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 HYG85_00165   32990 ..   33000 +    -4    -3.646   TGAAGTATTCTTTGC                 TTCT GTA AGAA                 TTATCTCTGCTTCAG  53 242
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        aroF NONE
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        aroA  114969 ..  114984 +  -4.8  -3.10732   ATAAGTGATTTATAA              GTTTTT TTTA AAAAAC               TATTGGAATTACTCT  52 26
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        deoD  368053 ..  368065 +  -4.7  -3.12021   TTTACCCGAAAATTT                GTGGC GAA GCCTC                TTAAATGAATTATTT  53 251
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        mnmH  467501 ..  467521 +  -8.4  -5.20216   AATAAGATACTTTCA            GACAATAG TGTAC CTATTGTC            TTTTTTAATGCTATA 100 282
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        ltrA  643277 ..  643293 +  -7.9  -2.62616   GAGAACCGCCGTATA              CCGAACG GTA CGTACGG              TGGTGTGAGAGGTCG  67 40
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 HYG85_03145  697234 ..  697244 +    -4  -5.19251   CAATCTCATGAGTTA                 CATA AAT TATG                 TTTTTCTTGGTATTA  74 303
 HYG85_03175  701392 ..  701416 +    -8  -3.99353   TATCTCTTCCATAGA         TGCTGTCTGTT CTTC AACAGAC-GCA          TTTACTTCCTCTGTG  79 296
 HYG85_03185  704379 ..  704390 +    -3  -4.08064   AAACATCAAATACAT                CATT GGCT AATG                 TTTTAGCCCACCCTT  55 412
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 HYG85_03340  745984 ..  745994 +  -2.4  -3.94188   AATGATATACCTCTT                 GGTG GAA CCCC                 TTGTTTGCAATCAGT  51 228
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 HYG85_03470  777161 ..  777199 +  -9.3  -2.80988   ACATAGTAATATTTC  CAAAAAAAGACT-TGATA TGTT TATTATAGTCTTTTTTTG   TAATTGCTAATATAA  73 78
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 HYG85_03620  808540 ..  808563 +  -3.8  -4.18737   CGTCAATAAACCTTA          TAGCAGCATC ACCA GTTGCTGATA           TTGTCTTTTTGTTAA  60 310
 HYG85_03695  827456 ..  827478 +  -9.3  -3.96224   CATTTGACGACGAAA           GCATAGAAT AAAAC ATTCTATGC           TTTCTAAATAATTTA  83 15
 HYG85_03720  832649 ..  832659 +  -2.6  -4.97159   TTACCTTTTTTTCTT                 TTAA GGC TTAA                 TTATTTTTTGTTTTT  63 235
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 HYG85_03765  843433 ..  843454 + -10.2  -5.42514   AATAATAAGAAGAAT           CCCACGAT ACTTTA ATCGTGGG            TTTTTTCATTTCTCA 100 36
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 HYG85_03835  856979 ..  857028 +  -8.3  -4.73864   TTATTAACTTATTTA AGACAACAGTTTAAATACCCTAT ATATTG AT-GGGT-TTTAAACTGTTGTCC TTTTATATTACTTGC  93 51
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 HYG85_04140  932639 ..  932658 +  -6.4  -5.38054   ATTAGGTATATTTTA            GACTTGCA AATT TGCAAGCC             TTTTTCTTTCTAGGA  93 36
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 HYG85_04250  951352 ..  951364 +  -4.9  -3.81256   TCATCTATTGCTATC                TCATA TTT TATGA                TTAATTTTTCAAGCT  60 316
 HYG85_04265  954877 ..  954900 +  -9.6  -3.38297   GTAATTACATTCTAA          GGGCTGTCTA ATAA TAGGCAGTCC           TTAATCTATATTAAT  80 51
 HYG85_04270  955783 ..  955801 + -14.6  -3.39923   ATTGAATAACCATGA             CCACCCGT ATA ACGGGTGG             TTCCATTTTGCTACT 100 32
 HYG85_04275  956970 ..  956982 +  -3.4  -3.32997   CCCTATATAAAATGT                CCTT TAAAC AAGG                TTCAATTTATGAGGA  47 98
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 HYG85_04315  965613 ..  965656 +  -6.3  -2.69471   ATTGTATAAGTTGAA TAGAACTAAACAATTGCTG GCTCTA TAGCAATTATTTAATTCTA CTTATATAAAGCTGA  58 27
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        pdxA  973028 ..  973038 +    -4   -3.1247   TGCAGTTTACTAGAT                 TGAT TTA ATCA                 TTAGATGTGACCCAT  47 28
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 HYG85_04385  980037 ..  980072 + -10.7  -3.24411   AATGAATAATTAAAA    GACTCTGTTTAGT AACTAACACC ACTAAACAGAGTC     TATATTTAAAAAGCT  85 32
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        htpG  986157 ..  986179 + -10.6  -5.65927   TATTTGATTATTTCA           CAGTCGGC ACATAAC GCCGACTG           TTTTTTATTTAAATC 100 340
 HYG85_04415  987455 ..  987487 +  -7.9  -4.17416   TCTAAATCATTAAAA      CCACTGAATAC ATTTTGATTCA GTATTCAGTGG      TTATTTATATACTAT  80 36
 HYG85_04420  988334 ..  988368 +  -5.9  -4.31587   AAAAGTAATATTACG    TCAGCAG-ATTAAACG TCCA TGTTTAAAACTGCTGA     TTATTATTTTTAAGG  69 42
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 HYG85_04950 1080389 .. 1080401 +  -4.9  -3.73386   TTCTTATGTAACAGG                TGATA TAT TATCA                TTTAAATAGTTATAT  58 70
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 HYG85_05375 1178763 .. 1178785 + -12.1  -2.98761   TCTAAAATATTCAAT           TAGGCAAGC ATAAG GCTTGCCTA           TAATTTACTGATGGT  91 23
 HYG85_05385 1181308 .. 1181343 +  -8.5  -3.32294   AAACTTAACCAATAA    GGGCTGTA-TAAAGAT ATCAA ATCTCTAATACAGCCC    TTGATACTATTTATT  75 42
 HYG85_05495 NONE
 HYG85_05500 NONE
 HYG85_05505 1210529 .. 1210539 +    -4  -2.78596   CATTTGTTGCTATTA                 TCTA ATT TAGA                 TGTAGTAACAACCTG  45 104
 HYG85_05510 1211609 .. 1211661 + -13.3  -3.73858   GGGCTTTTATTTTTA TGGGCTAAATATATTACAGTATGA TTTTAC TTGTA-TGTAATATATTTAGCCCA TTCGTTTTAATATAA 100 76
 HYG85_05520 1214138 .. 1214160 +  -7.9   -3.2511   TCATAATACATTTTA           GTAAATCTT CTAGC AAGATTTAC           ATTTTATGAGTCAGC  70 77
 HYG85_05530 1215085 .. 1215107 + -11.4  -3.37761   CCATATAAGTTAAAA           TGGCTGTATA TTA TGTACAGCCA           TTCCTATGTTCCAAT  87 50
 HYG85_05570 1225274 .. 1225284 +  -5.4  -3.22618   TATTATAATACCTCT                 TCCA TAA TGGA                 TATATTATATAACAG  55 63
 HYG85_05705 1264793 .. 1264809 +  -3.7  -5.58454   ATAGAATAATAAAAA              TATAACC TTA GGGTATA              TTTTTTTAATATAAA  76 46
 HYG85_05710 1265325 .. 1265376 + -12.7   -3.2302   ATATTCTAAATAAAG TAAGATAGACTCTATTTAGCTGT TAATTC ATCTCTAAATAGAGTCTATCTTA TATATTATAATTAAA 100 41
 HYG85_05735 NONE
 HYG85_05740 1271150 .. 1271169 +  -7.8  -3.40592   TATTTCAGAAAAAAA            GCACCAGC TATT GCTGATGC             TTAACTTTTACTCTC  72 84
 HYG85_05865 1335410 .. 1335422 +  -2.7  -4.46212   TAACTAATGACATTT                TTGGT ACC ACTAA                TTTTCTCATAGAAAA  58 179
 HYG85_05930 1347925 .. 1347956 + -14.7  -3.57462   GTTTTTCATAGGCTA      CTTTACACTACCT TCTTAT AGGTAGTGTAAAG       TTTAACACTACACTA 100 276
 HYG85_05935 1349764 .. 1349774 +  -2.6  -4.97159   TTACCTTTTTTTCTT                 TTAA GGC TTAA                 TTATTTTTTGTTTTT  63 235
 HYG85_06335 1411892 .. 1411904 +  -4.9  -3.21726   TCCCTCTTGGCTCTA                TTGAT GTC ATCAA                TTGGCTGTTATGCAA  53 439
 HYG85_06435 1428115 .. 1428147 +  -2.2  -2.75343   CTGGAATCAATACTC      CGTCAAAATTAT GCTTCTTCA ATAATTTTAACG      CTTTCACCATATCAA  40 330
 HYG85_06490 1440869 .. 1440879 +    -4  -5.48063   TTTTGAGTAATCTCT                 GTAA TAC TTAC                 TTTTTTATCTTCCAT  77 338
 HYG85_06515 1448125 .. 1448158 + -12.7   -3.9243   TTATACTCCCCTCAT     CAAAATAACCACATG GAGA CATGTGGTTATTTTA      TTGTTTAAAACCTTA 100 244
 HYG85_06525 NONE
 HYG85_06530 1451090 .. 1451114 + -10.2   -4.8048   TCTACAAATCCTAAG          GAAAAAGGTT CTAAT AACCTTTTTC          TTTTTAATATCAACA 100 81
 HYG85_06535 NONE
 HYG85_06540 1452665 .. 1452680 +  -3.2  -3.37474   TTAAATATATACCGA              CCACTA TATG TTGTGG               TTATGCAATATTATA  47 110
 HYG85_06545 1453292 .. 1453350 + -16.6  -4.96468   ACGCAATAAAGCGTA GCGGTATATAGATAGTTTTTC-TT-GCC TGAAC GGTTAGCGAAAAACTATCTATATACCGC TTTTGTTTGCCTTTG 100 50
 HYG85_06580 1461017 .. 1461050 + -11.3  -5.27206   TAGCAAGACGTAAAA     TAAGACTACATAG TCAAATAT CTATGTAGTCTTA      TTTTTGTTCTATCTA 100 141
 HYG85_06610 1468363 .. 1468383 +  -3.3   -2.6063   TAATCTATATACTAT            TTATAGGCT TAT AGCATGTAA            TAAATTATAAATGCA  42 12
 HYG85_06615 1469030 .. 1469048 + -13.2  -4.42386   GCATACAAGCAAAAA             GCACTTGG ATA CCAAGTGC             TTTTATCAATGCGGA 100 115
 HYG85_06710 1483152 .. 1483165 +  -3.9  -3.81447   AATGTCCATGAGTAG               CAAAA ATTC TTTTG                TTATTATGAAATATG  56 389
 HYG85_06720 1484601 .. 1484621 +  -6.9  -5.29716   TATAAGTGTATATAA            CGAGCTT AAATTCA AAGCTCG            TTTTTATTATATTCA  95 80
 HYG85_06735 1487935 .. 1487967 +  -4.2  -2.59822   AATAATACAGATTAA     GT-ATAAGGGGCTGT CTCA ACAGCCCCTAATCAA      ATTCATCATTATTAT  48 36
 HYG85_06745 1489388 .. 1489434 + -13.3   -3.4758   ATAGAAATTGATACA TGGGGCTATTTGATATTAACGT AACA ACGTTT-TATCAAACAGCCCCA TTAATATTGTTAATC 100 30
 HYG85_06760 1493145 .. 1493176 +    -6  -5.47218   ATCAGTACCCAAAAA      GTATCTA-AGAGCCA AAG TGGTTCTTTAGGTGC      TTTTTTTGCATGACA  90 152
 HYG85_06870 1515863 .. 1515878 +  -2.6  -2.92398   GTTATATGCACAATT              TGACAA AACA TTGTTA               TCTGCTATAATTTTT  41 230
 HYG85_06875 1517856 .. 1517868 +  -4.9  -3.84961   AATCGACTCTTTTAT                TTGTA GCA TACAA                TTTACTAATTACATA  60 339
 HYG85_06880 1518475 .. 1518495 + -10.5  -3.93004   ATATAAAATTAAAAA            GGGGTGAAT TAA ATTCATCCC            TTTCTAGAATATTAT  93 40
 HYG85_06900 1523020 .. 1523047 +  -8.6  -5.14985   GTAAAAATAATATAA        GAGAATAGAC CAAATGAA GTCTATTCTC         TTTTTATATATTTAG 100 18
 HYG85_06980 1548675 .. 1548688 +  -6.7   -4.2704   ATGTATTTTCTAAAG               CAGAG ATAT CTCTG                TTTATTAATAATGCC  74 58
 HYG85_06990 1555153 .. 1555167 +  -5.8  -3.54475   TAAAGTATTACAAAA               TAATAG ACT CTATTA               TTGTATAATAAACCA  62 48
 HYG85_07065 1571824 .. 1571834 +  -6.8  -4.55023   GCTATTTGTAGAACT                 GGTC CAA GACC                 TTTTATCATATTAAC  79 393
        rpoN 1578842 .. 1578856 +  -4.2  -4.33576   GAGAATAGGGACCAA               TTGCAC CAG GTGCCA               TTTCTGTGTTTATTA  60 359
         hcp 1586640 .. 1586671 + -16.2  -4.85396   TCATATTGCTCCAAA      TATAAAAGCACAGA TTTC TCTGTGCTTTTATA       TTTTATTATCCTTCT 100 53
 HYG85_07130 1589030 .. 1589056 + -16.8  -5.83226   CAACAACCTTATCCA         CTAGACTAAAGC CTA GCTTTAGTCTAG         TTTTTTTATTACCTT 100 58
 HYG85_07200 1607834 .. 1607864 +  -8.6   -2.8619   TTACCACGTTTTTAA       TATAAGATATAATA AGA TAATATATCTTATA       TATACTCCATTTTAA  71 77
 HYG85_07215 1611263 .. 1611281 + -13.2  -2.87354   AGTAATAAAATAAAA             GGGACAGT TGA ACTGTCCC             TCATTCCTTCCTTGA 100 77
 HYG85_07220 1612875 .. 1612896 +  -4.4  -4.89966   AAATCGTAAAAAAAA           GACGACCT CATTAT AAGTCGTC            TTTCTTTTTAACTCT  69 496
 HYG85_07410 NONE
 HYG85_07415 1659703 .. 1659714 +    -3  -3.18155   ATGCTGCAATTGTTT                TATC TATG GATA                 TCTTAAGGTTTTTCT  45 67
 HYG85_07420 1660895 .. 1660918 + -12.6  -5.73978   ATAAAGGTTGGGACC          GTATGGCATT CTAA AATGCCATAC           TTTTTTATTTATAAT 100 12
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 HYG85_07465 1668832 .. 1668871 + -13.4  -4.72333   ATGATACTGATACTA  TAGAAAAGTAGTTTTT-AT AAT ATGAAAAACTACTTTTCTA  TTTTTAAATATAATT 100 15
 HYG85_07480 1672554 .. 1672567 +  -6.7  -3.47804   AAAAGGTTAATTATT               GGAAG TCTT CTTCC                TTAATTATAAATTGT  67 31
 HYG85_07485 1674178 .. 1674197 +   -15  -3.74088   ACTCTTTTAAAAATC            GCAGGGGG CTAG CCCCCTGC             TCTTATTTTAATATA 100 31
 HYG85_07555 1697762 .. 1697778 +  -6.7  -2.88243   TTTAATCCTATCTCT              CTATTAA ATA TTAATAG              TAATATTATTGTGGC  61 492
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 HYG85_07575 1699861 .. 1699902 + -11.7  -3.35371   TTTCATTATAATTAT CATGACAGTAGCGGGCTAA GATA TAAGTCTGCTGCTGTTATG  TTAGTTACAGATATA  90 77
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 HYG85_07585 1701700 .. 1701721 +  -5.9   -5.1417   TAAAACAATTCTATT           TGAGTCATA GGTC TATGACTCC            TTTTTAGTTTTGTGA  84 16
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 HYG85_07595 1704619 .. 1704664 +  -6.6    -3.262   ATTGATAATAAAGAA CCTATATGAT-A-CAGAGTAAT TAAT ATTAGTCTGGTTATCATATAGG TAGTTTATTTTAGCT  61 47
 HYG85_07630 1709331 .. 1709375 + -11.7  -3.16267   ATGAATTACACTAAA ATATATGCTCTATAGCTTGTA AAA TACAAACTATAGAGCATAAAA TTAAATATAATTAAA  90 126
 HYG85_07645 1711703 .. 1711719 +  -5.9    -3.136   TCCATTCATCTATAT              CTTTGTA ATC TGCAAAG              TCTATTAAATATTGA  57 436
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 HYG85_07665 1712779 .. 1712816 +  -9.3   -4.7497   TACTGACAGATAAAA   TTAAAAGGCACTCTCTA AGTA TTGAGAGAGTCTTTTAA    TTTTTAATACATACA  93 46
 HYG85_07715 1727892 .. 1727922 + -12.8  -5.27206   ACTTTATTTATAACT       TAACCTATCATCTT TTT ATGATGATAGGTTA       TTTTTATTATATCTA 100 40
 HYG85_07740 1733708 .. 1733746 + -11.4  -5.43866   ATTTAATGAATAAAA  TAGATAACCAGCTTAGT AATAAA ACTAAG-TGGTTATCTA   TTTTTTTAACCCTTC 100 46
 HYG85_07780 1740386 .. 1740414 +  -6.1  -5.25699   TGATATATATGAAAA        TATCCTAACGG CAATCAA CCATTAGGATA        TTTTTATTATCTAAT  84 38
 HYG85_07865 1775326 .. 1775336 +  -5.4  -4.41348   TATAATGAGAAAATG                 GCAT GTT ATGC                 TTTCTTTACAAGGCA  68 80
 HYG85_07920 1784434 .. 1784464 +  -6.4  -2.98169   AATGTATAAAAAATA      GAG-TTCTACATA ACTAAC TATGTAGAAACTC       TATGTGAATTCTTAA  59 109
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 HYG85_07940 1789139 .. 1789152 +  -3.8  -5.24989   CCGAACTCTAAAAAA               GGAC GTATAA GTCC                TTTTTTACTGTCTGC  70 30
 HYG85_07950 1793984 .. 1793995 +  -4.4  -4.10188   TATAAGCGTGCTTAT                GAAG TATT CTTC                 TTCTTTGTCCGTATC  60 356
 HYG85_08000 1804559 .. 1804606 + -13.1  -2.70275   TTCATTCAAAATTTA AAAAAGGAGCAATTATTACAT CTATTA ATGCAATAATTGCTCCTTTTA TACTATATAGAATTA 100 258
 HYG85_08030 1810287 .. 1810315 + -14.7  -3.68962   AGGTTAGAAAGTATT        AAGGGGACTGTAT CTT ATACAGTCCCCTA        TTATCATTTGTTAAA 100 34
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 HYG85_08115 1832430 .. 1832440 +    -4  -2.63501   CTATATAATCAAAGT                 TAAG TAC CTTA                 TCAATTACTTGTTCA  46 144
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        adhE 2424628 .. 2424670 + -12.4   -2.9518   ATATAATGTAAATGA TAACAAAAAAGAAGGG TTGCCATTTTT CCCTTCTTTTTTGTTA TATATAAATATTAAC  91 43
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        dnaA 2445776 .. 2445788 +  -5.5   -3.5944   GCAAAACATTTTGCA                GGGGT ACA ACCTC                TTTCAACCTGTGGAT  59 193
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        recF 2448623 .. 2448636 +  -3.1  -2.88544   ATAGATAAATATATG               CGTAT AATT ATGCG                TATCTAAACATAGAG  43 172
        gyrB 2450648 .. 2450660 +  -4.9  -3.55801   AATAATAAATTAACA                TTAAC ATT GTTAA                TTTGGGAGGATTAAT  56 98
        gyrA 2453248 .. 2453281 +  -9.8  -5.49568   AGAATAACAAAAAGA     GGTTACATAAAGTT CAATAA GACTTTATGTAGCC      TTTTTCTTTTGAATT 100 45
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         rrf 2464689 .. 2464719 +  -7.1  -3.45054   TTCATATGACACTAT       CAAAATTCTTTAA GATGA TTAAAGAATTTAG       TTATCAGTTATAGGA  65 59
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        nagA 2514242 .. 2514257 +  -3.4  -5.38321   GAAATGAAGCTGTTT              TTAATT GCCC AATTAA               TTTTTTATAATATTT  72 112
 HYG85_11000 2515587 .. 2515633 + -13.8  -3.18912   CCTCGTAGACGGTCA GGAAGTAAAGGGGTATGTTACG CGA CTTCACATACCCCTATACTCCC TTCGTCAGTGAGTAG 100 33
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 HYG85_11010 2518726 .. 2518740 +  -4.2  -5.26316   TCACGTCGAATGAGT               GCATTG TAG CATTGC               TTTTTTATGCCATCA  75 408
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 HYG85_11030 2524431 .. 2524441 +  -3.2  -5.49568   AAATCATCACCAAGG                 GCTT CTA GAGC                 TTTTTCTTTTAGATT  74 253
 HYG85_11040 2527630 .. 2527640 +  -5.4   -2.9585   TGAAAACCATATATA                 GTGA TAA TCAC                 TCTCGTTACATTTGT  54 99
        metG 2530318 .. 2530356 + -12.1  -3.98944   TGGCTTAGGTTAAGG  TTGGGTGTATGTACTATA TTAT TAT-GTATATACACCCAA   TTATCTTGTTTTATA 100 216
 HYG85_11050 2531261 .. 2531293 + -10.8  -3.23422   AATAGATAGTTTTAG      GGTTAAGCCATAAT CAAGT ATTATGACTTAACC      TATCTTCTAATTACT  85 36
        rsmA NONE
 HYG85_11065 2534158 .. 2534176 +  -9.6  -5.75342   ATTTACATATTTTTA             TCCTACCG CCG TGGTAGGA             TTTTTTTTACAAACA 100 127
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        acpP 2538965 .. 2538987 +  -8.5  -3.92659   ATGATTAACTTATAA          CCAATCTGGG GGCA CCC-GATTGG           TTTAAATTTTAAGGA  82 44
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 HYG85_11140 2547410 .. 2547461 +  -9.3  -4.35042   AAAGAGTATAATATA GGCAAGAAATTTCTAATTAGGT-AT AATC ATGATCTAATTAGAA-TTTCTTGTC TTGTTTTATAATAGG  86 107
        pdaA 2548945 .. 2548968 + -10.4  -5.22039   ATATTTTTGAATCCT          TGGCAATAGC TCTA GCTATTGCTA           TTTTTTGACTTTGCC 100 355
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        sfsA 2566455 .. 2566471 +  -3.1  -4.07687   AAAGCTGAAGTATTA              TTATAGA CCA TTTATAA              TTTTAAACAAGAGGT  54 20
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         rrf 2596931 .. 2596943 +  -9.1  -3.34043   GATTACAAATACTTA                CACGC CTA GCGTG                TTATGGGCTCATAGC  77 38
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         rrf 2600805 .. 2600815 +  -5.4  -2.83905   TATTGACAAAATTAA                 TGCA CTA TGCA                 TATAATAAATTATGG  53 45
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        rpsF 2603050 .. 2603061 +    -3  -4.08945   TTCTTATTTAAGAGA                TTAG AAGA CTAA                 TTTTAAGGGGGTAAT  54 14
         ssb 2603509 .. 2603522 +  -2.4  -2.92398   AAGTTTTGATGACGA               CCTA CCATTT TAGG                TATAATATGATTTTT  40 13
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        atpE 2641669 .. 2641691 + -12.1  -2.70932   ATTGGCTAATAAAAG           GTGAAAGGG ACCTA CCCTTTCAC           TCCTTAACGAAAGGA  88 32
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        atpC 2647055 .. 2647098 +  -3.2  -4.66163   ATAAGAATATGACAA TACCCGTAGACATAATGCTT ATAG AAGTGTTTAATCTATGGGTA TTTTTGCGTGGAGAT  60 44
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 HYG85_11780 2683385 .. 2683405 +  -8.3  -2.98304   AATACGTTAATGCAG            TTGGGGG ACTCAAA CCCCCAA            GTTCTTATTGAATAT  71 449
 HYG85_11790 2685957 .. 2685987 +  -9.8  -3.97911   GAAAGAAAAGCTATA       TCCCCAGCTCAT TGTATTC ATTAGCTGGGGA       TTTGATATATTTAAT  86 61
 HYG85_11795 2686551 .. 2686571 +  -4.7   -4.6645   ATTTATAACAGGAAG            GCAAGTC TAATTAT GGCTTGC            TTTTCTATGTGTATA  68 16
 HYG85_11800 2687255 .. 2687271 +    -8  -4.57533   TTAGATAATGAAAAA              GCGCTA TTTAC TAGCGC              TTTTATAGTATTCTT  86 33
        asnS 2690162 .. 2690187 +  -3.9  -6.14618   CTTATATAATATAAA         CTCGTTTTTCC AATA GGAATTACGGG          TTTTTTTATTTTATG  86 60
 HYG85_11815 2692266 .. 2692298 +  -3.6  -2.56596   AAGATGATGCAAAAA      CTAATCAATAGATA ATTTA TATTTATAGGTTAG      TAAATTACTAAAGAA  44 15
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 HYG85_11825 2694279 .. 2694298 +  -9.3  -4.62302   ATATAAAAGTAAAAA            CCTCAGG AATTAA CCTGAGG             TTTTTGCAAATATTG  91 68
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 HYG85_11850 2698803 .. 2698820 +  -3.4  -5.60993   AGTTTTGGAGATTAA             GGGAGT GAGTGA ACTCTC              TTTTTTTATAGAAAA  75 26
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 HYG85_11860 2702807 .. 2702842 +  -6.4  -4.15106   TAAAATAAAAAGGAA    TGGATAACGATA GAAAGAAGCAAA TATCGTTATCCA     TTTTAAACATTAATA  70 78
 HYG85_11885 2711647 .. 2711668 +  -2.3  -4.29325   ATATTGTTTTATATG           TTGCTTTGT AGAA ATTAAGCAA            TTTTAAGTATTAATA  53 154
 HYG85_11890 2712378 .. 2712397 +  -3.6  -5.97979   ATCTTAGATAATAAA            CATTTCTA TAAT TAGAGGTG             TTTTTTTATTATTCT  83 189
 HYG85_11900 2713679 .. 2713691 +  -4.1  -4.73388   AAATTGACTCAATCT                GTTCT TCA GGAAC                TTTTTCATCACCATT  65 489
        purR 2718844 .. 2718874 +  -2.6  -4.76075   TATGGTTTTTTTGTA       TATTGCTACTTTTG AAC TGGAAGAAGCAGTA       TTTTATTAATCTAAT  61 196
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        glgD 2721465 .. 2721475 +  -2.6  -3.45321   CTTTTCTGAAATATG                 TAAT ATA ATTA                 TTGTGAGTTATCACT  44 89
       spoVG 2721875 .. 2721895 + -14.1  -4.96848   GGAATGATTCTTCAG            GGCACTTCA TTA TGAAGTGCC            TTTTTGTATGCAAAA 100 34
        glmU 2723436 .. 2723483 +  -4.5  -4.14874   AAAAACGGTAATCTA TATAAGGAAATTGTTTCTA TCTAGAAATT TAGAAATGGTTTCCTTATG TTTTAAAAATATTAT  60 30
 HYG85_11950 2724522 .. 2724541 + -12.2  -4.28548   TTTGATTATGTTAAA            GCCCTAGT ATAT ACTAGGGC             TTTTAGTAAATAAAT 100 71
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 HYG85_11960 2726009 .. 2726019 +  -2.6  -3.34534   AATTGCCTAGAAATA                 TTAT ATA ATAA                 TTGGTATATAATATA  44 76
         mfd 2729589 .. 2729599 +    -4   -2.6583   AAGACATAAAAGATT                 TGAA GGA TTCA                 TAGGTTTAAACTATA  44 12
 HYG85_11970 2730888 .. 2730910 +  -7.1  -6.22691   AATATCTAATAATAA           GGACTAAGA GGTAA TCTTAGTTC           TTTTTTTTATTATTA 100 51
       spoVT 2731634 .. 2731655 +  -9.5  -4.01902   GAACAATAAGAAATA           GACTGGGTT AGAT AACTCAGTC            TTATTTAATGCATCT  87 32
        mazG 2732710 .. 2732723 +  -8.1  -3.09784   AGAATATTCTTAGCA               GCGCA TATA TGCGC                CTTTGTTCAAAATAA  69 74
 HYG85_11985 2733070 .. 2733089 +  -8.6  -6.01187   ATTAATTTCTAAAAA            TCTGCACT ATAT GGTGCAGA             TTTTTTTGTTTAATT 100 49
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         nth 2821256 .. 2821276 +  -3.3  -3.74992   AGCTAATTTAATACT            TGTCATTAT TTT GTTATGACA            TATTATTTTAGTGTT  50 118
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 HYG85_16400 3839714 .. 3839747 + -12.7  -5.61824   TATTGATAAATGCTA     TGAGTGAAGTTGTAT TATT ATGCAACTTCACTTA      TTTTTTTCACTTTTA 100 55
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 HYG85_16410 3843186 .. 3843237 + -14.8  -5.95946   TAAATAGAATTTAAA GAAGTGAGACTTTTAGATTGGTAT AATG GTACCAATCTATAATTTTCACTTC TTTTTTTATTGTTAC 100 206
 HYG85_16415 3844643 .. 3844659 +  -5.1  -5.56263   TGTTAACTGCATTAA              GAGTATC TTG GATTCTC              TTTTTGTTTTCTGGT  85 180
 HYG85_16430 3848010 .. 3848020 +    -4  -3.09289   GTATGACCTGTAAGC                 TGTT TGA AACA                 TCTATTAAGATAATC  48 214
 HYG85_16440 3850379 .. 3850415 + -11.7  -3.99494   TATAAAATTGATAAG    GGGCTATCTTAGAGTGC TAT GTATTCTAGGATAGACC    TTATTATTAACTTCA 100 48
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 HYG85_16475 3857565 .. 3857579 +    -5  -3.96148   TTTACTGGGGTAACG               GCTATT TTT AATGGC               TTTATACTGCAAAAC  60 178
 HYG85_16480 3859187 .. 3859206 +  -4.4  -4.77173   TAAAAAACATAAATG            TC-CACATT GCA AATGTGAGA            TTTCTTTTCTGACAA  69 58
 HYG85_16485 3861679 .. 3861705 +    -8  -5.03314   TAGGATAATAAATAA         TATGCCCCTGTT TAT AAAGGGGGCATG         TTTTTTAGCGCTAAA  95 41
 HYG85_16490 3862000 .. 3862013 +  -2.5  -4.94168   GCAAAGAATCACTTG               TTTAT AATG ATAAA                TTTGTTTTATTCTCT  63 64
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 HYG85_16505 3864660 .. 3864676 +    -3  -5.09426   ATTACTTAATCGACA              TCCAGA GTATA TTTGGA              TTTTTTAAAGTTAAA  69 475
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 HYG85_16545 3875001 .. 3875017 +  -5.1  -4.24606   ATCTTTATAAGCTGC              TGGAATC TTA GCTTCCA              TTTTGAATCTCCATT  66 119
 HYG85_16555 3877563 .. 3877575 +  -3.4  -5.24129   TAATAAAAAATACTA                TTCC AAGGG GGAA                TTTTTTATGAAGAAA  69 187
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 HYG85_16575 3882397 .. 3882408 +    -3  -3.06694   TAGAATATGTTGATA                GTAT ATGT ATAC                 GTTTTAACAATGAAT  44 73
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 HYG85_16630 3894260 .. 3894277 +  -9.9  -5.09225   GTAATAAATTATAAA             GGAGCTT GAAA AAGCTCC              TTTTTTCAATACAAT 100 37
 HYG85_16635 3895380 .. 3895398 + -10.4  -5.80248   TACTATGAATCAAGA             GACTTTCT AAT AGAAAGTC             TTTTTTTATATGTTC 100 470
         ade 3897300 .. 3897314 +  -2.9   -3.6106   CTAAATAAAAAGGAG               TAATG ATATG CATTA               TTTAGAACTATTAGA  46 64
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        hydE 3959412 .. 3959426 +  -2.2  -3.72576   GATTAACTTTTGAAA               TTGTAT TGA ATATAA               TTTAATAAGAGCAAA  47 44
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        trpS 3982342 .. 3982379 +  -4.9  -2.66692   AAAATAACTATCATA   CATTATGCCTAGATGTC TTGT GGAATCTAGGCATAACC    ATTATAATAATAGTA  50 61
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        mglC 3989892 .. 3989926 +  -7.4  -4.33258   GAATATAAGGTATAA     TATAAGAGTTAGCT GGTAAGG GGTTAACTCTTATA     TTTATGTTTAAAAAT  77 248
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        queA 4283279 .. 4283307 +  -3.9  -5.28176   AAAGCAACAACAAGA        CAGGGTTACTG ATGTTTA CAGTAAGTCTG        TTTTTTATAACTAAA  73 94
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         gap 4296011 .. 4296043 +  -5.7  -5.19212   TATAAGGTCCATATG     GTCCTCTCTTGTAG GTCAGA CTAT-AGGGAGGAC      TTTTTTAATACTCAT  84 65
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         rnr 4304856 .. 4304866 +  -2.6  -2.98823   TGCAATAATTATAAT                 TTAT GTT ATAA                 TATATCTCACGGCAA  42 123
        smpB 4305391 .. 4305401 +  -3.2  -3.33092   AATTAAAGATTCTAA                 GCTT ACT GAGC                 ATTTTATATGCATAT  47 56
        ssrA 4305815 .. 4305838 + -11.1  -5.51046   CCTCCATTAGTCAAA          TCCACGACA GGAAGA TGTCGTGGA           TTTTTTATATATTTG 100 32
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        arcA 4467499 .. 4467517 +  -3.2   -2.6999   TCAACAAGTTCAACT             TTTATATC TAA GATAAAAA             TAATATAAATTTTAA  42 78
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 HYG85_16855 3960755 .. 3960772 -    -7  -5.29716   GTAATATAATAAAAA             GTGTGC TATGAC GCACAC              TTTTTCTATGTCTCG  95 31
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        dinB 3887292 .. 3887309 -  -2.7  -2.70044   TATTGTATAAAAAGG             CTAGTGA ATTG TCAATAG              TTTTTTTAATAATAG  40 105
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 HYG85_15915 3720947 .. 3720992 - -10.9  -4.99568   TAATATTAAAGAAAA GTAGTGAATAAATTAT-ATGTC AAT AACTTGATAATTTATTCACTAC TAGTATTCCTATACA 100 123
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        lysA 3714810 .. 3714840 -  -5.7  -5.66868   AAGGAATCAAAAAAA      GCTGT-AACT-CATA TCA TATGGAGTTTACAGC      TTTTATTATTATAAT  91 44
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        pdxT NONE
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 HYG85_14790 3468757 .. 3468789 - -11.3  -3.69449   TAATAGCCTAAAATA      GGCATGAATACTAGG AAA CCTAGCAAACATGCC      CTGAACTTATCAAAG  91 83
         tdh 3447536 .. 3447563 -  -6.4  -2.53263   TGGACGGCGAACTCA        GCAATTTAAACA TGGA CGTTTAATTTGC         TGACGAAATATTCCC  57 90
         kbl 3446079 .. 3446135 - -22.1  -4.77442   AATATAACAAATAAA TAATGGATGCACCCCAACTAACTCTTT AAT AAAGAGTTAATCGGAATACATCCATTA CCAGTTAAAATCATA 100 72
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        bioA 3443719 .. 3443773 - -14.7  -3.13258   AATATATGTAAGAGA TTGGGCTGTAGAATAATACAATT AAACGTTGA AAATGTATTATTCTACAGCCCAT AATTTAATTTCATTT 100 75
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 HYG85_13955 3244489 .. 3244505 -  -2.4  -3.24885   TATATAAATACAAAC              TATTTT TGGTT AAAATA              TTGTTTTTTATACTC  42 8
 HYG85_13950 3243635 .. 3243645 -    -4  -3.57915   GATATTAATCAAACA                 TCTT TTT AAGA                 TTGTTAATACTAACA  50 4
 HYG85_13885 3227314 .. 3227371 -  -6.2  -4.26857   ACTAAAAATAAAATA GGTAAATATATCAAATATAACTA-ATCA TCAA TAACATAGTTATACC-GATATATTTACC TTGTTTTTATTAGGA  72 106
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 HYG85_13805 3207335 .. 3207385 - -10.2  -5.27923   TAAGTTCATAAAAAA GGCTGTCTAATATATTTTTATGCA TAATT TGC-TAAATATAT-TTAGACAGCC TGTAATTATACTAGA 100 53
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 HYG85_13670 3168736 .. 3168771 -   -15  -4.77438   AGTTATTATTAAAAA    TCTCATAGGAATATAC AAAA GTGTATTCCTATGAGA     TAATTTTATGAACAT 100 276
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 HYG85_13620 3154988 .. 3155006 -  -3.2  -4.21885   ATAATAAATCAGAAA             TTATCATT CAA AAAGATAA             TATTATATATATCCT  57 292
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 HYG85_13570 3146040 .. 3146076 -  -4.6  -4.49937   TGAAGAATACCAAAA   GAAAGTTACTG-TACTA TAAA TAGAAGCAGTAGCTTTC    TTTGATTAGTTATTA  66 31
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        gdhA 2858557 .. 2858584 -  -5.5   -5.8187   TATCTAATAAAAAAA        TCTCCTTCCTG ATTTAA CAGGTTGGAGA         TTTTTTATATAAAAG 100 53
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        pheA 2824028 .. 2824064 -  -5.2  -3.31208   TTTGATAATAACACA    GGGGACTATGGG AGAGATGTATTAA CCGATAGTCCCC    TTTTTATAGTTTTTA  57 38
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        pepF 2581780 .. 2581793 -  -9.5  -3.86252   TTTCATTAAATATAA               GGGGC ATGA GCCCC                CCGATATTGAAGCAC  83 413
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        yyaC 2574350 .. 2574368 -  -3.2  -4.15044   TTTTTTCTCAAGAAA             CTATTATT AAC ATTAATAG             TTGTATGTATAGTAA  55 368
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         tlp 1510507 .. 1510523 -  -9.4   -5.7946   TTCCTAAGAAAAAAA              GACCCC ACGAG GGGGTC              ATCTAACAATTTTTA 100 38
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        glnA 1489388 .. 1489434 - -15.5  -2.99948   ATAGAAATTGATACA TGGGGCTATTTGATATTAACGT AACA ACGTTT-TATCAAACAGCCCCA TTAATATTGTTAATC 100 113
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