047 +  -2.6  -3.63953   CTGTAGTGAACTTAA                 TATT ATT AATA                 GTTTTCTTATTTTAA  47 0
 DD548_10860 2066449 .. 2066459 +  -5.4  -3.19186   CATTTCGACCGCGTA                 TTCC ATT GGAA                 GTTCTTTTGTAAATG  55 85
 DD548_10890 2073404 .. 2073417 +  -3.1  -4.40333   TCAACGAATTCTTTC               GCTTT ACCA GAAGC                TTTATCTTCTTTACC  60 334
 DD548_10950 2080696 .. 2080706 +  -3.2   -3.3161   TCTATTTTTACGTGG                 TGCT TTA GGCA                 TATCTTCTTCTAAAT  47 211
 DD548_10965 2082628 .. 2082649 + -11.7  -4.80737   TAAAATTCAAATTTG           CCAACCAAA AATT TTTGGTTGG            TTATTTTTTCTATTC 100 85
 DD548_10970 2083523 .. 2083547 + -10.1  -5.69793   GTTCTATTTTTCATA          CAACTACTCTA CTA TTGAGTAGTTG          TTTTTTATTTGATAT 100 87
 DD548_10975 2084259 .. 2084297 +  -9.1  -4.73677   AGTTGTATTTTAAAA  GCGTTATACAAAAGACAT ACTT GTGTCTAT-GTATAACGC   TTTATTTATTATAAA  93 51
 DD548_10985 2085626 .. 2085647 + -10.3  -5.60864   ACTAGTATTTGTAAA           TGTGCAAAA GTGA TTTTGCACA            TTTTTTTGATATCTG 100 303
 DD548_10995 NONE
 DD548_11000 2086386 .. 2086418 + -15.8  -5.66229   AATTCATTTTATATC      CAGTCTGAAACGTC TCAAT GATGTTTCAGACTG      TTTTTTATTCTTAAT 100 45
 DD548_11005 2087105 .. 2087116 +  -4.4   -3.6279   TCCATACAAACTAAG                GCTT GTTA AAGC                 TTATTAACACAGTTT  55 7
 DD548_11010 NONE
 DD548_11015 2088082 .. 2088121 +  -8.1  -4.64861   ATTCAAAATCAAAAG  TCGGACAGATG-AAAAGT AAAAA ACTTTTCCATCAGTTCGA  TTTATTTTAGAACCA  87 332
 DD548_11065 2099371 .. 2099389 +  -2.4  -4.26386   TATAAATTTGGTTTG             TTGATTGT CTT ACATTCAG             TTATTTAATTTTTAG  55 36
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 DD548_11075 2100056 .. 2100097 + -16.3  -5.39755   TAAACATACTAAGAT TAGCTATGAAGGAATCTAT GACG ATAGATTTTTTCATAGCTA  TTTTTTATAGTTATA 100 44
 DD548_11150 2116399 .. 2116440 + -16.9  -2.92246   TTACAAACAAAGGAT TGAAATGTTCCTTTCAATG TCTA CTTTGAAGGGAACATTTCA  TATAGTTACGGTTCA 100 101
 DD548_11160 2117447 .. 2117468 + -10.2  -4.12857   ACTTTTCAATACAGA           GAATCCCG CAATGT CGGGATTC            TTATTTATGCTGATT  91 58
 DD548_11180 2121141 .. 2121157 +  -9.5  -3.37164   TTAGTATTTCTTATG              CATGAGT TTT ACTCATG              TATTCCTATTTTTAA  82 63
 DD548_11275 2143103 .. 2143114 +    -3  -2.96767   TAATACAAATTATCC                CATA CAGC TATG                 CTTTCATTCCCTATT  44 173
 DD548_11285 2145580 .. 2145631 +   -10  -5.38549   ATAACAACGACAAAA CTGTTAATCCTTTGCTATTAT TAAATCATAGT ATAATAGCAAA-GATTAACAG TTTTTCTTATTTAAA 100 37
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        pepT 2148329 .. 2148360 + -10.3  -5.04265   ATTAATATATAAAAA      TCACGCTAACATT CAGTGC AATGATAGCGTGA       TTTTTCATATTTTTT 100 77
 DD548_11320 2152006 .. 2152019 +  -2.3  -3.89837   AAAAAATACTTATAA               CGACA ATAA TGCCG                TATTTTATAATTATA  50 26
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 DD548_11330 2153655 .. 2153695 + -17.1  -4.26634   CTTTTTTAAAGAAAA  GAGGGGAGCAATGATTAAG ACC TTTAACCATTGTTCCCCTC  TTTTAAAATTATTTT 100 293
 DD548_11385 NONE
        queF 2163991 .. 2164027 + -13.3  -4.99134   GTATCATTTAATAAA    CACACCAATAAGTTG ATTTTCC TAACTTATTGGTGTG    TTTTTCATTTAGCAT 100 43
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 DD548_11400 2165843 .. 2165868 + -11.3  -5.68039   GCCTAATTCAAAAAA         CAGTAAGTCAT TTAA ATGGCTTACTG          TTTTTTTATAGGTTT 100 49
 DD548_11410 2167442 .. 2167459 + -11.3  -3.27907   AAAGTATTTCTTTAT             GTTGGGG CCCA CCCCAAC              TTGCATTGTCTGTAG  93 461
        queC NONE
        queD NONE
        queE NONE
 DD548_11500 2186185 .. 2186240 + -16.7  -3.60214   AAATTTTAATACCAA AACTATAAAACACTTCTGATATTCT TAGTTC AAAATATCAGAAGTGTTTTATAGTG TTATCTAGTTCAGAT 100 32
 DD548_11505 2186993 .. 2187031 +  -4.9  -4.43669   TACTCAATGGAAAGC  GTATGATTTC-AC-AGC CCCCCTA GCTTGTAGAAATCATAC  TTTCCTTTTTTCAAT  65 120
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 DD548_11520 2189468 .. 2189491 +  -7.4  -6.11392   TGCAAAGACTAAAAA          GAAGCTCCCA TTAA TGAGGGCTTC           TTTTTTTGTTTATTT 100 64
 DD548_11575 2201935 .. 2201951 +  -3.1  -2.71593   GAGTTAAATTAAATT              TTTAATT AGG AATTGAA              TGCGTTTATAACTAT  42 131
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 DD548_11585 2202961 .. 2202994 +  -9.8  -4.24283   ATATATTTGAGGAAA     GCCAATTTCTATCA CATCAA TAATAGAAATTGGC      TTATTTATATTGCTT  91 73
 DD548_11615 2209382 .. 2209413 + -12.4  -5.66684   TTGTTAGTTAAAAAA      CTGCTTGAAAGGTT TCTT AGCCTATCAAGCAG       TTTTTTTATGCATTA 100 115
 DD548_11630 2213834 .. 2213863 +    -8  -5.31072   CTTTTAAAATATAGA       CTGTCAATTAAG GAATCA CTTGATTGGCAG        TTTTTATTGTCTTCT  93 45
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 DD548_11640 NONE
 DD548_11645 2215726 .. 2215768 + -12.3  -4.21989   TAAAAAATAAACAAA CACCCCTAATATTG-TTATC ATCA GCTAAACAATGTTAGGGGTG TTTGTTACGCTTATG 100 53
 DD548_11670 2218711 .. 2218728 +  -5.7  -3.36785   TAAAGAACCATACAA             TCATTAT AAAC ATAATGA              TTGCTTGAGCTATAC  57 162
 DD548_11730 2229183 .. 2229212 + -11.7  -5.93252   TTGTACTGATATATA       CTAGCAAT-TCACA TCA TGTGAGATTGCTAG       TTTTTTATTTTTGAA 100 50
 DD548_11770 2238303 .. 2238358 + -10.9  -3.24158   AATTTAAATTCAAAA TAAAACACCACTAATGTGTAATTGAT TAACT ATCAACTACG-ATTAGTGGTGCTTTA TATATGTTGTTTAGT  90 168
 DD548_11780 2239426 .. 2239448 +    -7  -3.94276   TGGTGGATAATTTTT           TGTCGATTGT TTT ACTGTCGACA           TTTGTGAAATGTTTT  73 490
 DD548_11850 2254174 .. 2254212 +  -7.5  -4.95487   AAAACATACTAAAAA   CGGACAAGTTGCACA TTATAAAGC TGCGAAACTTGTCCG   TTTTATATTTATTTT  88 39
 DD548_11875 2259350 .. 2259376 +  -5.2  -4.18488   CAATATAACCGTGAT         GATGTGCAAACG ATA TGTTTGGATATC         TTTGTTGCAATGCAT  66 424
 DD548_11885 2260896 .. 2260917 +  -7.5  -3.73435   CTGACAATAATTACA           TTATCATTA CGTT TAATGATAA            TTACTTTATTCATTT  73 157
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 DD548_11900 NONE
 DD548_11905 2264161 .. 2264177 +  -5.2  -4.07687   TGATGCAACCTAAAA              TATTGG TATCT CCAATA              TTTTAGGCCACACAT  65 77
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 DD548_11960 2274706 .. 2274740 +   -10  -4.81814   TTAGTATAAATACTA     ACACCCTAGACTTTCA TCA TGATTGTCTAGGGTGA     TTTTGTTGTAATAAT 100 63
 DD548_11965 2275777 .. 2275793 +  -3.1  -3.39352   GACAGGCATTATACT              TTTAAGA TTA TTTTAAA              TTAACTTTTAGCTTA  47 10
 DD548_11970 2277135 .. 2277170 +  -6.4  -5.70829   TTTAGCGCAATTTGG    TGAAGTTTGATAG-ATG ATA CATTCTATTAAACTTCC    TTTTTTTATGCTCTT  95 46
 DD548_12015 2284980 .. 2284991 +  -4.4  -2.88321   CTATGTGCCGATCTA                TGCT CAGC AGCA                 CTTTCAATTGTAGGT  49 163
 DD548_12145 NONE
 DD548_12150 2305376 .. 2305410 + -12.3  -3.30967   GACAAAACATAAAAA    CCTGGTGGCACGCATT GAAT GATGC-TGCCATCAGG     CTTTATTGTTGTGCT  95 40
 DD548_12185 2312293 .. 2312320 + -11.5  -5.08367   AAATTAATAAAAAAA        TTCCAAGCTTA TCGGTT TAAGCTTGGAA         TTTTTCGTTTATCTT 100 58
 DD548_12195 NONE
 DD548_12200 2314128 .. 2314174 +  -5.2  -5.03961   AATTTATAATACAAA AAATCGCACGATACGCCTCC GAATGAA GAAGGTTTATTGTGCGATTC TTTTATTATTTAGTT  77 115
 DD548_12225 2318371 .. 2318420 + -15.3  -5.67967   ATAAATCAACATTAT TAGCCACACCACTTAAATTGGGT ATGA ACTCAATTTATGTGATGTGGTTA TTTTTTTATAATCAT 100 59
 DD548_12230 2319215 .. 2319234 +  -4.4  -5.52079   AGCTAATATCGGTTA            TTTTTTTG TGCT CAAAGAAA             TTTTTATTTTAATCT  78 229
 DD548_12285 2328214 .. 2328233 +  -2.1  -3.21378   TAGAGGAGGCATCAA            CATGACT GACGAA AGACATG             TATTAGTAATATTTC  43 38
       bshB2 NONE
 DD548_12295 2329792 .. 2329811 +   -10  -5.21236   TATGATTAATTCAAA            CGCGTAAC ATTA GTTGCGCG             TTTTTATTATACCTT 100 46
 DD548_12300 2331541 .. 2331559 +  -3.2  -4.57569   TTTGTTCGTCTTATA             TAAATGTA CTT TACCTTTA             TTTTTACAAAAATAG  60 23
 DD548_12325 2345022 .. 2345033 +    -3  -4.26398   CATACCTATTTTTAA                TGTA TATT TACA                 TATTTTTTAATATTA  57 289
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 DD548_12390 2357621 .. 2357669 + -14.8  -4.16943   CATAAACTAATGAAA TGCTCCCTTCAAAGTAGACATT GAAAA AATGAAAACTTTGAAGGGAGCA TTTTACAATGTCCAA 100 75
 DD548_12505 2379645 .. 2379665 +  -2.6  -4.04719   TACTTTATTCATATT            GTTGTAAT TTGTT AATACAAC            TTTATCATATGTGGT  51 11
 DD548_12545 2390623 .. 2390634 +  -2.2   -5.9218   TTGACTATTCTCAGT                CTCT TTGA AGGG                 TTTTTTTCTTATGTA  77 77
 DD548_12560 2393744 .. 2393770 +  -7.5  -2.92701   AAAAGTTAGTGTTAC         TTATGCAATAG CTTGT CTATTGTATAA         TAATTAATTTCCTTT  66 53
 DD548_12735 2425699 .. 2425712 +  -3.9  -3.37761   AGATGGTTTGCGATC               TTCAT CTAA ATGAA                TTGAGTTTGTTACGA  51 188
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 DD548_12935 2467124 .. 2467161 +  -5.8  -4.82667   TATAACTTAAGTTAA  GCGACCT-GTGGATATAT GTCA AT-TGTTCACTAGGTCGC   TTTTTACTATAGTAA  78 54
 DD548_12950 2468562 .. 2468603 +  -5.5   -4.8048   TACTAATTCAGAAAA GGATTGGTCGAACATAGAAC ATGAA GTTC-AT-T-CGACCAATCC TTTTTCATATACAAA  73 35
 DD548_13005 2479042 .. 2479054 +  -3.3  -3.53444   GCACACCCAAATATA                TGGCG TTG CGCTG                TTTAACCAAGCATAC  50 184
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 DD548_13040 2484799 .. 2484824 +  -9.7  -4.21322   ACTTAAAATTCTCAG         GCCACTATACC AATA GGGATGGTGGC          TTTGCTTTGTGTTGA  88 45
 DD548_13050 2487185 .. 2487195 +  -5.4  -3.54408   AGTGTGATATTTCGA                 TTCG GTT CGAA                 TTACTTTACATGGGA  59 203
 DD548_13115 2497690 .. 2497748 +  -4.2  -5.03713   CAAAGCACAAAAAAA CAGCTCAATGACGT-A-GAAGTCAGTGA TTAAC TCACTAATTTCATTACATCATTAAGCTG TTTTATTTAATTATT  71 60
 DD548_13140 2503365 .. 2503376 +    -3  -3.78409   TACTTTTAATTATTC                GTAA TGAT TTAC                 TTTAAGTTAACTTCA  51 102
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 DD548_13205 2515980 .. 2516005 +  -7.6   -3.9941   CCTAATTATTTCAAG         CAGAGGTGAC AGTAGC GTTGCCTCTG          TTTCCTTATAAAAAA  75 130
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 DD548_13215 2516765 .. 2516778 +  -3.9  -3.44686   CTTAATTGAACAAAT               TCTAT GAGA ATAGA                TATTGTTAAATTAAG  50 19
 DD548_13220 2517369 .. 2517385 +  -2.3  -4.46926   ATTGATGAGTTCCAC              CTAATAA AAA TTGTTGG              TTTTATAGTAACATC  57 310
 DD548_13225 2518286 .. 2518313 +  -9.2  -5.72616   TCAGCGTTTTAGCTG        AAGGTCAGATGA TACG TCATCTGGCCTC         TTTTTTTATATAAAT 100 124
 DD548_13230 2519194 .. 2519213 +  -7.8  -4.87592   TACTCAAATTAAAAA            CCACCCGT GCAA ACAGGTGG             TTTTATTATATATAA  88 103
 DD548_13255 2525094 .. 2525121 +  -9.3  -5.28826   TTCAAAATGAGATTA        CTGTACTGTCT AATTTA AGATAGTACAG         TTTTTTATACCATTT 100 54
 DD548_13260 NONE
 DD548_13265 2526953 .. 2526964 +    -3  -3.80461   CCTGTAAACTTGTGA                TTTG AACA CAAA                 TTTAATACTCAATTC  51 34
 DD548_13270 2527768 .. 2527779 +    -3   -3.5764   TATCACTACTGAATT                CAAA ACGA TTTG                 TTTACAAATCCCCTT  50 266
 DD548_13280 2529326 .. 2529373 +   -13  -4.31813   TCATTGCAAGAAATA CCCGC-CCCCTCTAGCTATA CTTATCATTT TA-AGCTAGAGGGGGGCGGG TTATTTTGGTATCTT 100 42
        ahpC NONE
 DD548_13295 2532763 .. 2532795 +  -6.5  -5.60993   TTTCATTCATTTCAC      TGACAGTATCTTA CATTTGT TAAGATGCTGTTA      TTTTTTTATCCCGAC  95 43
 DD548_13300 NONE
 DD548_13305 2533924 .. 2533954 + -13.4  -4.90013   TAAAGTCATCATTTG       GGCATCAAGCAGCA TAT TACTGTTTGATGCC       TTTTTAATTGCCTTA 100 133
 DD548_13310 2534774 .. 2534787 +  -3.9  -3.41222   TAAAGTTTGGATCAT               TGAAA TATT TTTCA                TATTTCGGATTCGCA  51 345
 DD548_13320 2535502 .. 2535518 +  -6.7  -6.01369   GAATGCCATCTTTAT              TTCAATT TCC AATTGAA              TTTTTTTATTATTTA 100 39
 DD548_13330 2536662 .. 2536676 +  -7.2  -3.70469   GGCTTTTTTGTAATC               TATAGC ATC GCTATA               TTTAAAGTTATCATT  68 346
 DD548_13350 2539165 .. 2539176 +    -3  -2.74012   AAAGCATCGACTTAC                TAAG AACA CTTA                 TGCTTGGAATGATAA  42 92
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 DD548_13360 2540532 .. 2540563 + -11.8  -5.65177   ATGCAAGAAAAAGAA      GAGCTATGCATTTT ATTT AAAATGCGTAGTTC       TTTTTTTATGCATCT 100 93
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 DD548_13385 2542302 .. 2542325 +  -3.8  -3.41393   TACGCATAATTAAAA          GAGGCGAA CAATTGAT TCCGCCTC           TTCTACATATATACT  50 48
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 DD548_13445 2556656 .. 2556682 +  -6.8  -2.87211   CGACAATTATAGTTC         TTGTTTGTTAAA AAT TTTAATAGACAA         TATATAAGAAACGCT  61 401
 DD548_13470 2559749 .. 2559770 +  -4.5   -2.8474   AATCATTATCGTTCG           GTATAAAGT AAAT ACTATATAC            TACTTATGAGTGAGG  49 88
        tatA NONE
        tatC 2560795 .. 2560823 +    -9  -5.22039   TCCAATATAGCAACA        AAAAAAACAGGC ACTCG GCCTGTTTTTTA        TTTTTTAAATTTAAA 100 92
 DD548_13510 2567246 .. 2567261 +  -6.2  -4.07868   TCACATCAGCCTGCA              TTAACG ACGT CGTTAA               TTTATATACATCTCC  67 450
        glpT 2571489 .. 2571501 +  -5.5  -3.95554   ATGTCACGAAATATC                CCGAT TTA GTCGG                TGTTTTCTTAGCTAA  63 386
 DD548_13550 2575186 .. 2575217 + -13.2  -5.04222   TTAACCAAACAAAAA      GCCATAAATGCC GTCATATA GGCATTTATGGC       TTTTTACTTTCATTA 100 120
 DD548_13560 2575768 .. 2575794 + -12.4  -3.82097   CAATTCACCAAAAAA         CCCCGAACTA CGGCGAA TAGTTCGGGG         TTTGGTGCGTTTACA  95 57
 DD548_13575 2577714 .. 2577727 +  -3.8  -3.60323   CAATATGATTTATTA               GCGT ATGATA ACGC                TCTTCTTTCATCATA  52 249
 DD548_13635 2585708 .. 2585731 + -11.8  -4.59846   CGGCATGGCGAAAAC          CCGTAGATCT GAAG AGATCTGCGG           TTCTTTTTATATAGT 100 103
 DD548_13645 2586912 .. 2586941 + -13.1  -4.90136   TTAAAATCTCCGAAA       GGATTGGTTTCTA ACAT TAGAAATCAATCC        TTTTTAATATTAATT 100 126
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        sarU 2600663 .. 2600680 +  -4.1   -4.0896   GCTAGGTTTGATGGT             GCC-GTAC CTT GTGCTGGC             TTTTCAACAAACTTT  62 513
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 DD548_13840 2630588 .. 2630616 + -12.6   -5.5112   TTTTTTCACGCAAAA       GCCTGCGATT-CA TTTA TGTAATCGCAGGC        TTTTTTATTGCTAAC 100 64
 DD548_13850 2632612 .. 2632648 + -13.9   -4.6645   AATTAATATATATAT    TTAAAAGCAAAGGCGCG CCA TGTGCCTTTGCTTTTTA    TTTTGTATATCTGTA 100 35
 DD548_13860 2634610 .. 2634620 +  -2.4  -3.66921   CATTAATTTATAATT                 GAGG TGT CCAC                 TTTGAAATTAGAATT  47 28
 DD548_13865 2635354 .. 2635376 +  -7.7  -5.28561   ATGTAGTATAAAAAA           GGAGCGGTA TACAT TGCCGCTTC           TTTTTATTATGTATT  91 35
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 DD548_13990 2658300 .. 2658340 + -14.2  -3.80279   AATAAAACCTAAAAG  CAGCAGTAAGACCACTTC TAATT GAAATCGTCTTACTGCTG  TTCTCTATTTATAAC 100 63
 DD548_14025 2667393 .. 2667431 +  -8.4  -5.98675   CATTCATAATAAAAA  CGATAGT-GTACACG TTAATGAATT CGTGTACTACTATCG   TTTTTTATTTTTATC 100 69
 DD548_14045 2670569 .. 2670605 + -19.7  -5.61881   TATAGATGCTAAGTA    GAGAGATTGTTGTGCAA TGT TTGCACGGCAATCTCTC    TTTTTCTTTTTAAAA 100 126
 DD548_14050 2673188 .. 2673214 +    -8  -3.01041   TATAATGTCGCGGTT         TACAGTTGGATC TTC GCTCCAACTGCA         TATATAGTTACACTT  70 97
 DD548_14055 2673940 .. 2673963 +  -5.3  -2.94099   TAATCACACCATTGT          CTAATGCGT CTAATA ACGCCTTAG           TATCTACTAAAGAAC  52 363
 DD548_14125 2689723 .. 2689760 +  -6.5  -5.63236   AACTGAATGAAAATA   AGCTTGTCATTAAAA CATATAGA TTTTAGTGACAAGCA    TTTTTGTTTTTGCGT  95 195
 DD548_14130 2690439 .. 2690449 +    -4  -3.29263   TAATCTCAAAATATA                 TCAA CAC TTGA                 TTCTAAGGAGGATAT  49 213
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 DD548_14285 2714981 .. 2715018 +  -8.8   -5.8901   AAAAAATAAAAAAAA  TCATTTCC-CATCTG-AT TAAC ATCCAGATGTGGAAATGA   TTTTTTATTTTATAT 100 39
 DD548_14295 2717121 .. 2717135 +  -7.2  -4.93296   TCAAGGTTTATGACT               TGAGAA ATG TTCTCA               TTTTTATCATACTGG  85 87
 DD548_14300 2718114 .. 2718151 + -10.1  -5.27477   TAAACTACTAAAAAG   GACTCATACAT-GTGCTT TAA AGGCATTGTGTATGAGTC   TTTTTTGATTAAAGT 100 67
 DD548_14310 2720394 .. 2720434 + -13.5  -3.99819   ATCATAAATAAACAA  GCAGTCCAGTGCGTA TCATCATACCT TACGCATTGGACTGC  TTTGCTATGTTTATT 100 34
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 DD548_14345 2727796 .. 2727829 + -12.7  -5.58522   GGTCCACGAAATAAA     CGGTAATTTCTATCT CAAT AAATAGAAATTACCG      TTTTTGTTTTATATG 100 94
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        pgaC NONE
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         pcp 2824394 .. 2824405 +    -3  -5.14563   CATAAGTCACATTTA                TAAC ATAC GTTA                 TTTTTTGGTCACCAA  71 494
 DD548_14790 2825785 .. 2825807 +  -6.3  -5.85425   AATATGTGCTTATTA           ACCGTTAAC AACAC GTTAACGGG           TTTTTTATTTGTTTA 100 40
 DD548_14795 2827440 .. 2827466 + -10.9  -5.08367   AAAATATTTAAATTA         GCGCTCGAATC TCATT GATTTGGGCGC         TTTTTAATTTGTATT 100 39
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 DD548_14815 2831785 .. 2831815 +  -5.3  -3.81322   AAAATATAAAAATAT       GGGCGTATCTTAC TTATT GTAGGTAGCGCCC       CTTTTTTATGCTTCA  61 45
 DD548_14825 2833434 .. 2833447 +  -2.4  -3.60006   ATCAGTATTAGGTGG               TGTC TCAAAT GACA                TTTAACCATATCGTT  47 7
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 DD548_14835 2835750 .. 2835781 +  -5.8  -2.62184   GTATCCAAGATGATT      ATCACCTTACGACC CTTA GGTCGTAAGGCAAC       TGATATAGAAAACGC  55 169
 DD548_14860 2837419 .. 2837441 +  -9.9  -5.31456   AGATTTTAATATCAA           CAAGTAGCG TTTAT CGCTGCTTG           TTTTTTATGGATTGC 100 84
 DD548_14865 2837997 .. 2838025 + -14.1  -5.70829   ATGAATCGCTTTGAT        TACCAACAAGGTT CTA AATCTTGTTGGTA        TTTTTTTATGCTATT 100 69
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 DD548_14905 2845149 .. 2845159 -    -4  -3.53745   TACATTTTAAAGTAA                 GTTA TTA TAAC                 CCTAAGGTCAGTATT  52 108
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         noc 2840112 .. 2840140 -  -4.7  -6.71862   AAAACAAAAAAAAAA        GACAAAGCT GTTATGATCTT AGCTTTGTC        TTTTATGTGTTAGTC 100 64
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