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        trxA 1374874 .. 1374891 + -12.7  -5.83211   TTTAGATAATATTGA             GCCCGGT TTTT ACCGGGC              TTTTTTGTTTTGCTG 100 62
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        metF 1865590 .. 1865618 +  -6.3  -2.81291   GACTAGACCTTTTTG        TTTCTTTTTAT GGCAATG ATAAAAAGAAA        GTTTAGACTTCTCGA  58 376
        thrA 1869487 .. 1869512 + -10.6  -5.93809   AGGAAGATTTCTAAA         GCCTCATATT CGATAA AATATGAGGC          TTTTTTTTGTAACAA 100 59
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        recQ 2144248 .. 2144304 + -13.6   -3.3487   GAAGTAATAATAGAG TATAAAAACA-AAAAAAGCCTTTTTGA ATAT TCAAAAAGGCTTTTTTATGCTTTAATA TGTATTTAGTTGAAT 100 242
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        raiA 2163783 .. 2163802 +  -8.6  -5.55769   TTATATACATTTGCA            GTCCGTTA GAAA TAGCGGAC             TTTTTTATTGTAAAA 100 80
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 INR75_10515 2401774 .. 2401787 +  -5.3  -3.35002   CTCTTATAGTTCTAT               TTCCT AAAA AGGAA                TGTCTTCTTCTATTA  56 86
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 INR75_10900 2487083 .. 2487101 +   -11  -5.50723   CAGTAAAAATAAAAA             CTCCTGCT TAT GGCAGGAG             TTTTTATTTTGGTCG 100 52
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         rrf 2642185 .. 2642206 + -13.1  -5.86976   CTTGCTTTTTGAAAA           CCCTTACCA GAAA TGGTAAGGG            TTTTTTATTTTATAC 100 36
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        rocD 2649075 .. 2649105 + -12.7  -2.94161   AATCAAATAAGATTA       AAAAAATCCCCGG TTTTT CCGGGGATTTTTG       ATTTATAGCAGTTTA 100 42
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        aroQ 2662579 .. 2662599 +  -5.5  -5.10154   TAATTTAATTCGAGA            TTCCTTC AGATAAA GAAGGAA            TTTTTCATTTTCAAT  79 70
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         lon 2676986 .. 2677005 +   -10  -4.99134   AGTAATAGACAAAAA            GCCTCGAA GAAA TTCGGGGC             TTTTTCGTTTAAGGT 100 47
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 INR75_14930 3363115 .. 3363165 + -13.1   -2.6924   TAATCCCAAACAATC TTG-ACATAAAAAAACCTGGCAAA TAAA TTTACTAGGTTTTTTTATGTTCAA ATTATAAATTATTTC 100 80
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        tatC 3429336 .. 3429349 +  -2.5  -4.46073   CTTATATTCATAGTT               TTAAA TAAT TTTAA                TTTATTATATTCGAA  58 135
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 INR75_15405 3464268 .. 3464278 +  -3.2  -4.81843   TTAGCGCCTTGCAAC                 TGGG AAA TCCA                 TTTCTTTTGATTCTT  67 389
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        purB 3467996 .. 3468022 + -14.6  -4.18506   CAAAAAACTGAATTT         CAAAGGATTGCT ATT GGCAATCCTTTG         TTGTTTTAAACATCG 100 62
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 INR75_15500 3485561 .. 3485578 +  -7.1  -4.32669   GAATTTTAAATAAAT             TGTATTC CGAA GAATACA              TTCTTTTCTAGAATT  77 28
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 INR75_15515 3487484 .. 3487519 +  -6.3   -4.8622   AAAAAATTGTTTCTA   GTGAA-TGCCTCGTGGG CTTA CCC-CGAGGTAGTTTAC    TTTTTAATTGGAACC  80 100
        nhaA 3491141 .. 3491163 + -10.6  -5.38249   TAAAGCATAAAAAAA           GCTGTCTGAT CAC ACCAGACAGC           TTTTTTATAATTAAT 100 77
         upp 3493087 .. 3493098 +  -4.4  -2.82156   GTATTAATAGCATCT                GGAT CTTC ATCC                 TGCTCTTGATTATCG  48 407
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 INR75_15575 3504773 .. 3504811 + -14.8   -4.9725   AACATCCAATATTAG   AAAATAAAAACCCCTCGA AAC TCGAGGGGTTTTTATTGA   TTTTTATGTAAAGCT 100 55
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 INR75_15615 3515310 .. 3515326 +  -5.1    -2.674   AAACGGGCTATTTTC              GTGGC AAAATCA GCCAC              ATGTTTCCCTCTTCA  51 41
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 INR75_15770 3545080 .. 3545102 +  -3.5  -5.49579   TAAAATTAATCGACA           TAGATTCTA CACTC TAGACTCTA           TTTTCTTTTTTCTAA  76 126
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 INR75_15810 3553406 .. 3553419 +  -2.5  -3.87815   ATTTTTAAAAACAAA               TTAAA CCTT TTTAA                TTTATACAAGTCAAA  52 22
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 INR75_15830 3557093 .. 3557105 +  -6.3  -3.62597   AACACAAAACTTCTT                TAGGA TGA TCCTA                TTCTTCGGAACTCAA  64 135
        purL 3560785 .. 3560803 + -13.2  -5.85737   TTATTGAATTAAAAA             GGAGCTGA TTT TCAGCTCC             TTTTTTTGTTCATAT 100 48
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 INR75_15860 3567348 .. 3567364 +  -3.7  -2.62043   TACAGAAGGGGAAAC              CGCTTAG GAA TTAAGTG              TAGATTGATTGTAAA  44 12
 INR75_15865 3567785 .. 3567796 +    -3  -3.08314   TAGAAATGAACGAGA                GTAT CAGT ATAC                 ATTTTACGAATTACA  45 38
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        leuC 3848412 .. 3848423 +    -3  -3.78329   CGGAAAAATAACCGA                CTTT ACAA AAAG                 TTTGAATTAATGGAA  52 4
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 INR75_17440 3953851 .. 3953866 +  -6.8  -3.36515   AGCCCCGGTAATAAT              GGGCGA ATTT TCGTCC               TGTTTCCAAATAAAG  61 324
 INR75_17455 3958301 .. 3958320 + -12.2  -4.63479   TTTCAACCTATATTT            TATCCCGC TTTT GCGGGATA             TTTTAGTTTATAATA 100 76
 INR75_17470 3961483 .. 3961502 + -12.2  -4.74132   CTCAAAAACTAAAAA            GCAGCATC TTTC GATGCTGC             TTTTTGCTCACATAT 100 65
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 INR75_17485 3968014 .. 3968029 +  -2.6  -2.59051   TTGATATTTTAATTA              TTTTGC ATCC GTAAAA               GGTTTTAGTTATTAA  40 37
 INR75_17490 3969473 .. 3969511 +  -8.3  -4.05067   TGTTTGGGTTGAACA   CCGGGATAAGACTTT TGTTGTTTT AAAGTTCTATCCCGG   TATTTTTATGGAATA  81 90
 INR75_17505 3971970 .. 3971983 +  -2.4  -4.53303   TCGTTATCAAAAACG               GTGA GCATGA TCAC                TTTTATCTGGGGATA  61 418
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 INR75_17525 3974558 .. 3974568 +  -5.4  -3.97602   CGGCTAAATTCTAAA                 TCGA TAT TCGA                 TGTTTTTAGCTATAT  63 216
 INR75_17530 3975687 .. 3975709 +  -4.1  -3.12668   AAATCTCTATTAAAT           GGTATCTTC GTTTA GAGGAAACC           TTGAATCTAGAAATA  49 473
 INR75_17535 3976456 .. 3976482 +   -16  -4.71234   CCGAGTAAAAATTTA         GCCGCAATGTCA ATT TGATATTGCGGC         TTTTCTATTCCATTT 100 50
 INR75_17540 3978575 .. 3978588 +  -5.3   -4.4078   AGTAAACAACAAGCT               CATGT TTAA ACATG                TTTTAATTGCAGAAG  69 135
 INR75_17545 3979271 .. 3979284 +  -6.7  -3.21466   TAGAGATGTAATTTT               TACGG AAAA CCGTA                TTGGATTACTAAGTT  62 55
 INR75_17550 3979990 .. 3980001 +    -3  -3.14229   GAGGTCTTATCTTTG                CTAA AAAT TTAG                 TCTTGATCAGGATCT  45 78
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 INR75_17570 3982633 .. 3982643 +  -2.6  -2.59526   AGAGAAATTGCAGGT                 TTTA GAA TAAA                 TAAATTAAATTTATA  40 16
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 INR75_17580 3983748 .. 3983758 +    -4  -2.61429   ATACTTCCCTTACTC                 CTTT CCC AAAG                 ATGTTACTTTAATCT  46 72
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 INR75_17615 3989312 .. 3989322 +  -5.4  -5.18371   AATATCTTAAAATGT                 CACT TCG AGTG                 TTTTATTTTGTAGCG  79 141
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 INR75_17630 3992983 .. 3993005 +  -2.7  -4.15453   TTTAATTTAGTAAAA           CCTAAGCTA CTAGA TACCTTGGG           TTTTAACCTCGATTG  53 205
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 INR75_17645 3995561 .. 3995571 +    -4  -2.72463   AAATTGAAAAGGAGT                 GATT TTT AATC                 TAGTTAAGCATGAAT  46 24
 INR75_17650 3996172 .. 3996189 +  -4.3  -3.57263   CCCATAAGGCATTCG             TTAAAAA TAAT TTTTTAA              TTTCAAGGTAAGCCT  53 56
 INR75_17655 3997124 .. 3997144 +  -3.9  -3.54256   CAGGATCATATTCTT            TCAGATCGC TAG GCGATACGA            TATATTTTTCGCCAT  51 283
 INR75_17670 4000362 .. 4000378 +  -4.4  -5.93252   AGTAAAAAACAAAAA              GGGTAG ATTGA TTACCC              TTTTTTGTTTTTAGA  89 46
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 INR75_17695 4007285 .. 4007343 + -12.1  -4.71307   CAAAATAACCAATTT TTATTACACCGAAATTCGATAAAAATA AAGTC TGTTTTTATCGAATCTCGGTGTATTGC TTTGTTTAATTTTTC 100 33
 INR75_17700 4009361 .. 4009379 +  -5.4  -3.98173   GCATCGATTTTCTGG             TTTGTTTT TGG AAAACAGA             TTTAATTGAATTTGA  63 96
 INR75_17710 4012246 .. 4012264 +  -7.4  -5.89947   ATTTGATTTAAGAAA             GGAGTGCT TTT GGTACTCC             TTTTTTTTAAATTTG  95 43
 INR75_17715 4013542 .. 4013583 +  -8.2  -2.79831   TGATATTCACAAGCG TAGCTGGAAAATAGATTG TAGTAC CGATCTATTTTCCGGTAA  ATCTTTTACGATGCC  68 400
 INR75_17745 4017485 .. 4017500 +  -7.6  -2.54098   TCCTAATTCAAGATG              TGTGTC TGTG GACACA               ATCTTGGTTGCGCCC  65 146
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 INR75_17770 4022648 .. 4022662 +  -3.5   -4.1648   GCTCCATAAAATGAT               CGGGA TGTGC TCCTG               TTCTTTCATTATTAT  57 81
 INR75_17780 4024800 .. 4024816 +  -5.2  -4.88067   TTTTTTTCTTTGATT              TATTGG TTTAT CCAATA              TTTTTGTAGCTGAAT  74 165
        yaiO NONE
 INR75_17790 4027422 .. 4027434 +  -3.4  -4.28111   TTAAATCCATTATAA                GCAT CCATA ATGC                TTTGTTGCTGCTCTG  60 110
 INR75_17820 4033384 .. 4033406 +  -2.6   -4.7373   AAACTTTGGCTGAGA           GCTAATAGCT GAC AGCTGAGAGC           TTTTTCATCAACTAC  62 97
 INR75_17900 4049926 .. 4049942 +    -8  -3.76885   ATATTGTTAAATAAC              TCAGGG CCAAC CCCTGA              TCTGTTTTTTTGAAA  74 372
 INR75_17910 4052727 .. 4052748 + -13.1  -4.19648   TTAGCCAAAAGAAAA           GCCTGAAGT TGAA ACTTCAGGC            TTTCGTTTATCTATA 100 81
 INR75_17920 4056149 .. 4056178 + -12.3  -4.53303   GAAAAAATAAGACAT       AAAAAAAGCTGCC AAAA GGCAGCTTTTTTA        TTTTATATAGAACTA 100 196
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 INR75_17945 4059496 .. 4059506 +  -6.8   -5.1356   TTTATCTCGATTATC                 GAGC AAA GCTC                 TTTTTATTCATCCAA  83 71
 INR75_17960 4061028 .. 4061045 +  -9.9  -5.74122   AAACGAATAAAAAAA             GCTACCA AAAT TGGTAGC              TTTTTTTATATAATA 100 54
        fahA 4063776 .. 4063794 + -10.3  -6.14618   TAGGTCATAAAAAAA             GCTGCCA GATCA TGGCAGC             TTTTTTTATTTTATC 100 54
        clpB 4067339 .. 4067373 +   -16  -3.20723   AGAAAAAATAAGCAC     TAAAAAAGGGACTGTA AAT TACAGTCCCTTTCTTA     TTACCTTCATAAAGC 100 49
 INR75_18000 4069576 .. 4069597 + -10.2  -4.82901   GTGCCAATGCAAAAA           GCCGTGAA AACTAA TTCACGGC            TTTTTCTCCAACCAA 100 139
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 INR75_18015 4073179 .. 4073190 +  -5.8  -2.54276   TTCATCTTCATAATC                GGTG CCGC CACC                 ATCTTGATTAAAACT  53 333
        smpB 4074341 .. 4074366 + -12.1  -3.33151   AGACCGCATAAAAAA         GGAGTATAATT AAAA AATTATACTCC          TCTTCATTTGGAAAA  95 13
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 INR75_18060 4079700 .. 4079711 +    -3  -4.04806   TTTTTTCCTTAAAAA                TTTC TCCT GAAA                 TTCTTTGGTGTAGCC  55 123
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 INR75_18120 4091543 .. 4091557 +  -2.8  -3.63141   GTTATTGAAAAAAAG               GGATTT ATA AAAACC               TTAGTTTCATTAATT  48 16
        uvrB 4093740 .. 4093777 +    -3  -4.59984   ACCCCGAAACCCTTA  GTTTTC-TAAGCAATCTA AAAC TAGAT-GCCTATGAAAAC   TTTTATCTCAATTTT  62 123
 INR75_18130 4095098 .. 4095117 +  -8.6  -6.34616   GTGCCAATAAAAAAA            GCTGAATC TTAC GATTCGGC             TTTTTTTTATTTTCG 100 127
 INR75_18175 4103830 .. 4103862 + -11.4  -4.23892   ATTTTTTAATGGATA      CGAAAAAAGCCGGC TAATC GCCGGCTTTTTTTA      TTTTCAATAATTACA 100 44
 INR75_18195 4107255 .. 4107273 + -13.2  -5.30155   AAAATCATAGAAAAA             TGCGCTGA TCT TCAGCGCA             TTTTTTGCTTCATAA 100 50
 INR75_18200 4109623 .. 4109636 +  -3.9  -5.33848   CTTCTTTCATTAATT               CAAAT CTCA ATTTG                TTTTTTGCTTCTCCT  76 305
 INR75_18210 4111286 .. 4111317 + -10.4  -3.22448   CTTAATTCTCCTCTT      TTTAACTGAAAACC AGTA GATTTTCAGTTAAA       TTAAGTTGACTTTAG  83 263
 INR75_18215 4111899 .. 4111911 +  -4.8   -3.1364   CGTACAAAAGAAAAA                GGGA CAGAC TCCC                TTAAATAATTAACTA  52 5
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 INR75_18225 4114511 .. 4114525 +  -2.9  -4.78107   CACCTGTCTGTGATA               CTTAT TTAGC ATAAG               TTTTTACTCCTGCTG  62 127
 INR75_18245 4118353 .. 4118363 +  -3.2  -4.22652   ATAAAAGCACGCAAA                 GTGA TGA TCGC                 TTTTAAGTGATGTCC  60 259
 INR75_18255 4119539 .. 4119554 +  -4.6  -4.62302   AGAAACTATAATAAA              GGCGGT AAAA GTCGCC               TTTTTCGAAATATTC  68 499
        purU 4124342 .. 4124370 + -14.7  -4.50058   GATCATCTTTACATA        AAAAAAGCGCCCA ATT TGGGCGCTTTTTA        TTTTCATTCTGGATC 100 25
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 INR75_18285 4127280 .. 4127303 +  -9.6  -5.08255   ATTGTTCCCTATTCA          TTGCCGGATA TCGA TTTCCGGCAA           TTTTATTTTCGAACT  91 226
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 INR75_18325 4136625 .. 4136644 + -11.4  -5.18357   ATCAATCTTAGATTA            GGCGCTTC ATAT GAGGCGCC             TTTTTTAATGGATTC 100 59
 INR75_18335 4139007 .. 4139020 +  -3.9  -5.69379   TTTTTACTATGAATA               TAGTT TAAC AACTA                TTTTTTTCGTTATAT  85 43
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 INR75_18345 4140728 .. 4140738 +  -2.6  -5.19998   TAAAATCCTCTGCAT                 TAAT CGG ATTA                 TTTTATTTTGCTTAT  69 79
 INR75_18350 4142985 .. 4142999 +  -5.8  -4.46493   AAATAGCTTCTTTTT               TATTGA AAG TCAATA               TTTTAATATATTTGA  71 143
 INR75_18355 4143418 .. 4143428 +  -2.6   -4.4874   GTTGTCATAGGTGTA                 TTTT ATA AAAA                 TTTTGGATTTTTGAA  58 261
 INR75_18360 4145300 .. 4145311 +  -4.4  -3.66666   CGATGTACATTTTCT                GTTG TTAT CAAC                 TTTGAAGCTTTTGAG  55 503
 INR75_18380 4155377 .. 4155423 + -14.8  -3.88603   GAGCTTATTCTTGAA AATGAATAAAAAAAGTCCTGCA AAA TGCAGGACTTTTTTTATTTAGC TTAGTTTTTATGAAT 100 17
 INR75_18385 4156430 .. 4156440 +  -2.6  -5.93809   AATGGGAATGCCCTT                 TTAA ATA TTAA                 TTTTTTTTATGCAGA  85 15
 INR75_18390 4157243 .. 4157255 +  -6.3  -2.60714   TAGGTTAGATTTGGT                TTGGT TTC ACCAA                GTTATAACACTTTAA  57 232
 INR75_18395 4158147 .. 4158178 + -11.1  -5.65177   TAAATTGATCATAAA      TCCCTGTTATTGA AATTAG TTAATAACAGGGA       TTTTTTTATAACTAT 100 56
 INR75_18405 4160171 .. 4160191 + -15.5  -4.46212   ATAATTTAATACAAA            GGCCGTATC AAT GATACGGCC            TTTTCTACTAACACA 100 52
 INR75_18425 4166232 .. 4166268 + -12.5  -3.50555   TTATTAGAATACTCA    AAATAAAAAACCCTGCA ACT TGCAGGGTTTTTTATCA    TTCGTCTTCTTTAAA 100 89
 INR75_18440 4170422 .. 4170435 +  -3.8  -4.00756   TCAAACTGAACTTTA               CGTG TAGTAT CACG                TTCTTTGATCCAATC  56 250
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 INR75_18475 4185531 .. 4185544 +  -3.8  -3.65351   AAAATCATTGTAACG               CCCT ATGCTA AGGG                TTTGAATAACAGTGA  52 370
         ssb 4205824 .. 4205850 + -10.3  -4.45117   TACTACCAAAAACAA        CAAGGACG-GAA CCCC TTCGCGTCCTTG         TTTCTTTGAGATCTC 100 41
 INR75_18535 4206459 .. 4206495 + -16.2  -2.79139   ACTTAATTACTTATA   TACATAAAAGGGAGCTC GGTT GAGCTCCCTTTT-TGTA    TCATTCCGGTTTTGT 100 42
 INR75_18545 4208577 .. 4208587 +  -5.4  -4.73864   CAATCTTGAGATAAC                 GCAT ACG ATGC                 TTTTCTATTAGTTGA  74 288
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 INR75_18560 4211980 .. 4211992 +  -5.5  -3.57263   TTAAGACAAGTCTTG                GGGTA TAA TGCCC                TTTGGCGGTGCCAAT  62 398
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 INR75_18570 4214263 .. 4214280 +  -9.9  -3.08798   AAATTCTAAAAAAAA             GCAGGTA TTTC TACCTGC              TCTTCACTCAACAAT  78 498
 INR75_18595 4221330 .. 4221382 +  -3.7  -2.74886   AACTTAAAAGAAATT CTGAGAAAAATACTGACTATAGA AAATGAA TTTATTTACAGTATTTTTCTTAG TGATCTATCTACTTT  45 50
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        folP 4274241 .. 4274260 +  -2.2  -3.94812   TAGTATCGCATTTCA            GCAAATAA TCTT TTATTTTC             TATTTTTACATAAAA  51 18
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         rho 4281833 .. 4281850 +  -8.4   -5.4833   TTCATTATATCAAAA             GCGGCT TTTTAT AGCCGC              TTTTTTATTAACTCA  95 55
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        ubiE 4320050 .. 4320070 +  -2.6  -3.25714   ATTATCAAGGTAATT            GTATGAAA CGATA TTTCTTAC            TATTCATCATTTTAT  45 40
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