 CEG42_00040 NONE
 CEG42_00045 NONE
 CEG42_00050 NONE
 CEG42_00055    5221 ..    5258 +  -6.6  -5.61881   TTAATTGATTAAAAA   CATTAAGAAGTACA CCCTAATAAA TGTATTTCTTAATG    TTTTTATTTTTCGAA 100 51
 CEG42_00110   22377 ..   22403 +  -6.7  -2.70708   ATATAAAATAAAAAA         TCTACTTCAGT TTTGC ACTAAAGTAGA         TAATATAATTCAATT  60 51
 CEG42_00145   28910 ..   28934 +  -8.6   -4.6644   ATATAATCCACAAGC          GGGTGCTAAT TTAAT ACTAGCACCC          TTTTTGGGGTATATT  90 58
 CEG42_00240   52449 ..   52462 +  -6.7  -2.86676   CTAATAACTAATTAG               TACGC AAAA GCGTA                GTTTGCATTAGTAGC  61 377
 CEG42_00335   81654 ..   81664 +  -2.6  -3.02973   TAATGAGTCAATTAT                 TTAA TAC TTAA                 TATATAAGTTTTTAA  41 22
 CEG42_00340   83009 ..   83043 +  -8.8  -5.11836   TCAACAAAAAAATAA     TTAAAAACCTGCAA GGTTAAA TTGCTGGTTTTTAA     TTTTATTTTCAATAT  93 26
 CEG42_00365   87813 ..   87823 +  -2.6  -5.41746   ATATTTTAAAAACAG                 TATT AAA AATA                 TTTTTTTAGAAAATT  66 85
 CEG42_00370   89543 ..   89555 +  -4.9  -3.75898   AAAGTAAACAAACAG                CAAAA AGT TTTTG                TTTAAATGATTTATT  57 8
        rpmG NONE
        secE NONE
 CEG42_00385   91479 ..   91516 + -11.7  -3.47232   ATAAACAAAAGTCGA   TGCATATAAGTTTTA CGAGCCTT TAAAACTTATATGCA    TTACTATTATATTAT  89 445
        dnaA  116860 ..  116877 +  -2.1  -3.49369   AAACTTATTAAAATA             TTATATA TTTA TATATAG              TGTATTTTCGTGTTT  43 63
 CEG42_00515  117321 ..  117345 +  -8.7   -5.3104   AATTAGTAGATTAAA          TAACAGGCAAT TAG ATTACCTGTTA          TTTTATTTTTACTAA  95 96
        prfA  118605 ..  118629 +  -7.3  -3.77773   TAACCGCTTAACAAT          TGTAAATTCTA ATT TAGAATATACA          TATTTTAAATTGTTA  71 168
 CEG42_00530 NONE
 CEG42_00535  120345 ..  120360 +  -3.4  -5.51165   GCAAAATAGTTAATT              TTAAAA GTTT TTTTAA               TTTTTTTAACATTTT  71 28
 CEG42_00540 NONE
 CEG42_00545  121509 ..  121534 +  -7.7  -6.01369   AAAAAGAAGAAGAAA         GAGAGAAGAGT TAAA ACTCTTTTTTC          TTTTTTTATTGTTTA 100 57
        mgtE  123264 ..  123279 +  -3.4  -3.54129   TATAGAAATAATTAT              TTATAA AATG TTATAA               TTTAAAAGCAATATG  48 47
 CEG42_00555 NONE
 CEG42_00560  124312 ..  124362 +  -8.7  -5.09221   TTTTTTATAAATTGT TATTAATTAAAAACCGGCATCTTT TATA AAGGATACCGGTTTTTAATTC-TA TTTGTTTTTGTTCTA  93 48
 CEG42_00655  149908 ..  149923 +  -3.4  -3.28924   AATATTAAACCAAAT              TTAAAA AAGT TTTTAA               TTATAAAGGACAATA  46 247
 CEG42_00660  151332 ..  151351 +  -2.2  -3.84514   ATTGGTTTTCATCCT            TAGTATAA GTCG TTAAACTA             TTTACTCGTTCCCCT  49 511
 CEG42_00700 NONE
        rsmG NONE
 CEG42_00710  159939 ..  159949 +  -2.6  -2.62933   ATGAAAAATATGTCT                 TAAA TAA TTTA                 TAATGTCGCCAATTA  39 12
 CEG42_00715  160423 ..  160433 +  -2.6  -5.75822   GTAAAAACCAATTTA                 TTTT TTT AAAA                 TTTTTTTGCTTTATA  72 80
 CEG42_00720 NONE
 CEG42_00725 NONE
 CEG42_00730  168056 ..  168066 +  -2.6  -3.45381   CCAGTGCTTTTAAAT                 TTAA AAA TTAA                 TTAACTTTTATATTG  44 15
 CEG42_00735 NONE
 CEG42_00740 NONE
 CEG42_00745  170993 ..  171005 +  -4.9  -3.52341   TAACGATGGTGGTGT                TTATG AAT CATAA                TTATAATATTCAAAT  56 13
 CEG42_00750 NONE
 CEG42_00755 NONE
 CEG42_00760 NONE
 CEG42_00765  176572 ..  176598 +  -8.8  -5.46657   TATATTAAATTTAAA         CCTTGGTAACTA TAT TAATTACCGAGG         TTTTTTATTAAAATG 100 53
 CEG42_00770  180227 ..  180275 + -17.1   -3.2244   ACGACACTAAATAAG CAAAATGATAACCTCGTGTTTAA AAA TTAAACTAGGGGTTATCATTTTG TTAAATGTTATAATA 100 27
 CEG42_00775 NONE
         rnr  182756 ..  182778 +  -2.8  -5.30155   AATACACAAAGAAGA           TGACTAAA GTAAATA TTTAGTCG           TTTTTTAATTGCTAA  63 71
 CEG42_00785  183313 ..  183325 +  -9.1  -4.77698   AAAAAAGAGATTTAG                CGCGT GAA ACGCG                TTTATTTTAATATTA  91 3
 CEG42_00790 NONE
 CEG42_00795  187160 ..  187170 +    -4  -4.88795   AACATACAAGAAAGA                 TTCA TTA TGAA                 TTTGTTTTATTAAAT  65 320
        lysS  189367 ..  189397 +  -5.7  -6.23545   AACTAATAACAATAC       TACAAAATGTT AATAAATCA AACATTTTGTA       TTTTTTTTATTTCCA  95 83
 CEG42_00820  193157 ..  193171 +  -4.4    -4.329   CTTTAGTGGTTGATT               TTAATT AAT AATTAA               TTTATTAGTCTCTTC  61 72
 CEG42_00850  200071 ..  200088 +  -7.1  -5.48054   AATGAGATAAAAAAA             CTAGTTT TTAA AAACTAG              TTTTTTAATTTTAAT  93 43
 CEG42_00885  206831 ..  206841 +  -2.6  -4.08042   ACAGTTTATTATTAT                 TTAA ATA TTAA                 TATTTTTCTAATAAA  49 46
 CEG42_00890 NONE
        gyrB NONE
 CEG42_00900  211714 ..  211732 +  -3.2  -5.24796   AAATAAAGTTATACT             TTACTTTT TCT AAAAGTGG             TTTTTATTATCTAAA  66 64
 CEG42_00905 NONE
        recA  213301 ..  213311 +  -2.6  -3.76482   ATTGACAATAACTTG                 TAAT ATA ATTA                 TTATTGGTGATATAA  47 30
 CEG42_00915  214817 ..  214838 +  -5.3  -5.67711   CTTTTATATGTTTTT           TATCTGAAT TTTT ATTTAGATA            TTTTTGTTTTGTTTG  90 93
        dnaX NONE
 CEG42_00935 NONE
 CEG42_00940  218587 ..  218597 +  -2.6   -5.2422   AACAATCTTCAATTA                 TTTA TTT TAAA                 TTTTTTACTCTAATT  63 53
         ffh  220251 ..  220263 +  -3.4  -6.17669   TTATTTAGTTAAAAA                TGGT TATAC ACCA                TTTTTTTATTTTATT  83 29
 CEG42_00950 NONE
 CEG42_00955  222964 ..  222989 +  -6.3  -3.36237   ATAAATAAGAATATC         TTTCATTCTTT AAAA AAAGAACGAAA          ATTTTAATTATTTAA  61 33
 CEG42_00960  226372 ..  226382 +  -2.6  -5.64006   ATTATTTACAATTTG                 TTTA CAT TAAA                 TTTTTTTAATTAAAT  69 155
 CEG42_00995 NONE
 CEG42_01000 NONE
         hpt NONE
 CEG42_01010  242429 ..  242443 +  -4.4  -3.38696   GGTTAAATGGCATTT               TATTTT ATT AAAATA               TATGTTTATATAGGT  53 76
 CEG42_01015  244104 ..  244119 +  -7.6  -5.64328   CAATTTTTGAAATAT              CATGAG TTTA CTCATG               TTTTATTTTTTTATT 100 384
 CEG42_01020 NONE
 CEG42_01025 NONE
 CEG42_01030 NONE
 CEG42_01035  249624 ..  249637 +  -3.9  -3.61806   TCTCATTTTTCAATA               TAAAC GTTA GTTTA                TTATATAATTAATAT  52 69
 CEG42_01040  250283 ..  250303 +  -8.4  -4.58395   ATTTGTTAAATAAAA            TACCAAGT CTAAA ACTTGGTA            TTTTTCACAGATAAG  86 28
 CEG42_01045 NONE
 CEG42_01050  252545 ..  252556 +  -4.4  -2.62936   AATATAATCTTCTAG                TGCT TTTA AGCA                 ATTAGTTAAATAATT  48 129
 CEG42_01055  254287 ..  254306 +  -5.2  -3.29649   TGAATATAAGCCACT            TTTTTAAA TATT TTTAAAAA             TTCATATGGTCGGAT  54 91
 CEG42_01060  257404 ..  257419 +    -4  -3.57457   ATACTAATAATTCGA              GGACTT ATAT AAGTTC               TTAGTTAATTTTTAG  52 6
         rrf  257589 ..  257613 +  -3.6  -5.71983   ATCGCTACGCTAAAA          CCAACCTT GAAATTTAA GAGGTTGG          TTTTTTTATACTTAA  76 31
 CEG42_01070 NONE
 CEG42_01075  258914 ..  258924 +  -2.6  -2.92642   ACAAAAAAGACTAGT                 TTAT TAT ATAA                 TATATAAGTACTAGT  39 55
 CEG42_01080  259030 ..  259049 +  -2.1  -6.95634   TTAATAAATAAAAAA            GCAATTC ATAATA GAATCGC             TTTTTTTTTTTTTAA 100 40
 CEG42_01100 NONE
        secA NONE
 CEG42_01110  266776 ..  266795 +    -3  -4.47307   GTAAAAAGCAAATAA            TAAATATA TAAT TATGTTTA             TTTTAATATTAGTTT  56 26
 CEG42_01115  268939 ..  268961 +  -7.2  -2.51535   TTAAAATTATTGTAA           TGTTTTCTAT GAT ATAGAAAATA           ATAATTTTGTAATAA  63 84
 CEG42_01120  269820 ..  269834 +  -4.4  -3.07232   CATATTAACAAGGAA               TAATTT ATG AAATTA               TATGATTCTTATTCT  50 33
 CEG42_01125 NONE
 CEG42_01130  271951 ..  271963 +  -2.7  -5.27779   TTAACTTCGTTGTGT                TTTGA CTT TCAGA                TTTTTTGATATTCAG  69 119
 CEG42_01190  284293 ..  284305 +  -3.5  -4.41348   TTAATTTTCATTATT                TTTAT TTA ATAAA                TTTATTTAAAAAAAG  58 41
 CEG42_01215 NONE
 CEG42_01220 NONE
 CEG42_01225  291788 ..  291805 +  -4.9  -2.61507   AAAGTGCCAATATAC             CAATCAA CATC TTGGTTG              CTTCTAACATATCTT  50 517
 CEG42_01235 NONE
 CEG42_01240  295547 ..  295565 +  -8.9  -5.60689   TTATAATTATAAAAA             CCAAACC AAAAC GGTTTGG             TTTTTTCTTCTCTAA 100 41
 CEG42_01250  299245 ..  299255 +    -4  -3.51633   TAAGACGCGAAGCTT                 CAAA AGA TTTG                 TTGTATACAATATAT  50 520
 CEG42_01270 NONE
 CEG42_01275 NONE
 CEG42_01280  304550 ..  304562 +  -4.9  -3.71527   AGATTTATTTTCATA                GTATA CTA TATAC                TTAATTTGTTAATGT  57 25
 CEG42_01285  304916 ..  304945 + -10.9  -4.62783   TTTGTTCACATAACA       TGACTTTTGCTAA GCCA TGAGCAAAAGTCA        TTTTTGACATAGATA 100 89
 CEG42_01295 NONE
 CEG42_01300  307640 ..  307659 +    -3  -3.83026   GATTTGTGAATAGTT            TTATTATG CTAT TATAATAA             TTTGATATACGAAGG  50 28
 CEG42_01305  308609 ..  308621 +  -3.5  -3.33261   TAATATTTTTTTAAT                TTTTA ACA TAAAA                TTAATGTATAAGTCT  46 75
 CEG42_01310 NONE
 CEG42_01315 NONE
         pyk  312357 ..  312370 +  -2.5  -3.83811   TATTTCAATTTAAAA               TAAAA ATAA TTTTA                TTATTAATATCTTTA  47 28
 CEG42_01325 NONE
        rpoC  320762 ..  320788 + -10.3  -5.08878   TAACTATGATATTTA         CGTAGATGTGT GCTAA ACACATTTACG         TTTTATTTATATATT 100 67
 CEG42_01345 NONE
 CEG42_01350 NONE
        rnmV NONE
        rsmI NONE
 CEG42_01365 NONE
 CEG42_01370  328241 ..  328251 +  -2.6  -3.09017   ATTGTAGAAAAACAA                 TAAA ATC TTTA                 ATTCTTTGTAATTAT  41 23
 CEG42_01375 NONE
        pstA NONE
 CEG42_01385 NONE
 CEG42_01390  333390 ..  333405 +  -4.7  -5.76237   AATCATTAGCAAAAA              CTAGG CATTTA CCTAG               TTTTTTATTTATCTA  82 43
 CEG42_01395 NONE
 CEG42_01400  336200 ..  336225 +  -7.8  -5.70829   CTATAATTAAAAAAA         CATTAGTTAA TTAAAT TTAACTAATG          TTTTTTTATCCTCTT 100 337
 CEG42_01435  341333 ..  341386 + -17.3  -3.20316   CTAGTGAACGAAAAT GTTAAAAATAAAAAAATGTACAAAC CATT GCTTGTACATTTTTTTATTATTAAC TGGTTATTTTATTTA 100 37
 CEG42_01455 NONE
 CEG42_01460 NONE
 CEG42_01465 NONE
 CEG42_01470 NONE
        rsgA  347523 ..  347534 +    -3  -3.37622   AATAAGAGGTGAGAA                TTGT GTCA ACAA                 TTATAACTACATCTT  46 169
 CEG42_01480  349063 ..  349081 +  -4.6  -5.65513   ATTTTTAAAAAAAGA             CTAAAGCA AAA TACTTTAG             TTTTTTTAATTAATA  79 40
 CEG42_01485  350803 ..  350824 +  -4.5  -5.73978   GTATTTCATAATTAA           GAAGTTAAT TAAA ACTAACTTC            TTTTTTATTTATAAT  82 50
 CEG42_01495  353803 ..  353815 +  -3.3  -4.65305   ATAAACAAGTTGATC                GCTTC AAA GATGC                TTGTTTATTTTTTTC  58 75
 CEG42_01500 NONE
 CEG42_01505  357206 ..  357242 +  -5.3  -6.09196   ATTAAAAAACAAAAA    TGAGTCTTAATACTTTT TTA AAAAGTGTTTTGACTTA    TTTTTTTATTTTACA  86 36
 CEG42_01510  358520 ..  358539 +  -2.3  -3.48276   AGTTTTTCAACAAAA            TAAATTA AATACA TAATTTA             TTGTATAAAACACAA  43 23
 CEG42_01515 NONE
 CEG42_01520  359360 ..  359378 +  -6.8  -5.52096   TATAAAAGAAAAAAA             TGACTTTA TAT TGAAGTCA             TTTTTTATTACCTTT 100 36
 CEG42_01525  361079 ..  361093 +  -3.6  -3.35542   CTAAATTATATTAGT               TAACTT ATT AAGTTG               CTTTTTACCCATAAA  46 27
 CEG42_01530 NONE
 CEG42_01535 NONE
 CEG42_01540  362639 ..  362653 +  -2.9  -2.91264   ATTAATACACAATTC               TTATG ATTCG CATAA               TATATCGATGCAAAA  42 200
 CEG42_01545 NONE
 CEG42_01550 NONE
 CEG42_01555 NONE
 CEG42_01560 NONE
        rplB NONE
 CEG42_01570 NONE
 CEG42_01575 NONE
 CEG42_01580 NONE
 CEG42_01585 NONE
 CEG42_01590 NONE
        rpsQ NONE
 CEG42_01600 NONE
 CEG42_01605 NONE
 CEG42_01610 NONE
 CEG42_01615 NONE
        rpsH  370406 ..  370417 +    -3  -2.84229   AATGTAGGCGGGGAA                GTAA TCGC TTAC                 GTTTGATAAGAATAT  42 5
 CEG42_01625 NONE
 CEG42_01630 NONE
 CEG42_01635 NONE
 CEG42_01640  372467 ..  372479 +  -3.5  -4.24342   TAGAGTAATAAAAGT                TTATA ATA TATAA                TTTATTACTAAACCA  56 33
 CEG42_01645 NONE
 CEG42_01650 NONE
         map NONE
 CEG42_01660 NONE
        rpmJ NONE
 CEG42_01670 NONE
 CEG42_01675 NONE
        rpoA NONE
        rplQ  378168 ..  378182 +  -4.4  -4.90079   TTGTAATTTTGGTCA               TATATT TTT AATATA               TTTTATTATTAAGAT  68 236
 CEG42_01695  381375 ..  381392 +  -2.1  -2.53759   TTTTTCATTTGTTGA             TATTGAT CCTA ATTAATA              TGAATTAGAAGTGTT  37 10
 CEG42_01700 NONE
 CEG42_01705  382430 ..  382446 +  -2.3  -4.34402   TTTATTTTTATAAAA              CATGATT ATT AATAATG              TTTTACTCTAAAGGA  50 14
 CEG42_01720 NONE
 CEG42_01725 NONE
 CEG42_01730 NONE
 CEG42_01735 NONE
 CEG42_01740 NONE
 CEG42_01745  392479 ..  392503 +  -7.3  -5.76237   TTAAAATTAAAAAAA          CTTAATGTTAT AAA AAAACATTAAG          TTTTTTCTTTGTATA 100 41
 CEG42_01750 NONE
 CEG42_01755 NONE
 CEG42_01760 NONE
 CEG42_01765  395985 ..  396001 +  -3.8  -3.05012   AATTGATTTTTAAAA              TATGAA TAAGC TTCATA              ATTAATTTTTTTATT  46 122
 CEG42_01780 NONE
 CEG42_01785  398986 ..  398996 +  -2.6  -3.41804   TTTTTCTGAAATGAT                 TTTA TAT TAAA                 GTTTTTAGAATTTAA  44 16
 CEG42_01790  399258 ..  399285 +  -4.1  -5.69793   GAAACGCACATGAAT        CCAACCATTAC TTGAAT GTTTTGGTTGG         TTTTTTCTTTAATAT  75 45
 CEG42_01795 NONE
         pgk NONE
 CEG42_01805  403402 ..  403414 +  -3.5  -3.14944   TATCAAATAAAAACC                TTTTA ATA TAAAA                TTAAATATCGTAATA  45 47
        deoD  404205 ..  404223 +  -6.2  -3.31263   ATTATTATTTAATGG             TTAATTTT TAT AAAATTAA             TTATAAAAATAACAT  61 57
 CEG42_01815  404677 ..  404697 +  -9.8  -5.04082   TTAATAATATGAAAA            CACGAGTT TTAAT AACTCGTG            TTTTGTTATTATTTA  95 41
 CEG42_01820 NONE
 CEG42_01825 NONE
 CEG42_01830 NONE
 CEG42_01835 NONE
 CEG42_01840  412348 ..  412367 +  -2.2  -3.41602   AATGAATTAAAAAAA            TTATTCCT TTTG AAGAATAA             TTATAGTAAAATAAG  43 6
        msrA  412901 ..  412936 + -10.6   -5.2189   CTAAAAAAGAATTCA    GATAAAAACCAGGCGT TTTT GCGTCTGGTTTTTATA     TTTTTTAATCATTAA 100 21
 CEG42_01860  424524 ..  424551 +  -5.1  -6.14618   AAATAATTATAAAAA        TATTAGAGATT TTAAAC AATCTTTAATA         TTTTTTTATTTTATA  91 35
 CEG42_01865 NONE
 CEG42_01870 NONE
 CEG42_01875  427209 ..  427224 +  -3.4   -4.7923   TTGTATTTGTTTTAT              TAAAAA TGAG TTTTTA               TTTGTTTGTTTAGCT  63 295
         efp NONE
 CEG42_01890 NONE
 CEG42_01895 NONE
 CEG42_01900 NONE
 CEG42_01905  430561 ..  430574 +  -6.7  -5.95449   AATAAAATCTCAAAA               GTGGT CTAA ACCAC                TTTTTTGTTTTATTT 100 55
 CEG42_01910  432386 ..  432405 +  -5.2  -3.29649   TGAATATAAGCCACT            TTTTTAAA AATA TTTAAAAA             TTCATATGGTCGGAT  54 92
 CEG42_01915  435503 ..  435518 +    -4  -3.57457   ATACTAATAATTCGA              GGACTT ATAT AAGTTC               TTAGTTAATTTTTAG  52 6
         rrf  435688 ..  435712 +  -3.6  -6.08342   ATCGCTACGCTAGAA          CCAACCTT GAAATTTAA GAGGTTGG          TTTTTTTATTTATTA  79 31
 CEG42_01925  436287 ..  436297 +  -2.6  -4.41797   AAAAAAAGATTGACA                 TTAT ATA ATAA                 TTTTACTATAATTTT  54 48
 CEG42_01930 NONE
 CEG42_01935  436509 ..  436519 +  -2.6  -5.00884   TACCAGGCCAGCCAT                 TAAA TTA TTTA                 TTTTTTAACCACAAT  61 27
 CEG42_01940  436625 ..  436635 +  -5.4  -3.85817   AATGAAGGGGTCAAA                 GGTT CGA AACC                 TTTATGGGGCACCAT  63 1
 CEG42_01945  436787 ..  436803 +  -3.6  -2.92668   GTTCAAGTCCCTCTT              CCAGCA CCATT TGCGGG              TGTAGTTCAATGGTA  44 17
 CEG42_01950  436892 ..  436910 +    -6  -5.38326   TAATATTTAACTAAA             CTCCAC CCTATTA GTGGAG             TTTTTCTTTAATTAA  89 44
 CEG42_01955 NONE
 CEG42_01960  438715 ..  438727 +  -7.7  -5.47218   AAAAAAAAAAAAAAA                GGAGA AGT TCTCC                TTTTTTTCGATCACA  95 74
 CEG42_01975  442097 ..  442108 +  -4.4  -4.48073   CATTAAGTTGAGCTT                GTTC ATTT GAAC                 TTCTTGTTTTTTTAA  64 227
        rnpB  442760 ..  442806 + -14.2  -3.63608   AACACGGCTTATTTT TACATGCAAAAACCCACTCTT ATAAAA AAGAGTGGGTTTTTGTAT-TA TGTTTGATTATATTT 100 25
 CEG42_02015  446652 ..  446666 +  -4.4  -3.29562   ATTATCAAAAAGCAT               TAAAAA TTA TTTTTA               TGTTCTAATAAATTT  52 103
 CEG42_02020  451570 ..  451597 + -13.6  -4.14627   AAGTAAAATGTGAAT        GAAATGACGACC TTAG GGTTGTCATTTC         TTATTTATATGAAAG 100 85
 CEG42_02025  452988 ..  453005 +  -4.3  -3.22475   GAAGGATTCGAAGAT             TTTAAAT TCTA ATTTAAA              TATTATGGCAATGAA  48 14
 CEG42_02030 NONE
 CEG42_02035 NONE
 CEG42_02040 NONE
 CEG42_02045  455910 ..  455952 +  -9.7  -5.66338   TGCGACACACATATA TTA-TTAAAAAAGATAGG-GT CAT ACTCCTATCTTTTTTAATTAA TTTTTTATTGTATTT 100 19
 CEG42_02065 NONE
 CEG42_02070  460794 ..  460814 +  -5.6   -3.3056   TGTTAGTGATTTAAT            TGATTATT TTTTT AATAATCA            TGTTGCTATTATTAT  57 257
        rpmF NONE
 CEG42_02105  466200 ..  466220 +  -7.7  -6.32976   ATTAAATTAAGTTAG            TAACAACTT CAT GAGTTGTTA            TTTTTTTATTTTTTT 100 26
 CEG42_02110 NONE
 CEG42_02115  469681 ..  469700 +  -9.4  -5.27938   AGGAAACACAAAAAA            GGCTTTTA ATAA TAAAAGCC             TTTTTATTTCAAAAT 100 50
 CEG42_02120  471010 ..  471044 +  -6.1  -3.15831   TTTATCACAAATTAA    TTCTTA-TAAAATTTC GCAA GAAATTTTGCTAAGAA     TGGTTTATATTTAAT  60 512
 CEG42_02130  474483 ..  474510 + -11.5  -3.91332   AATAATTAATTTTAA        TAACCAATGGT TTAAAT ACCATTGGTTA         TTGTTATATAATAAT  95 36
 CEG42_02135 NONE
 CEG42_02140 NONE
 CEG42_02145 NONE
 CEG42_02150  477331 ..  477360 + -11.1  -2.91255   AACTAGAGTTAAGTA       TTAACTAATTATT TTCA AATAATTAGTTAA        TCATATTTATAATAA  84 18
 CEG42_02155  478249 ..  478259 +    -4  -4.60889   TTTATTGTTTTTTTA                 TACT AAA AGTA                 TTTTTAAAACTAATT  62 90
 CEG42_02160 NONE
 CEG42_02165 NONE
         tig NONE
         lon  484268 ..  484285 +  -7.1   -5.3671   AGAAATATTAAAAAA             TAAACAC TGAA GTGTTTA              TTTTTTAATTATGTT  93 40
 CEG42_02180 NONE
 CEG42_02190  487100 ..  487138 + -12.8  -4.66163   TAAAAATTAACTATA   TTTAATTAAAAAAAGCCT TTA GGGCCTTTTTTAATTAAA   TTTTTAAATCAAGAT 100 21
        truB NONE
        ribF NONE
 CEG42_02215 NONE
 CEG42_02220 NONE
 CEG42_02225 NONE
 CEG42_02230  496241 ..  496255 +  -2.8  -5.73339   CAGCTTGAGTTATTA               GTATTG TTA CAATTC               TTTTTTTATCGTTAT  72 176
 CEG42_02240  499045 ..  499065 +  -5.6  -4.07618   ACATTTTATTTATTA            TTTTTAGA GTTTA TCTAAAAA            TTTAATTCTTACAAA  65 97
 CEG42_02245  499657 ..  499710 + -15.9  -3.93148   TCAAAATGCTTTAGT TTGTTAATAAATAAAAACCTCTTTT TAAA GAAGGAGGTTTTTATTTATTAATGA TTATTCCTTTGATTG 100 27
 CEG42_02280 NONE
 CEG42_02285 NONE
 CEG42_02290 NONE
 CEG42_02295  513897 ..  513917 +  -4.7  -4.67011   TATTGTTCATATAAA            CATCCCA CATTTGT TGGGGTG            TTTTTAAATCAAATT  65 251
 CEG42_02310 NONE
 CEG42_02315  517988 ..  518008 +  -4.7  -4.67011   TATTGTTCATATAAA            CATCCCA CATTTGT TGGGGTG            TTTTTAAATCAAATT  65 231
 CEG42_02330  521668 ..  521681 +  -4.5  -6.08342   ATATAAATAAAAATA               GCTCA AAAA TGGGC                TTTTTTTATTTATTA  85 40
 CEG42_02340 NONE
 CEG42_02345  528295 ..  528339 +  -7.6  -4.39724   AAGATTATAATACAA TAAAAAATCCGTC-TTATTAT GTTT ATAACAAAGATGGATTTTTTA TTATTTATTTAATTT  80 60
 CEG42_02375  535109 ..  535122 +  -3.9  -3.94933   AAAATATTAAAAAAA               GTATA AGAG TATAC                TATTTTTCAAATTCG  54 20
 CEG42_02380 NONE
 CEG42_02385 NONE
 CEG42_02390  537778 ..  537791 +  -5.3  -5.98675   CAATTATTAAAAAAA               CTCAT TTTT ATGAG                TTTTTTGTTTTTATA  86 60
 CEG42_02395 NONE
 CEG42_02400  542570 ..  542586 +  -2.4  -2.82471   TATTAAATTAATTGA              TTAATA TATAT TATTAA              ATTGTTAAAATTTAT  39 22
 CEG42_02405  543456 ..  543473 +  -8.5  -5.61596   AGAGTATAAATATAA             CAGGTTT GTTT AAACCTG              TTTTTTTATGACAAT 100 32
 CEG42_02410  545706 ..  545716 +  -2.6  -3.90856   AAAATGGTGGTTTTT                 TATT CCA AATA                 TTTAATTAAAACCTT  47 61
 CEG42_02415  547622 ..  547632 +    -4  -4.58308   AATTATAATTACTTA                 CTAA AAC TTAG                 TTTATTTAGTTCATA  62 39
 CEG42_02445  550630 ..  550684 + -11.2  -3.79765   ATAATTAAGATACAG TTGCATTATAAAAACCCTTGGATT CATAAAT AATCTAAGGGTTTTTATAATTTGA TATTCTTTTGTATGT  93 49
 CEG42_02470  556574 ..  556606 + -10.9  -5.29385   AAAATAATATAAAAA      TAAGTTTAATGTTAT CAA AAAACATTAAACTTA      TTTTTTAGTTGACTT 100 130
 CEG42_02485  559803 ..  559831 +    -4  -6.37666   GCATAAATAAAAAAA       GTGAA-AGCAATT TATA AAATGCTATTCAC        TTTTTTTTATTTTAT  88 79
 CEG42_02510 NONE
        tsaD NONE
 CEG42_02520  568089 ..  568114 +  -3.2  -5.53991   AATAAATTTAAAAAA         CGATACGCAC AATAAA GGGCATATCG          TTTTTTTAATAAATA  71 36
 CEG42_02565 NONE
 CEG42_02570 NONE
 CEG42_02575 NONE
 CEG42_02580 NONE
 CEG42_02585  580227 ..  580245 + -10.4  -4.71318   ATGTTAACATAGTGT             CTCCAAAT ACA ATTTGGAG             TTATTTTTTCATCTT  95 131
 CEG42_02595  581391 ..  581403 +  -3.5  -2.71657   TTTTAGAATATACAA                TAAAA CAT TTTTA                GATTTTATTATTGAT  43 12
 CEG42_02600  582005 ..  582033 +  -9.1  -3.99347   AAATTTTAAAAAAAT        TCTTTTAATTATC AAA GACAATTAAAAGA        TTATTTAAATAATTT  82 18
 CEG42_02650  589666 ..  589702 +  -5.5  -3.84246   AAAATAAATCAAAAT   TAAAATAAAAAACCGC ATTGAA GTGGTTTTT-ATTTTA    TTATTAATTAATAAT  63 34
 CEG42_02655 NONE
 CEG42_02660  591927 ..  591937 +    -4  -3.88832   CGTTTAAATCAAGAG                 GTTT TTT AAAC                 TGTTTTATAATTAAT  54 396
 CEG42_02670  592554 ..  592584 +  -4.9  -4.23298   ACGATCTTCATAGTG       TGAATTTATAGGA TTAGT TTCTATTAATTCA       TCTTTTTTAGCTTTA  64 317
 CEG42_02705  600951 ..  600970 +  -2.2  -5.04987   ATCTTGTTCATCTAA            TTCAAACT CATA AATTTGAA             TTTTTTAAAAATATT  60 323
 CEG42_02745  611544 ..  611554 +  -5.4  -2.72461   ACACATTCATCTAAT                 GGTT ATT AACC                 CTTTAGAAAAAATTA  54 224
 CEG42_02785  619267 ..  619280 +  -2.4  -4.37527   TCATCTTGTTGAATT               CCAA CTAAAT TTGG                TTTTACTAATTCTAA  55 386
 CEG42_02800 NONE
        parE NONE
        parC NONE
        yqeH NONE
        nadD NONE
        mtnN  628958 ..  628971 +  -2.5  -3.09492   AAATCTACTAATTTA               TTTTT GTAA AAAAA                TATTAAAATTACAAA  41 30
 CEG42_02830  629574 ..  629584 +    -4  -5.56573   GAAAAAATGAGTAAA                 CAAA TGT TTTG                 TTTTTATTTATTTAT  75 287
 CEG42_02840  635968 ..  636014 + -14.9  -4.00411   ATTAATATAGTAAGA TATCAAAACTCCTCTACTAGAA AAAG TTCTT-TAGAGGAGTTTTGATA TTATTTAGCGTTTTA 100 58
 CEG42_02855 NONE
 CEG42_02860  639998 ..  640037 +    -9  -4.02108   ATAATAATTAATAAA  TACCTTTCATTATTAGA CCAAATA TCTA-TAATGAAAGGTA  TTTCATTGTGATAAA  82 206
 CEG42_02880  646003 ..  646028 + -13.5  -5.64873   GTAAATAAATATTAA         TTTACCCCAAT AAAT ATTGGGGTAAA          TTTTTTATTATTAAA 100 73
        ybeY NONE
 CEG42_02935 NONE
        recO NONE
 CEG42_02945 NONE
        dnaG  684875 ..  684905 +  -7.8  -5.66229   TGAATACAAAAAAAA       GCTTTTTAGTAA TGTTCGT TTACTAGAAAGC       TTTTTTATTGTTAAT 100 41
 CEG42_02960  703638 ..  703653 +    -4  -3.54408   CTAATGATTTACGCA              CTTTTG AAAT CAAAGG               TTAATTTGAATAAAA  50 6
 CEG42_03050 NONE
 CEG42_03055 NONE
 CEG42_03060 NONE
 CEG42_03065  715057 ..  715076 +  -2.2  -4.17556   AGTATAATATTTAAA            TGTATGAA TTTA TTAATACA             TTTATTAGGGGTATA  50 63
 CEG42_03070  715171 ..  715195 +  -8.6  -5.93252   CATATAATAACAACA          GGACTGACAC TTTTT GTATCAGTCC          TTTTTTGTTTTTGAA 100 39
 CEG42_03090 NONE
 CEG42_03095 NONE
        pyrH NONE
 CEG42_03105 NONE
 CEG42_03100  723974 ..  724008 -  -5.3  -5.28755   AAACAGATCAAAAAA    TGATTGA-TATTAGTA TATA CACTAATACTCAACCA     TTAATTGAATCTATA  85 56
 CEG42_03085  719593 ..  719603 -  -2.6  -4.57543   AACAATTAAAAATAA                 TAAT AAA ATTA                 CATAAACATAGTATT  56 346
 CEG42_03075  716083 ..  716103 -  -9.1  -5.76237   GATACAAATAAAAAA            GAAGCGAAT TAA ATTCACTTC            TTTTTCTTTATCTAA 100 48
 CEG42_03045  712398 ..  712413 -  -7.6  -7.00209   ACAAAAAAAAAAAAA              TCTGCA ACCA TGCAGA               TTTTAGTGTATCAAT 100 40
 CEG42_03040  712230 ..  712264 -  -5.3  -5.01497   ACTATTATATAAAAA    TAAAACTAGAAGCA AAATAAAA TGCT-CTAGTTTTA     TTTTAATTAATGGCG  73 36
 CEG42_03035 NONE
 CEG42_03030 NONE
 CEG42_03025  707832 ..  707851 -  -5.2  -2.82023   TAGTTACACGAATCA            TTTTTTAT TACA ATAAAAAA             CTCGTGAACCAGAAC  51 345
 CEG42_03015 NONE
 CEG42_03010  707064 ..  707085 -  -5.3  -3.27298   TTCCCGAACGATTAA           GATAATATT TCAT AATACTATC            TTTTTAAAAAATTTA  54 42
 CEG42_03005 NONE
 CEG42_03000 NONE
 CEG42_02995 NONE
 CEG42_02990  706606 ..  706637 -  -2.6  -3.79113   ATCCCGCGATAATAA      CTTTAT-AATGTT GTGTGTA AACATTGATAAAG      TATTTTATATTTATA  47 44
 CEG42_02985  706513 ..  706529 -  -2.9  -2.68487   TTAATCACTACACCA              CAGAACC ATT GGTTGCG              GGAGAGGGATTTGAA  41 18
 CEG42_02980 NONE
 CEG42_02975  706330 ..  706348 - -10.4  -5.66229   ATTAATAACAAAAAA             TACTAGCT TAA AGCTAGTA             TTTTTAATTTTATTT 100 44
 CEG42_02965  703692 ..  703702 -  -4.6   -3.9131   ACTCATTAAAAAAAC                 GGCA CGG CGCC                 TTTTTTTTTTTTTTT  57 79
 CEG42_02955  684875 ..  684905 -  -5.6  -6.10295   TGAATACAAAAAAAA       GCTTTTTAGTAA TGTTCGT TTACTAGAAAGC       TTTTTTATTGTTAAT  95 60
 CEG42_02925 NONE
 CEG42_02920  675482 ..  675513 - -10.4   -5.5208   TTACAATATAAAAAA      TACTTTAAGAACGT TGGT AGGTTCTTAAAGTA       AGAATTTAATTTTTT 100 48
 CEG42_02915  672563 ..  672579 -  -6.7  -3.99805   TTCTAAAAATTTAAA              GTTTTTT TTA AAAAAAC              TATTTTTATCATTAA  71 37
 CEG42_02910  672040 ..  672052 -  -3.5   -4.1023   AATTTTAAACAATAA                TTAAA TCT TTTAA                TCTTTTTTTAATTTT  54 101
 CEG42_02905 NONE
 CEG42_02900  667973 ..  667990 -  -2.7  -3.92041   AAAAAAGTAAAAAAC             CAATCAC TGAA GCAATTG              ATCTTATTTTTAAAT  47 427
 CEG42_02890  663508 ..  663522 -  -2.8  -7.14698   AAAAAAAAAAAAAAA               GACC GTTGATT GGTC               TTTGTGCTTATAAAA 100 140
 CEG42_02885  646084 ..  646111 -  -7.2  -5.79595   TTTGAAAATAAAAAA        TCTATCCCTATA TTAA TATAAGAATAGA         TTTATAGTAATTGAT 100 42
 CEG42_02875  640905 ..  640932 -    -5  -5.71638   TAACAATTAAAAAAA        CTTTTAGTAAAT TTAT AATCACTAAAAG         TTTTTGAATTTATAT  84 40
 CEG42_02870  639998 ..  640037 -  -9.7   -4.4078   ATAATAATTAATAAA  TACCTTTCATTATTAGAC CAAAT ATCTA-TAATGAAAGGTA  TTTCATTGTGATAAA  87 444
 CEG42_02850  638089 ..  638106 -  -4.3  -2.97456   ATATAGTATTATATA             TTTTTAA TACA TTAAAAA              ATACTGTTAAATTTT  46 85
 CEG42_02795  619891 ..  619911 -  -6.9  -4.46493   GTAAAGATAGCAAAA            TAACTCCTT AAA ATGGAGTTA            TTAGTTTGTTTTATT  79 26
 CEG42_02790 NONE
 CEG42_02780 NONE
 CEG42_02775 NONE
        nadE NONE
 CEG42_02765 NONE
 CEG42_02760 NONE
 CEG42_02755  612088 ..  612101 -  -3.8  -5.87996   TAATTAATAAAAAAA               CACC ACTGCA GGTG                TTTTTTATTATTTAA  76 54
 CEG42_02740 NONE
 CEG42_02735 NONE
 CEG42_02730 NONE
 CEG42_02725  603504 ..  603519 -    -9  -5.45652   ATTCCTAATAAAAAA              GAAGGG CACC CCCTTC               TAAAAATTTTACTTT 100 34
 CEG42_02720  602265 ..  602278 -  -3.9  -4.21438   CACCTCAATAAAGAA               TTAGT TAAA ACTAA                TTATTCTTATCTTTT  58 32
 CEG42_02715  601228 ..  601242 -  -2.8  -4.57569   GGATTTTTCCAAAAA               TTGTTG TTG CACCAA               TAAGTGTAAAATGAG  56 439
 CEG42_02700  599023 ..  599037 -  -4.3  -4.21954   TCAATATATAAATAA               TGATC TTTTT GATCA               TGTGTTTTTATTTTA  58 33
 CEG42_02695  598628 ..  598654 -    -6  -5.50723   TTATTAAAATAAAAA         TCTACTCTAG TTTTATT CTAAAGTAGA         TTGATCTAAAGTTAG  89 47
 CEG42_02690  596346 ..  596369 -  -4.7  -5.41143   TAGGTGTTAAAAAAA          GTATTAGTC AAATAA AACTAATAC           TTTTCTCAATTTAGT  76 290
 CEG42_02685  594740 ..  594750 -  -2.6   -5.0538   TTCCAGCTGAAAAAA                 TATT TAT AATA                 TCAAAATAATATGAT  61 320
 CEG42_02675  591854 ..  591867 -  -5.3  -2.76815   ACTCGTTTTAACAAT               CGATT TGCT AATCG                TGGGATTCCTTTAGC  50 451
 CEG42_02645 NONE
 CEG42_02640  587872 ..  587886 -  -2.9  -3.95873   CTTTTATAAAAAAAT               TTTAC GAATT GTAAA               TGTTATTTGTAAATT  50 28
        ureB NONE
        ureC  585610 ..  585633 -  -2.6  -3.82605   AATAAATTAATATAA          TATTTTAGTT TGAC AATTAAAATA           AGAAATATCTTTGTG  47 18
        ureE NONE
 CEG42_02620 NONE
        ureG NONE
 CEG42_02610  582807 ..  582829 -  -9.3  -5.50774   TATAAGAAATAAAAA           CCTTAAAAC TTAAC GTTTTAAGG           TTTTTTAAATCTTTT 100 39
 CEG42_02605  582004 ..  582034 -  -7.8  -5.51165   AAAATTTTAAAAAAA       TTCTTTTAATTATC AAA GACAATTAAAAGAT       TATTTAAATAATTTT  95 215
 CEG42_02590  579884 ..  579907 -    -4  -4.37711   TGACCAAATTCAAAA          TTATCTAAAT AAGT ATTTAGCTAA           AAATCCTTCTTTATT  60 397
 CEG42_02560 NONE
 CEG42_02555 NONE
 CEG42_02550  573183 ..  573212 -  -8.1  -2.57092   AATTTTATTAATTTA       TTACCTAATATTA TAAA TAAAATTAGGTAA        TGGCTTATATTTTTA  68 42
 CEG42_02545 NONE
        dnaE NONE
 CEG42_02535  569150 ..  569162 -  -3.5  -3.98842   TATAATATGGATAAA                TTATT TAT AATAA                TTTTGCATATTATTT  54 13
        mutM  568221 ..  568231 -  -2.6  -3.74693   CGCCACTTGAGCAAA                 TTAA ACA TTAA                 TTATTATAACAATTT  45 75
 CEG42_02525  568089 ..  568114 -  -5.4  -5.25805   AATAAATTTAAAAAA         CGATACGCAC AATAAA GGGCATATCG          TTTTTTTAATAAATA  81 47
 CEG42_02505 NONE
 CEG42_02500  561691 ..  561717 -  -8.2   -5.4593   CTAAAATAATAAAAA         TTAGCAATCA TCATATC TGATTGCTAA         AAATAATCATAATTA 100 62
        dnaJ NONE
        grpE  559803 ..  559831 -    -4  -6.02919   GCATAAATAAAAAAA       GTGAA-AGCAATT TATA AAATGCTATTCAC        TTTTTTTTATTTTAT  81 37
 CEG42_02480 NONE
 CEG42_02475  556574 ..  556606 - -10.9  -5.25799   AAAATAATATAAAAA      TAAGTTTAATGTTAT CAA AAAACATTAAACTTA      TTTTTTAGTTGACTT 100 118
 CEG42_02465  554257 ..  554277 -    -2  -3.68836   ATTTTTAAAATAATA           TTGTTTTGT TTTG ACAAA-CAA            TTTCATTCTAATAGT  45 55
 CEG42_02460 NONE
 CEG42_02455 NONE
 CEG42_02450  550644 ..  550670 -  -5.2  -4.91109   GTTGCATTATAAAAA         CCCTTGGATT CATAAAT AATCTAAGGG         TTTTTATAATTTGAT  70 54
 CEG42_02440 NONE
 CEG42_02435 NONE
 CEG42_02430 NONE
 CEG42_02425 NONE
        acpS  547408 ..  547444 -  -5.3  -5.32565   GAATTAATGAAAAAA    GTAGTTAATAACAAAAC TTT ATATCGTTACCAACTAC    AAAAAAGTAATAATT  85 219
         der NONE
 CEG42_02365  531583 ..  531595 -  -3.5  -2.79725   TCATTAACAAAAACT                TTTAT CAA ATAAA                TCCTGGGGATTTAAG  44 1
 CEG42_02360  529703 ..  529715 -  -3.5  -5.14645   ATAATTTAATAAAAA                TTAAT ATC ATTAA                TTATTAATAATGATG  68 127
 CEG42_02355 NONE
 CEG42_02350  528295 ..  528339 -  -7.6  -3.79482   AAGATTATAATACAA TAAAAAATCCGTCTT-ATTAT GTTT ATAACAAAGATGGATTTTTTA TTATTTATTTAATTT  73 26
 CEG42_02335  521656 ..  521693 -  -8.7  -3.90582   AACACAAAAATAATA   TAAATAAAAATAGCTCA AAAA TGGGCTTTTTTTATTTA    TTAAAATTCAAATTC  79 127
 CEG42_02275  504897 ..  504913 -  -5.3  -3.83459   TATAACATTAAAATA              TTATTAA ATA TTAATAA              TTTTAACATAATATA  59 94
 CEG42_02270  504177 ..  504205 -  -2.6  -5.76237   TATATAAATAAAAAA       GCAAAACATCATT GATT AATAA-GTTTCGC        TTTAAATTAGTTTTT  72 39
 CEG42_02265 NONE
        pgsA NONE
 CEG42_02255  501151 ..  501169 -  -6.2  -3.68351   CCTTTATTATTTAAA             TTAAATTA TAG TAATTTAA             TCCCTTTTTTTAACA  65 12
 CEG42_02250  499668 ..  499699 -  -7.5   -4.1552   TAGTTTGTTAATAAA      TAAAAACCTCTTT TTAAAG AAGGAGGTTTTTA       TTTATTAATGATTAT  78 23
 CEG42_02200  487578 ..  487596 -  -7.6  -3.31232   TTTTTTATATAAAAT             TTTAGAAA TTT TTTCTAAA             TTTATTTAATATTTG  69 119
 CEG42_02195  487100 ..  487138 - -14.3   -3.0339   TAAAAATTAACTATA   TTTAATTAAAAAAAGCC TTTAG GGCCTTTTTTAATTAAA   TTTTTAAATCAAGAT 100 21
 CEG42_02095  464923 ..  464935 -  -3.5  -2.98494   TATAATAATATGACA                TAATT CAA AATTA                AATTAGTTATGATAT  45 42
 CEG42_02090  464262 ..  464274 -  -4.9  -3.51948   CAAGTTTAGAAAAAG                CTAAA GCA TTTAG                TGATATAAAAACCTT  56 372
 CEG42_02060  458578 ..  458597 -  -6.5  -6.01725   AATAAAAATAAAAAA            CAACTCT ATTTAA AGAGTTG             TTTCATGTTTTTTTG 100 49
        lepA  456707 ..  456721 -  -2.9  -2.79106   AAATAATATATATTA               GTTTT CACTT AAAAC               TTTTACAAAAGCATC  42 8
 CEG42_02050  455910 ..  455951 - -11.3  -3.08197   TGCGACACACATATA TTATTAAAAAAGATAGG-GT CAT ACTCCTATCTTTTTTAATTA ATTTTTTATTGTATT  84 70
 CEG42_02010 NONE
 CEG42_02005 NONE
 CEG42_02000 NONE
        tsaB NONE
 CEG42_01990  442772 ..  442795 - -11.1  -4.70659   TTTTACATGCAAAAA          CCCACTCTT ATAAAA AAGAGTGGG           TTTTTGTATTATGTT 100 34
 CEG42_01980  441649 ..  441663 -  -4.4  -4.10744   TCATTTAAATAATAA               TAATTT TGA AAATTA               TGAATTAATTAGTAC  60 325
 CEG42_01970 NONE
 CEG42_01965  438715 ..  438727 -  -7.7  -7.14698   AAAAAAAAAAAAAAA                GGAGA AGT TCTCC                TTTTTTTCGATCACA 100 198
 CEG42_01880  426811 ..  426843 -  -5.1  -4.00084   ACTACTAAAACAGAA      GTTAAATTTTTTAGT ATT AATAAAAAATATAAC      ATAAAACTTAAACAA  62 118
 CEG42_01855  413545 ..  413557 -  -3.5  -3.87994   ATTTATTTTTATAAA                TTATT TTT AATAA                ATTCTTCTAAATCAT  52 6
 CEG42_01850  412909 ..  412928 -  -4.9  -5.00642   GAATTCAGATAAAAA            CCAGGCG TTTTTG CGTCTGG             TTTTTATATTTTTTA  73 38
 CEG42_01775 NONE
 CEG42_01770  395658 ..  395679 -  -4.5  -3.61089   TGTGAACAACGAGAA           TTACAACAC AATC GTTTTGTAA            AATTATTTAATAATT  54 231
 CEG42_01715  384410 ..  384431 -  -8.9   -5.0133   TACCTTTTTAAAAAA           CTAACTTTA TTAT TAAAGTTAG            TTAGGTTTATTTTTA  93 38
 CEG42_01710  382285 ..  382312 -  -5.8   -5.1925   TTATAAGCTAAAAAA        TACTA-AATTTGC AAA GCAAATTTTAGCA        TCAATTAGTTATGAA  84 162
        rplU NONE
 CEG42_01445 NONE
 CEG42_01440  341728 ..  341742 -  -8.6  -6.09196   TTTAAAATAAAAAAA               GAGGAA TAA TTCCTC               TTTAATTATTATCTT 100 27
 CEG42_01430  340338 ..  340348 -  -2.6  -3.10091   AGTTTCAAAATTATA                 TTAT ATT ATAA                 AATTATTATTTATGT  41 68
 CEG42_01425 NONE
 CEG42_01420 NONE
 CEG42_01415 NONE
         rnc NONE
 CEG42_01405  336200 ..  336225 -  -7.8  -5.68023   CTATAATTAAAAAAA         CATTAGTTAA TTAAAT TTAACTAATG          TTTTTTTATCCTCTT 100 31
 CEG42_01340  321379 ..  321432 - -17.3  -4.47163   AATTAAAATAAATAA TGATTAAATAAAAAATCTGATAGTC TGTT GGCTATCAGATTTTTTATTTAATAA GAGTCTATTTAGCTT 100 30
 CEG42_01290  304665 ..  304686 -  -2.5  -5.10497   AACGCAGTGAAAAAA           TTTATA-CAA TTA TTGCTATAAA           AGATAGTGTTGTAAC  66 193
        trpS  301664 ..  301675 -  -4.4  -3.52678   AATTTTTCATAAATA                TGGA TTGA TCCA                 CGTAAGGGGCGACCT  53 203
 CEG42_01255  298757 ..  298802 -  -7.3  -3.45181   AAAAAATAATTAATA TAAAAAACTCTAGTTAGTATCT TTA AAATAACA-CTAGAGTTTTTTA TATTAACTTAAAATT  68 28
 CEG42_01245  295547 ..  295565 -  -9.6  -5.01535   TTATAATTATAAAAA             CCAAACCA AAA CGGTTTGG             TTTTTTCTTCTCTAA  95 90
 CEG42_01230  291064 ..  291099 -  -2.1   -3.7614   AAGGATTATTAACAA    CAAAACAATGTGAAT ATTTTA ATTTACATTATTTTA     AAGATTTGTCGTTTT  47 275
 CEG42_01205 NONE
 CEG42_01200  284703 ..  284716 -  -3.9  -3.71321   ATTAAACGTTAATAA               GTTTT TTAT AAAAC                TACTTGAGCCTCATT  52 17
 CEG42_01195 NONE
 CEG42_01185 NONE
        atpH NONE
 CEG42_01175 NONE
        atpA NONE
 CEG42_01165 NONE
 CEG42_01160 NONE
        atpD NONE
        atpC  276860 ..  276879 -  -7.2  -6.32976   AAAAAAATAAAAAAA            CAAGAAGA AAAT TCCTCTTG             TCTTTATTATTTTAT 100 37
 CEG42_01145  276399 ..  276445 -   -12  -4.04764   AAAAGAATTGATAAA TAAAGATAAAACGGCGTT TTGTTAAAATC AACACCGTTTTATCTTTA AATCTTTTTGTTAAT 100 23
 CEG42_01140 NONE
 CEG42_01135  271611 ..  271625 -  -8.6  -5.66338   AAATACAATAAAAAA               CCTTCA AGA TGAAGG               TTTTTGAGTTTATGC 100 266
 CEG42_01095  259943 ..  259959 -  -6.7  -2.75101   ATTATAAATAAAATT              GATTAAA TTT TTTAATC              TTTATTTCATAAAAT  60 20
         ffs  259809 ..  259823 -  -8.6  -5.81622   ATAAAATGAAAAAAA               CTAGCA AAA TGCTAG               TTTTATTACATTAAT 100 33
         upp  259030 ..  259049 -  -4.3  -5.80003   TTAATAAATAAAAAA            GCAATTC ATAATA GAATCGC             TTTTTTTTTTTTTAA  78 62
 CEG42_00990  234216 ..  234246 -  -7.7   -5.2853   CATTTAAAAACAAAA       GAGAGACTCCTAA TTGAC TTAGTAATCTCTC       TTCTACTTAATTAAA  90 51
 CEG42_00985 NONE
 CEG42_00980 NONE
 CEG42_00975  230769 ..  230791 -  -4.3   -5.4182   AATTACAAATAAAAA           CTTTTGTTT ATCAA AAACAAAAA           GATCATTAATTTTGG  73 253
 CEG42_00965  226074 ..  226087 -  -5.3  -3.53761   TAATTTTGGTTTAAA               CACTA ACGA TAGTG                ATCAAACAAACGCCT  59 316
 CEG42_00925 NONE
 CEG42_00920  214441 ..  214457 -  -3.7  -3.70674   GCATTAGTTAAAATA              GTTGATA CAC TATCAGC              GGCCAGACCAGGAGC  52 344
 CEG42_00880 NONE
        tilS NONE
 CEG42_00870 NONE
 CEG42_00865 NONE
 CEG42_00860 NONE
        whiA  200071 ..  200088 -  -7.1  -5.75478   AATGAGATAAAAAAA             CTAGTTT TTAA AAACTAG              TTTTTTAATTTTAAT 100 22
 CEG42_00845 NONE
 CEG42_00840 NONE
 CEG42_00835 NONE
 CEG42_00830 NONE
 CEG42_00825  193119 ..  193150 -  -6.1  -5.01042   AACTTAAATTAAAAA      CCACTAAAGC-TAA GTATT TTATACTTTAGTGG      TTGATTTTAATTAAT  81 32
        pepF  190169 ..  190194 -  -4.7  -6.09196   GTTAAAATAAAAAAA         GATTGGGTGGT GTTA ACTACTCAATC          TTTTTTTATGAAAAA  85 145
 CEG42_00810  189455 ..  189477 -  -2.8  -5.31059   ATACTAATTAAAAAA           TATGATAAAT TAA AACTATCATA           AAAAAATACAACTAT  63 140
 CEG42_00670  151483 ..  151493 -  -2.6  -3.32022   TTTCTTAGACATTAA                 TAAT TTA ATTA                 TTCTTCATTTGTTTT  42 19
 CEG42_00665  150527 ..  150543 -  -6.7  -3.15228   ATGATAAAAGAAGTA              TGATAAA GGT TTTATCA              TTATATTTATTCGTT  63 419
 CEG42_00650 NONE
 CEG42_00645 NONE
 CEG42_00640  143461 ..  143473 -  -3.5   -3.6707   TTTAACAAAAATATA                TTATT TTA AATAA                ATTATTTATTTTGAT  50 27
 CEG42_00630  141032 ..  141054 -  -2.2  -3.14962   TCATTATTAAAACCA           TTTTATTA TTTATTT TAATAAAA           ATTAAGCTCTATTTC  40 27
 CEG42_00625 NONE
 CEG42_00620 NONE
 CEG42_00615  137512 ..  137524 -  -3.5   -3.1577   ATTTAATAGTTAATA                TTTTA TTA TAAAA                AACCAATCTTTAATG  45 56
 CEG42_00610 NONE
         tmk NONE
 CEG42_00600 NONE
 CEG42_00595 NONE
 CEG42_00590  132882 ..  132900 -  -4.6  -4.19342   AAAATAACTAAACAA             CACAATTT TTA AGATTGTG             TAGTATCATTATACA  61 125
 CEG42_00585  131242 ..  131254 -  -4.9  -3.01497   TTATTTCAAATTAGA                TACTT TTA AAGTA                TTAAATTTTTGGAAT  53 26
 CEG42_00580 NONE
 CEG42_00575  127368 ..  127381 -  -3.9  -2.84276   ATCGTTAATTAATGA               TAATG AAGG CATTA                ACTAATCACCTCTTT  46 23
 CEG42_00570  126427 ..  126442 -  -4.7  -5.88565   TCTATAATAAAAAAA              TGTGC AAATAA GCACA               TTTTAATTTATCTTT  82 33
 CEG42_00565  124325 ..  124350 -  -8.3  -4.90266   GTTATTAATTAAAAA         CCGGCATCTTT TATA AAGGATACCGG          TTTTTAATTCTATTT  86 189
 CEG42_00505 NONE
        rnpA NONE
 CEG42_00495  113598 ..  113615 -  -2.7  -2.55213   GATTTATTCAAGTTA             GCTAATT CCTA ATTTAGC              AAGTTTTGATTCAAT  38 5
 CEG42_00490  112742 ..  112754 -  -3.5  -2.65656   AATTTAACCTACAAC                TTAAT TTT ATTAA                TTATTTTATCTATTC  43 31
 CEG42_00485 NONE
 CEG42_00480 NONE
 CEG42_00475 NONE
 CEG42_00470 NONE
         fba NONE
        ychF NONE
 CEG42_00455 NONE
 CEG42_00450 NONE
        ylqF  104721 ..  104733 -  -3.5  -3.75169   TATCACCTCATTAAA                TTATT AGC AATAA                TGATTTATTTTTAAA  50 45
 CEG42_00440  103970 ..  103983 -  -2.5   -2.9789   ACAATTGTAAATAAT               TATAA TATT TTATA                GTTGTTGTTTAATTT  39 34
 CEG42_00435 NONE
        trxA  101509 ..  101520 -    -3  -3.31274   TAAGCAATAATGCAA                TAGT TAAA ACTA                 ATGAATTTAAATTAT  45 40
 CEG42_00425  101329 ..  101342 -  -6.7  -5.76237   TATATAAATAAAAAA               TAGGG TTTC CCCTA                TTTTTAATTATTAAT 100 40
 CEG42_00420   99674 ..   99688 -  -5.8  -3.98627   TTATTAATATAATAA               CTTTTA TTA TAAAAG               TAATTGAAAAATATT  65 17
 CEG42_00415   99294 ..   99305 -    -3  -3.13728   ACGATTCATATTTAA                TAGT CTCC ACTA                 AATAAAGATATTTAA  43 37
 CEG42_00410 NONE
        deoC   96637 ..   96653 -  -5.1  -6.01187   AAGTAAACAAAAAAA              GGTTTAG ATG CAAAACC              TTCTTTTTGTTTTTT  86 39
 CEG42_00400   94864 ..   94895 -  -3.9  -4.85177   AAATGATAGCAAAAA      TTAACGACCTTTT TAAAAG AAAAGATGGTTAA       TTTTTATATTTTATA  65 86
 CEG42_00395 NONE
 CEG42_00390   91474 ..   91520 -  -6.3  -5.02323   TTATCATAAACAAAA GTCGATGCATATAAGTTTTA CGAGCCTT TAAAACTTATATGCATT-AC TATTATATTATTTTT  81 51
        rplM NONE
 CEG42_00355   84942 ..   84968 -  -9.7  -3.72788   CCTTATAAGATATAA         TAAAAATCCAT ATAAA ATGGATTTTTA         AATGTTTAATAATTA  82 49
 CEG42_00350 NONE
 CEG42_00345   83006 ..   83046 -  -7.1  -5.84381   TCATCAACAAAAAAA  TAATTAAAAACCTGCAA GGTTAAA TTGCTGGTTTTTAATTT  TATTTTCAATATTTA 100 25
 CEG42_00330   75569 ..   75596 -  -6.5  -5.09521   TTAATAAATTAAAAA        GTATTAAGAAT TATACT ACTCTTAATAC         TTTGTACAATTAGTG  83 51
 CEG42_00325 NONE
 CEG42_00320   72691 ..   72723 -    -5  -6.28967   TATAAATAAAAAAAA     CCAAGCTGTCAAGTA TTTT TACTTAAC-GCTTTG      GTTTTTATTTTAGTA  91 30
        rpsP NONE
        trmD NONE
        rplS   71210 ..   71234 -  -5.1  -6.15717   TAAACATAAAAAAAA          CAACAACTATT TAT AGTAATTGTTG          TTTTTATTCAAATAA  91 47
 CEG42_00300   69602 ..   69616 -  -6.4  -6.47325   AAAAAATAAAAAAAA               TGGTCA CGA CGACCA               TTTTATTTCTCATTA 100 46
 CEG42_00295 NONE
 CEG42_00290   68027 ..   68038 -  -4.4  -4.98255   CTTTAATGACAAAAA                CCAT CAGC ATGG                 CAATGATGAATACTA  70 1
 CEG42_00285 NONE
 CEG42_00280 NONE
 CEG42_00275 NONE
 CEG42_00270   63778 ..   63796 -  -5.4  -3.36273   CTGGGCGAATAGTAA             TTTTGTCT GGT AAACAAAA             CGTTTTTTGTGATTA  57 93
 CEG42_00260 NONE
 CEG42_00255 NONE
 CEG42_00250   52831 ..   52860 - -11.1  -2.64551   AAAATTATTTAGAAG       TTTAACTTTATTT TGAA AAATAAAGTTAAA        AATACTATAGTATTT  84 108
        ssrA   52111 ..   52131 -  -3.3  -5.86465   AATAATATAAAAAAA            TCATGGC ATTATTA ACCATGA            TTTTTGGTCACAACT  74 96
 CEG42_00235   50929 ..   50942 -  -5.3  -3.88998   AGTTAAATTAAAATA               CGTTA TTTT TAACG                TTTTGAATTTGTGTT  59 20
 CEG42_00230 NONE
        rpsR   50084 ..   50131 -  -3.8  -3.68351   TCCTTATTATTTAAA TAAAACGAACATATCATT AATTATTTATAA AATGACACATTCGTTTTA TTTTGATTTTAATTA  50 38
 CEG42_00220 NONE
 CEG42_00215 NONE
 CEG42_00210 NONE
 CEG42_00205 NONE
 CEG42_00200 NONE
 CEG42_00195 NONE
 CEG42_00190 NONE
 CEG42_00185   41510 ..   41524 -  -4.9  -6.00814   AATAATTAAAAAAAA               CGGCC GTAAA GACCG               TCTTTTTTTAATGTT  86 53
        rplK NONE
 CEG42_00170   33237 ..   33266 - -13.1  -3.88464   TTAAAAATAGGTAAA       TAAAAGGTGTTAG ATAA CTAACACCTTTCA        CATGTTTTATTATAA 100 50
 CEG42_00165 NONE
 CEG42_00160 NONE
 CEG42_00155   29632 ..   29650 -  -6.8  -5.80003   CCAATAAATAAAAAA             TAACCTGT TTA ACAAGTTA             TTTCATCAAATTACT 100 36
        truA   28680 ..   28690 -    -4  -3.29195   ACAATTGAAAAAGTA                 TGTA TTC TACA                 AGCGGGATTATCAAG  47 209
 CEG42_00140   26056 ..   26068 -  -3.5  -2.71503   TCGAACAATAATCTA                TTAAT TAT ATTAA                AAATAAAGCTATTTA  43 43
        rpmG NONE
 CEG42_00130 NONE
 CEG42_00125   24665 ..   24680 -  -7.6   -5.6473   ATAAGAGTAAAAAAA              CCATCA ATAA TGATGG               TTTTTATTTTAAATG 100 39
         cdd NONE
 CEG42_00115   22377 ..   22403 -  -8.9   -5.8901   ATATAAAATAAAAAA         TCTACTTCAGT TTTGC ACTAAAGTAGA         TAATATAATTCAATT 100 103
 CEG42_00105 NONE
 CEG42_00100   17134 ..   17146 -  -3.5   -5.0133   TATTTTTTTAAAAAA                TTAAT TAA ATTAA                ATCATGAATCTTATT  65 94
 CEG42_00095 NONE
 CEG42_00090 NONE
 CEG42_00085 NONE
        fusA   12217 ..   12227 -  -5.4  -4.90002   GAATACATAATAAAA                 GGTA TTA TACC                 TTATAATTATAACAT  74 77
         tuf   10919 ..   10946 -  -3.5  -5.72616   AGTTATAGAAAAAAA        TGACCAAGTTT ACTAAA AGACTTAGTCA         TTTTTTGTTTTTTGT  76 53
        pepF    9021 ..    9031 -  -2.6  -3.07401   AAAACACCATATAGA                 TTAT ATC ATAA                 AATATATTAAAAATT  41 39
 CEG42_00065    7150 ..    7179 -  -9.7   -5.1244   CCATTAATATAAAAA       TATTATTTAATAT GTGG ATATTAAATAATA        TTAATTTTGACGAAC  95 26
 CEG42_00060    5221 ..    5258 -  -6.5  -4.77157   TTAATTGATTAAAAA   CATTAAGAAGTACACCC TAAT AAATGTATTTCTTAATG    TTTTTATTTTTCGAA  81 65
 CEG42_00035 NONE
 CEG42_00030     786 ..     809 -  -8.4  -3.90318   CTAGCACTCCACAAA          TAATACTTAA ATTT TTAAGTATTA           CTTCGTGTTTTTATA  79 43
 CEG42_00025 NONE
 CEG42_00020     600 ..     615 -  -3.2  -2.78679   GGGGTTTAGCTAAAT              CCCACT AATA AGCAGG               TTGAGTATATAATGG   0 38
